RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.48□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BCORL1Q5H9F3 1711 aa12.48□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MADDQ8WXG6 1647 aa12.46□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa12.46□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLIP1P30622 1438 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 POGZQ7Z3K3 1410 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CFAP74Q9C0B2 1584 aa12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.44□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.43□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP10AO60312 1499 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.4□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HSPA2P54652 639 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PREX2Q70Z35 1606 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KDM5CP41229 1560 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCC1P33527 1531 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CEP162Q5TB80 1403 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCA6Q8N139 1617 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa12.32□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.3□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.29□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TIAM1Q13009 1591 aa12.25□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 REREQ9P2R6 1566 aa12.25□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AGLP35573 1532 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MBD5Q9P267 1494 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.24□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C3P01024 1663 aa12.22□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GGT6Q6P531 493 aa12.21□□□□□ -0.45
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP7AQ04656 1500 aa12.21□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.21□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NCOA2Q15596 1464 aa12.21□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FBXO41Q8TF61 875 aa12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZMYM3Q14202 1370 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 STRCQ7RTU9 1775 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 A2MP01023 1474 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PREX1Q8TCU6 1659 aa12.19□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.18□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLXNC1O60486 1568 aa12.17□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.16□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CERKQ8TCT0 537 aa12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIF3BO15066 747 aa12.13□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTPRKQ15262 1439 aa12.12□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.11□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MROH2AA6NES4 1674 aa12.1□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TSPY4P0CV99 314 aa12.09□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TSPY10P0CW01 314 aa12.09□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.09□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NPATQ14207 1427 aa12.09□□□□□ -0.47
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.08□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.08□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NCOA1Q15788 1441 aa12.08□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.07□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.07□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAP3K1Q13233 1512 aa12.06□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.06□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTPRTO14522 1441 aa12.05□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.05□□□□□ -0.48
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms