RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469068.1

FGFR3-206, Transcript of fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

TSL 3

Gene FGFR3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3-206ENST00000469068 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.53■■□□□ 1.68
FGFR3-206ENST00000469068 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
FGFR3-206ENST00000469068 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
FGFR3-206ENST00000469068 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.53■■□□□ 1.68
FGFR3-206ENST00000469068 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
FGFR3-206ENST00000469068 CLIP1P30622 1438 aa25.52■■□□□ 1.68
FGFR3-206ENST00000469068 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.51■■□□□ 1.67
FGFR3-206ENST00000469068 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.47■■□□□ 1.67
FGFR3-206ENST00000469068 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FGFR3-206ENST00000469068 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.46■■□□□ 1.67
FGFR3-206ENST00000469068 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.46■■□□□ 1.67
FGFR3-206ENST00000469068 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.46■■□□□ 1.67
FGFR3-206ENST00000469068 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.41■■□□□ 1.66
FGFR3-206ENST00000469068 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.41■■□□□ 1.66
FGFR3-206ENST00000469068 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.4■■□□□ 1.66
FGFR3-206ENST00000469068 PREX2Q70Z35 1606 aa25.4■■□□□ 1.66
FGFR3-206ENST00000469068 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.39■■□□□ 1.66
FGFR3-206ENST00000469068 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.39■■□□□ 1.65
FGFR3-206ENST00000469068 KDM5CP41229 1560 aa25.39■■□□□ 1.65
FGFR3-206ENST00000469068 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.38■■□□□ 1.65
FGFR3-206ENST00000469068 ATP10AO60312 1499 aa25.38■■□□□ 1.65
FGFR3-206ENST00000469068 MLECQ14165 292 aa25.36■■□□□ 1.65
FGFR3-206ENST00000469068 ABCC1P33527 1531 aa25.33■■□□□ 1.65
FGFR3-206ENST00000469068 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.33■■□□□ 1.65
FGFR3-206ENST00000469068 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
FGFR3-206ENST00000469068 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.31■■□□□ 1.64
FGFR3-206ENST00000469068 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.3■■□□□ 1.64
FGFR3-206ENST00000469068 CEP162Q5TB80 1403 aa25.29■■□□□ 1.64
FGFR3-206ENST00000469068 AFAP1Q8N556 730 aa25.29■■□□□ 1.64
FGFR3-206ENST00000469068 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.29■■□□□ 1.64
FGFR3-206ENST00000469068 ABCA6Q8N139 1617 aa25.28■■□□□ 1.64
FGFR3-206ENST00000469068 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.27■■□□□ 1.64
FGFR3-206ENST00000469068 REREQ9P2R6 1566 aa25.26■■□□□ 1.63
FGFR3-206ENST00000469068 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.24■■□□□ 1.63
FGFR3-206ENST00000469068 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.24■■□□□ 1.63
FGFR3-206ENST00000469068 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.23■■□□□ 1.63
FGFR3-206ENST00000469068 HSPA2P54652 639 aa25.2■■□□□ 1.62
FGFR3-206ENST00000469068 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.19■■□□□ 1.62
FGFR3-206ENST00000469068 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.18■■□□□ 1.62
FGFR3-206ENST00000469068 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.17■■□□□ 1.62
FGFR3-206ENST00000469068 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.16■■□□□ 1.62
FGFR3-206ENST00000469068 AGLP35573 1532 aa25.15■■□□□ 1.62
FGFR3-206ENST00000469068 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
FGFR3-206ENST00000469068 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
FGFR3-206ENST00000469068 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.13■■□□□ 1.61
FGFR3-206ENST00000469068 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
FGFR3-206ENST00000469068 FBXO41Q8TF61 875 aa25.11■■□□□ 1.61
FGFR3-206ENST00000469068 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.08■■□□□ 1.61
FGFR3-206ENST00000469068 C3P01024 1663 aa25.08■■□□□ 1.61
FGFR3-206ENST00000469068 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.07■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.07■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.06■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 ATP7AQ04656 1500 aa25.05■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 TIAM1Q13009 1591 aa25.04■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.03■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
FGFR3-206ENST00000469068 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
FGFR3-206ENST00000469068 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.01■■□□□ 1.59
FGFR3-206ENST00000469068 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
FGFR3-206ENST00000469068 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.99■■□□□ 1.59
FGFR3-206ENST00000469068 PLXNC1O60486 1568 aa24.98■■□□□ 1.59
FGFR3-206ENST00000469068 MROH2AA6NES4 1674 aa24.97■■□□□ 1.59
FGFR3-206ENST00000469068 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
FGFR3-206ENST00000469068 STRCQ7RTU9 1775 aa24.95■■□□□ 1.59
FGFR3-206ENST00000469068 A2MP01023 1474 aa24.95■■□□□ 1.58
FGFR3-206ENST00000469068 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.92■■□□□ 1.58
FGFR3-206ENST00000469068 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
FGFR3-206ENST00000469068 NCOA2Q15596 1464 aa24.9■■□□□ 1.58
FGFR3-206ENST00000469068 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
FGFR3-206ENST00000469068 MBD5Q9P267 1494 aa24.88■■□□□ 1.57
FGFR3-206ENST00000469068 NPATQ14207 1427 aa24.87■■□□□ 1.57
FGFR3-206ENST00000469068 CERKQ8TCT0 537 aa24.87■■□□□ 1.57
FGFR3-206ENST00000469068 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.87■■□□□ 1.57
FGFR3-206ENST00000469068 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.85■■□□□ 1.57
FGFR3-206ENST00000469068 ZMYM3Q14202 1370 aa24.84■■□□□ 1.57
FGFR3-206ENST00000469068 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.83■■□□□ 1.57
FGFR3-206ENST00000469068 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.83■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.82■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.81■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 NCOA1Q15788 1441 aa24.81■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 PTPRTO14522 1441 aa24.8■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 GGT6Q6P531 493 aa24.8■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.79■■□□□ 1.56
FGFR3-206ENST00000469068 MAP3K1Q13233 1512 aa24.76■■□□□ 1.55
FGFR3-206ENST00000469068 PTPRKQ15262 1439 aa24.76■■□□□ 1.55
FGFR3-206ENST00000469068 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FGFR3-206ENST00000469068 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FGFR3-206ENST00000469068 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.73■■□□□ 1.55
FGFR3-206ENST00000469068 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.72■■□□□ 1.55
FGFR3-206ENST00000469068 APLP2Q06481 763 aa24.69■■□□□ 1.54
FGFR3-206ENST00000469068 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.69■■□□□ 1.54
FGFR3-206ENST00000469068 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.68■■□□□ 1.54
FGFR3-206ENST00000469068 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.68■■□□□ 1.54
FGFR3-206ENST00000469068 PLA2R1Q13018 1463 aa24.68■■□□□ 1.54
FGFR3-206ENST00000469068 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms