RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.78■■□□□ 1.4
CENPF-202ENST00000464322 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.76■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.75■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.74■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.74■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 PLCH2O75038 1416 aa23.72■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 HECW1Q76N89 1606 aa23.72■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CENPF-202ENST00000464322 ATP10AO60312 1499 aa23.69■■□□□ 1.38
CENPF-202ENST00000464322 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.67■■□□□ 1.38
CENPF-202ENST00000464322 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.66■■□□□ 1.38
CENPF-202ENST00000464322 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.66■■□□□ 1.38
CENPF-202ENST00000464322 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.66■■□□□ 1.38
CENPF-202ENST00000464322 AFAP1Q8N556 730 aa23.64■■□□□ 1.37
CENPF-202ENST00000464322 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CENPF-202ENST00000464322 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.6■■□□□ 1.37
CENPF-202ENST00000464322 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.59■■□□□ 1.37
CENPF-202ENST00000464322 FMN1Q68DA7 1419 aa23.59■■□□□ 1.37
CENPF-202ENST00000464322 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.57■■□□□ 1.36
CENPF-202ENST00000464322 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.55■■□□□ 1.36
CENPF-202ENST00000464322 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.54■■□□□ 1.36
CENPF-202ENST00000464322 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.53■■□□□ 1.36
CENPF-202ENST00000464322 CLIP1P30622 1438 aa23.52■■□□□ 1.36
CENPF-202ENST00000464322 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.52■■□□□ 1.36
CENPF-202ENST00000464322 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CENPF-202ENST00000464322 ILDR2Q71H61 639 aa23.5■■□□□ 1.35
CENPF-202ENST00000464322 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CENPF-202ENST00000464322 KIF14Q15058 1648 aa23.48■■□□□ 1.35
CENPF-202ENST00000464322 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.46■■□□□ 1.35
CENPF-202ENST00000464322 SOCS7O14512 581 aa23.44■■□□□ 1.34
CENPF-202ENST00000464322 STRCQ7RTU9 1775 aa23.42■■□□□ 1.34
CENPF-202ENST00000464322 KDM5CP41229 1560 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPF-202ENST00000464322 PTPRTO14522 1441 aa23.41■■□□□ 1.34
CENPF-202ENST00000464322 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CENPF-202ENST00000464322 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPF-202ENST00000464322 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.4■■□□□ 1.34
CENPF-202ENST00000464322 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.39■■□□□ 1.34
CENPF-202ENST00000464322 FOXD1Q16676 465 aa23.35■■□□□ 1.33
CENPF-202ENST00000464322 C3P01024 1663 aa23.33■■□□□ 1.33
CENPF-202ENST00000464322 ABCA6Q8N139 1617 aa23.33■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.33■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 REREQ9P2R6 1566 aa23.32■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 AGLP35573 1532 aa23.32■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.3■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 NCOA1Q15788 1441 aa23.29■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.29■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 ABCC1P33527 1531 aa23.28■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 ZMYM3Q14202 1370 aa23.27■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
CENPF-202ENST00000464322 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.26■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.26■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.26■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 PREX2Q70Z35 1606 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.25■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 GGT6Q6P531 493 aa23.23■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 NPATQ14207 1427 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.22■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CENPF-202ENST00000464322 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.2■■□□□ 1.3
CENPF-202ENST00000464322 PKD2Q13563 968 aa23.19■■□□□ 1.3
CENPF-202ENST00000464322 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.17■■□□□ 1.3
CENPF-202ENST00000464322 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.14■■□□□ 1.3
CENPF-202ENST00000464322 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.13■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.13■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.12■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 A2MP01023 1474 aa23.11■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.1■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 MROH2AA6NES4 1674 aa23.09■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.09■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.08■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 ATP7AQ04656 1500 aa23.08■■□□□ 1.29
CENPF-202ENST00000464322 PTPRKQ15262 1439 aa23.08■■□□□ 1.28
CENPF-202ENST00000464322 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CENPF-202ENST00000464322 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.06■■□□□ 1.28
CENPF-202ENST00000464322 PIP4K2BP78356 416 aa23.06■■□□□ 1.28
CENPF-202ENST00000464322 PLA2R1Q13018 1463 aa23.05■■□□□ 1.28
CENPF-202ENST00000464322 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CENPF-202ENST00000464322 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CENPF-202ENST00000464322 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 TOM1O60784 492 aa23■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 HSPA1LP34931 641 aa23■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 KIF3BO15066 747 aa22.98■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 PLXNC1O60486 1568 aa22.97■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.97■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CENPF-202ENST00000464322 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms