RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.67■■■□□ 2.66
CTU2-202ENST00000453996 AKNAQ7Z591 1439 aa31.66■■■□□ 2.66
CTU2-202ENST00000453996 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.65■■■□□ 2.66
CTU2-202ENST00000453996 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.64■■■□□ 2.66
CTU2-202ENST00000453996 ABCC5O15440 1437 aa31.63■■■□□ 2.65
CTU2-202ENST00000453996 NAIPQ13075 1403 aa31.63■■■□□ 2.65
CTU2-202ENST00000453996 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.63■■■□□ 2.65
CTU2-202ENST00000453996 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.63■■■□□ 2.65
CTU2-202ENST00000453996 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
CTU2-202ENST00000453996 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.57■■■□□ 2.64
CTU2-202ENST00000453996 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.57■■■□□ 2.64
CTU2-202ENST00000453996 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.57■■■□□ 2.64
CTU2-202ENST00000453996 ROCK1Q13464 1354 aa31.57■■■□□ 2.64
CTU2-202ENST00000453996 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.55■■■□□ 2.64
CTU2-202ENST00000453996 KCNH8Q96L42 1107 aa31.54■■■□□ 2.64
CTU2-202ENST00000453996 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.54■■■□□ 2.64
CTU2-202ENST00000453996 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.51■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.51■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.47■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 ASXL2Q76L83 1435 aa31.47■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 MAPKBP1O60336 1514 aa31.46■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 ADGRL2O95490 1459 aa31.46■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.45■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.45■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.45■■■□□ 2.63
CTU2-202ENST00000453996 PLCH2O75038 1416 aa31.45■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.44■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 KDM6BO15054 1643 aa31.43■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.43■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 MBD5Q9P267 1494 aa31.42■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.42■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.41■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.4■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.39■■■□□ 2.62
CTU2-202ENST00000453996 NCOA1Q15788 1441 aa31.38■■■□□ 2.61
CTU2-202ENST00000453996 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.38■■■□□ 2.61
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.36■■■□□ 2.61
CTU2-202ENST00000453996 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.35■■■□□ 2.61
CTU2-202ENST00000453996 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
CTU2-202ENST00000453996 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.33■■■□□ 2.61
CTU2-202ENST00000453996 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CTU2-202ENST00000453996 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.32■■■□□ 2.6
CTU2-202ENST00000453996 TSPY4P0CV99 314 aa31.31■■■□□ 2.6
CTU2-202ENST00000453996 TSPY10P0CW01 314 aa31.31■■■□□ 2.6
CTU2-202ENST00000453996 ABCC1P33527 1531 aa31.31■■■□□ 2.6
CTU2-202ENST00000453996 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.3■■■□□ 2.6
CTU2-202ENST00000453996 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.24■■■□□ 2.59
CTU2-202ENST00000453996 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.23■■■□□ 2.59
CTU2-202ENST00000453996 FANCAO15360 1455 aa31.21■■■□□ 2.59
CTU2-202ENST00000453996 TRIM52Q96A61 297 aa31.21■■■□□ 2.59
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.19■■■□□ 2.58
CTU2-202ENST00000453996 PLXNC1O60486 1568 aa31.19■■■□□ 2.58
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CTU2-202ENST00000453996 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.13■■■□□ 2.57
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CTU2-202ENST00000453996 CD109Q6YHK3 1445 aa31.09■■■□□ 2.57
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CTU2-202ENST00000453996 PZPP20742 1482 aa31.05■■■□□ 2.56
CTU2-202ENST00000453996 NEUROD1Q13562 356 aa31.03■■■□□ 2.56
CTU2-202ENST00000453996 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.02■■■□□ 2.56
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CTU2-202ENST00000453996 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.02■■■□□ 2.56
CTU2-202ENST00000453996 GLI2P10070 1586 aa31.01■■■□□ 2.55
CTU2-202ENST00000453996 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.01■■■□□ 2.55
CTU2-202ENST00000453996 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.01■■■□□ 2.55
CTU2-202ENST00000453996 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.01■■■□□ 2.55
CTU2-202ENST00000453996 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31■■■□□ 2.55
CTU2-202ENST00000453996 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
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CTU2-202ENST00000453996 UNC13BO14795 1591 aa30.96■■■□□ 2.55
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CTU2-202ENST00000453996 ERBINQ96RT1 1412 aa30.95■■■□□ 2.55
CTU2-202ENST00000453996 DIP2BQ9P265 1576 aa30.93■■■□□ 2.54
CTU2-202ENST00000453996 NEO1Q92859 1461 aa30.93■■■□□ 2.54
CTU2-202ENST00000453996 NUP155O75694 1391 aa30.93■■■□□ 2.54
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CTU2-202ENST00000453996 TONSLQ96HA7 1378 aa30.91■■■□□ 2.54
CTU2-202ENST00000453996 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.89■■■□□ 2.53
CTU2-202ENST00000453996 FOXD1Q16676 465 aa30.88■■■□□ 2.53
CTU2-202ENST00000453996 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.86■■■□□ 2.53
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CTU2-202ENST00000453996 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.84■■■□□ 2.53
CTU2-202ENST00000453996 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CTU2-202ENST00000453996 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.83■■■□□ 2.53
CTU2-202ENST00000453996 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.83■■■□□ 2.53
CTU2-202ENST00000453996 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.82■■■□□ 2.52
CTU2-202ENST00000453996 PKD2Q13563 968 aa30.81■■■□□ 2.52
CTU2-202ENST00000453996 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
CTU2-202ENST00000453996 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.78■■■□□ 2.52
CTU2-202ENST00000453996 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.77■■■□□ 2.52
CTU2-202ENST00000453996 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
CTU2-202ENST00000453996 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.77■■■□□ 2.52
CTU2-202ENST00000453996 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
CTU2-202ENST00000453996 DEPDC5O75140 1603 aa30.75■■■□□ 2.51
CTU2-202ENST00000453996 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.75■■■□□ 2.51
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