RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.35□□□□□ -0.43
RABGGTB-204ENST00000461653 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-204ENST00000461653 MARVELD3Q96A59 401 aa12.33□□□□□ -0.44
RABGGTB-204ENST00000461653 C2orf72A6NCS6 295 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-204ENST00000461653 KIF3CO14782 793 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGGTB-204ENST00000461653 RIMBP2O15034 1052 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGGTB-204ENST00000461653 EMP3P54852 163 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGGTB-204ENST00000461653 TMC2Q8TDI7 906 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGGTB-204ENST00000461653 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGGTB-204ENST00000461653 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGGTB-204ENST00000461653 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM205CA6NFA0 338 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR153Q6NV75 609 aa12.19□□□□□ -0.46
RABGGTB-204ENST00000461653 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGGTB-204ENST00000461653 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
RABGGTB-204ENST00000461653 ARSIQ5FYB1 569 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGGTB-204ENST00000461653 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
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RABGGTB-204ENST00000461653 POTEBQ6S5H4 581 aa12.15□□□□□ -0.46
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RABGGTB-204ENST00000461653 FOXK1P85037 733 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGGTB-204ENST00000461653 ERBB3P21860 1342 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC34A2O95436 690 aa12.13□□□□□ -0.47
RABGGTB-204ENST00000461653 DSG2Q14126 1118 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGGTB-204ENST00000461653 PLPP6Q8IY26 295 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGGTB-204ENST00000461653 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.471e-9■■■□□ 14.8
RABGGTB-204ENST00000461653 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.09□□□□□ -0.47
RABGGTB-204ENST00000461653 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 PDE4AP27815 886 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT7P0C024 238 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGGTB-204ENST00000461653 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 LHX6Q9UPM6 363 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 TBC1D12O60347 775 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 MFSD10Q14728 455 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 CFAP44Q96MT7 982 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGGTB-204ENST00000461653 OXER1Q8TDS5 423 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-204ENST00000461653 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGGTB-204ENST00000461653 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-204ENST00000461653 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MMRN1Q13201 1228 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGGTB-204ENST00000461653 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.84□□□□□ -0.51
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RABGGTB-204ENST00000461653 MAP3K9P80192 1104 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 EVI5O60447 810 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 CAMK2BQ13554 666 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGAP33O14559 1287 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-204ENST00000461653 FOSBP53539 338 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-204ENST00000461653 DPYSL4O14531 572 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-204ENST00000461653 JPH4Q96JJ6 628 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PTGER2P43116 358 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PSEN2P49810 448 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR70Q9NW82 654 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNK17Q96T54 332 aa11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNH8Q96L42 1107 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 E2F4Q16254 413 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGGTB-204ENST00000461653 TK2O00142 265 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PTPREP23469 700 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PHF14O94880 888 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PDIA6Q15084 440 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 PLCB2Q00722 1185 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXW7Q969H0 707 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX12PQ92771 950 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 HRO43593 1189 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 EPAS1Q99814 870 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-204ENST00000461653 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.57□□□□□ -0.56
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