RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460211.5

ATG4B-213, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-213ENST00000460211 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.86■■□□□ 1.41
ATG4B-213ENST00000460211 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.86■■□□□ 1.41
ATG4B-213ENST00000460211 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.86■■□□□ 1.41
ATG4B-213ENST00000460211 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.86■■□□□ 1.41
ATG4B-213ENST00000460211 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
ATG4B-213ENST00000460211 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.81■■□□□ 1.4
ATG4B-213ENST00000460211 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.79■■□□□ 1.4
ATG4B-213ENST00000460211 HSPA2P54652 639 aa23.79■■□□□ 1.4
ATG4B-213ENST00000460211 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.79■■□□□ 1.4
ATG4B-213ENST00000460211 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4B-213ENST00000460211 MLECQ14165 292 aa23.77■■□□□ 1.4
ATG4B-213ENST00000460211 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.76■■□□□ 1.39
ATG4B-213ENST00000460211 PLCH2O75038 1416 aa23.74■■□□□ 1.39
ATG4B-213ENST00000460211 KIF14Q15058 1648 aa23.73■■□□□ 1.39
ATG4B-213ENST00000460211 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.72■■□□□ 1.39
ATG4B-213ENST00000460211 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.71■■□□□ 1.39
ATG4B-213ENST00000460211 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.71■■□□□ 1.39
ATG4B-213ENST00000460211 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.71■■□□□ 1.39
ATG4B-213ENST00000460211 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.68■■□□□ 1.38
ATG4B-213ENST00000460211 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.66■■□□□ 1.38
ATG4B-213ENST00000460211 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.65■■□□□ 1.38
ATG4B-213ENST00000460211 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.64■■□□□ 1.38
ATG4B-213ENST00000460211 ATP10AO60312 1499 aa23.61■■□□□ 1.37
ATG4B-213ENST00000460211 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG4B-213ENST00000460211 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-213ENST00000460211 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-213ENST00000460211 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 CERKQ8TCT0 537 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 APLP2Q06481 763 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.53■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 AFAP1Q8N556 730 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-213ENST00000460211 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-213ENST00000460211 PREX2Q70Z35 1606 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-213ENST00000460211 KDM5CP41229 1560 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-213ENST00000460211 TIAM1Q13009 1591 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-213ENST00000460211 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-213ENST00000460211 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4B-213ENST00000460211 MAP3K1Q13233 1512 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 STRCQ7RTU9 1775 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 ABCA6Q8N139 1617 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 ABCC1P33527 1531 aa23.39■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 C3P01024 1663 aa23.39■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 NCOA2Q15596 1464 aa23.39■■□□□ 1.34
ATG4B-213ENST00000460211 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 REREQ9P2R6 1566 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4B-213ENST00000460211 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.32■■□□□ 1.32
ATG4B-213ENST00000460211 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ATG4B-213ENST00000460211 AGLP35573 1532 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-213ENST00000460211 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-213ENST00000460211 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-213ENST00000460211 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-213ENST00000460211 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.27■■□□□ 1.31
ATG4B-213ENST00000460211 PTPRTO14522 1441 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-213ENST00000460211 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG4B-213ENST00000460211 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.22■■□□□ 1.31
ATG4B-213ENST00000460211 ILDR2Q71H61 639 aa23.21■■□□□ 1.31
ATG4B-213ENST00000460211 MIA2Q96PC5 1412 aa23.21■■□□□ 1.31
ATG4B-213ENST00000460211 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.21■■□□□ 1.31
ATG4B-213ENST00000460211 MBD5Q9P267 1494 aa23.21■■□□□ 1.31
ATG4B-213ENST00000460211 TSPY4P0CV99 314 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 TSPY10P0CW01 314 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 NCOA1Q15788 1441 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 MROH2AA6NES4 1674 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 ATP7AQ04656 1500 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 ZMYM3Q14202 1370 aa23.14■■□□□ 1.3
ATG4B-213ENST00000460211 NPATQ14207 1427 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-213ENST00000460211 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-213ENST00000460211 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-213ENST00000460211 A2MP01023 1474 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-213ENST00000460211 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-213ENST00000460211 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-213ENST00000460211 GGT6Q6P531 493 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-213ENST00000460211 PLXNC1O60486 1568 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-213ENST00000460211 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.08■■□□□ 1.28
ATG4B-213ENST00000460211 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms