RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460900.1

CRIP1-204, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CRIP1, Length 1,443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-204ENST00000460900 PREX2Q70Z35 1606 aa36.17■■■■□ 3.38
CRIP1-204ENST00000460900 RICTORQ6R327 1708 aa36.16■■■■□ 3.38
CRIP1-204ENST00000460900 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.15■■■■□ 3.38
CRIP1-204ENST00000460900 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
CRIP1-204ENST00000460900 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.13■■■■□ 3.38
CRIP1-204ENST00000460900 TIAM1Q13009 1591 aa36.12■■■■□ 3.37
CRIP1-204ENST00000460900 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.09■■■■□ 3.37
CRIP1-204ENST00000460900 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
CRIP1-204ENST00000460900 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.07■■■■□ 3.37
CRIP1-204ENST00000460900 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.06■■■■□ 3.36
CRIP1-204ENST00000460900 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
CRIP1-204ENST00000460900 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.03■■■■□ 3.36
CRIP1-204ENST00000460900 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
CRIP1-204ENST00000460900 MAP3K1Q13233 1512 aa36.01■■■■□ 3.36
CRIP1-204ENST00000460900 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.99■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 APLP2Q06481 763 aa35.99■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.98■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.98■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 ABCC1P33527 1531 aa35.97■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 AFAP1Q8N556 730 aa35.96■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.96■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 NCOA2Q15596 1464 aa35.95■■■■□ 3.35
CRIP1-204ENST00000460900 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.94■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.92■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.92■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.92■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.91■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 KDM5CP41229 1560 aa35.89■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.89■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.89■■■■□ 3.34
CRIP1-204ENST00000460900 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
CRIP1-204ENST00000460900 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.86■■■■□ 3.33
CRIP1-204ENST00000460900 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
CRIP1-204ENST00000460900 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.84■■■■□ 3.33
CRIP1-204ENST00000460900 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.83■■■■□ 3.33
CRIP1-204ENST00000460900 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.81■■■■□ 3.32
CRIP1-204ENST00000460900 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CRIP1-204ENST00000460900 ATP10AO60312 1499 aa35.79■■■■□ 3.32
CRIP1-204ENST00000460900 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.79■■■■□ 3.32
CRIP1-204ENST00000460900 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.74■■■■□ 3.31
CRIP1-204ENST00000460900 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
CRIP1-204ENST00000460900 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.71■■■■□ 3.31
CRIP1-204ENST00000460900 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.69■■■■□ 3.3
CRIP1-204ENST00000460900 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.68■■■■□ 3.3
CRIP1-204ENST00000460900 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.67■■■■□ 3.3
CRIP1-204ENST00000460900 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.67■■■■□ 3.3
CRIP1-204ENST00000460900 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.67■■■■□ 3.3
CRIP1-204ENST00000460900 ABCA6Q8N139 1617 aa35.66■■■■□ 3.3
CRIP1-204ENST00000460900 MBD5Q9P267 1494 aa35.66■■■■□ 3.3
CRIP1-204ENST00000460900 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.65■■■■□ 3.3
CRIP1-204ENST00000460900 MLECQ14165 292 aa35.61■■■■□ 3.29
CRIP1-204ENST00000460900 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.61■■■■□ 3.29
CRIP1-204ENST00000460900 MIA2Q96PC5 1412 aa35.6■■■■□ 3.29
CRIP1-204ENST00000460900 ATP7AQ04656 1500 aa35.59■■■■□ 3.29
CRIP1-204ENST00000460900 REREQ9P2R6 1566 aa35.59■■■■□ 3.29
CRIP1-204ENST00000460900 MADDQ8WXG6 1647 aa35.57■■■■□ 3.28
CRIP1-204ENST00000460900 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CRIP1-204ENST00000460900 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.55■■■■□ 3.28
CRIP1-204ENST00000460900 PTPRMP28827 1452 aa35.52■■■■□ 3.28
CRIP1-204ENST00000460900 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.51■■■■□ 3.27
CRIP1-204ENST00000460900 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.5■■■■□ 3.27
CRIP1-204ENST00000460900 AGLP35573 1532 aa35.5■■■■□ 3.27
CRIP1-204ENST00000460900 TSPY4P0CV99 314 aa35.49■■■■□ 3.27
CRIP1-204ENST00000460900 TSPY10P0CW01 314 aa35.49■■■■□ 3.27
CRIP1-204ENST00000460900 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CRIP1-204ENST00000460900 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.44■■■■□ 3.26
CRIP1-204ENST00000460900 A2MP01023 1474 aa35.44■■■■□ 3.26
CRIP1-204ENST00000460900 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.42■■■■□ 3.26
CRIP1-204ENST00000460900 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.42■■■■□ 3.26
CRIP1-204ENST00000460900 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.42■■■■□ 3.26
CRIP1-204ENST00000460900 PLXNC1O60486 1568 aa35.37■■■■□ 3.25
CRIP1-204ENST00000460900 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.35■■■■□ 3.25
CRIP1-204ENST00000460900 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
CRIP1-204ENST00000460900 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CRIP1-204ENST00000460900 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CRIP1-204ENST00000460900 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.31■■■■□ 3.24
CRIP1-204ENST00000460900 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CRIP1-204ENST00000460900 ABCC5O15440 1437 aa35.26■■■■□ 3.24
CRIP1-204ENST00000460900 GGT6Q6P531 493 aa35.26■■■■□ 3.24
CRIP1-204ENST00000460900 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CRIP1-204ENST00000460900 DAPK1P53355 1430 aa35.23■■■■□ 3.23
CRIP1-204ENST00000460900 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CRIP1-204ENST00000460900 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CRIP1-204ENST00000460900 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.22■■■■□ 3.23
CRIP1-204ENST00000460900 KIF3BO15066 747 aa35.21■■■■□ 3.23
CRIP1-204ENST00000460900 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.21■■■■□ 3.23
CRIP1-204ENST00000460900 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.2■■■■□ 3.23
CRIP1-204ENST00000460900 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.17■■■■□ 3.22
CRIP1-204ENST00000460900 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.12■■■■□ 3.21
CRIP1-204ENST00000460900 C3P01024 1663 aa35.12■■■■□ 3.21
CRIP1-204ENST00000460900 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.1■■■■□ 3.21
CRIP1-204ENST00000460900 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
CRIP1-204ENST00000460900 KIF15Q9NS87 1388 aa35.09■■■■□ 3.21
CRIP1-204ENST00000460900 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.09■■■■□ 3.21
CRIP1-204ENST00000460900 MROH2AA6NES4 1674 aa35.09■■■■□ 3.21
CRIP1-204ENST00000460900 ZMYM3Q14202 1370 aa35.09■■■■□ 3.21
CRIP1-204ENST00000460900 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.07■■■■□ 3.2
CRIP1-204ENST00000460900 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms