RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449228.5

BBC3-204, Transcript of BCL2 binding component 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BBC3, Length 1,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBC3-204ENST00000449228 KCNH8Q96L42 1107 aa36.85■■■■□ 3.49
BBC3-204ENST00000449228 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.85■■■■□ 3.495e-7■■■■□ 22.3
BBC3-204ENST00000449228 ABCC5O15440 1437 aa36.84■■■■□ 3.49
BBC3-204ENST00000449228 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.84■■■■□ 3.49
BBC3-204ENST00000449228 NAIPQ13075 1403 aa36.83■■■■□ 3.49
BBC3-204ENST00000449228 PREX2Q70Z35 1606 aa36.82■■■■□ 3.48
BBC3-204ENST00000449228 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.8■■■■□ 3.48
BBC3-204ENST00000449228 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.8■■■■□ 3.48
BBC3-204ENST00000449228 ROCK1Q13464 1354 aa36.78■■■■□ 3.48
BBC3-204ENST00000449228 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.77■■■■□ 3.48
BBC3-204ENST00000449228 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.75■■■■□ 3.47
BBC3-204ENST00000449228 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.75■■■■□ 3.47
BBC3-204ENST00000449228 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.73■■■■□ 3.47
BBC3-204ENST00000449228 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.73■■■■□ 3.47
BBC3-204ENST00000449228 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.71■■■■□ 3.47
BBC3-204ENST00000449228 ASXL2Q76L83 1435 aa36.67■■■■□ 3.46
BBC3-204ENST00000449228 PLCH2O75038 1416 aa36.66■■■■□ 3.46
BBC3-204ENST00000449228 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.66■■■■□ 3.46
BBC3-204ENST00000449228 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.65■■■■□ 3.46
BBC3-204ENST00000449228 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
BBC3-204ENST00000449228 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.64■■■■□ 3.46
BBC3-204ENST00000449228 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.63■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.62■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.61■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.61■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 TSPY4P0CV99 314 aa36.61■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 TSPY10P0CW01 314 aa36.61■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 ADGRL2O95490 1459 aa36.6■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.458e-7■□□□□ 11.2
BBC3-204ENST00000449228 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.59■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 MBD5Q9P267 1494 aa36.58■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.58■■■■□ 3.45
BBC3-204ENST00000449228 NCOA1Q15788 1441 aa36.57■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.56■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.55■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.55■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 MAPKBP1O60336 1514 aa36.55■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.54■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.53■■■■□ 3.44
BBC3-204ENST00000449228 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.51■■■■□ 3.43
BBC3-204ENST00000449228 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.5■■■■□ 3.43
BBC3-204ENST00000449228 KDM6BO15054 1643 aa36.47■■■■□ 3.43
BBC3-204ENST00000449228 TRIM52Q96A61 297 aa36.45■■■■□ 3.43
BBC3-204ENST00000449228 ABCC1P33527 1531 aa36.4■■■■□ 3.42
BBC3-204ENST00000449228 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.37■■■■□ 3.41
BBC3-204ENST00000449228 FANCAO15360 1455 aa36.36■■■■□ 3.41
BBC3-204ENST00000449228 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.36■■■■□ 3.41
BBC3-204ENST00000449228 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.34■■■■□ 3.41
BBC3-204ENST00000449228 KIF15Q9NS87 1388 aa36.34■■■■□ 3.41
BBC3-204ENST00000449228 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.28■■■■□ 3.4
BBC3-204ENST00000449228 CD109Q6YHK3 1445 aa36.27■■■■□ 3.4
BBC3-204ENST00000449228 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.24■■■■□ 3.39
BBC3-204ENST00000449228 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.24■■■■□ 3.39
BBC3-204ENST00000449228 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.23■■■■□ 3.39
BBC3-204ENST00000449228 PLXNC1O60486 1568 aa36.22■■■■□ 3.39
BBC3-204ENST00000449228 NEUROD1Q13562 356 aa36.22■■■■□ 3.39
BBC3-204ENST00000449228 ADGRL1O94910 1474 aa36.21■■■■□ 3.39
BBC3-204ENST00000449228 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.2■■■■□ 3.38
BBC3-204ENST00000449228 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
BBC3-204ENST00000449228 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
BBC3-204ENST00000449228 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.16■■■■□ 3.38
BBC3-204ENST00000449228 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.16■■■■□ 3.38
BBC3-204ENST00000449228 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
BBC3-204ENST00000449228 AFAP1Q8N556 730 aa36.13■■■■□ 3.37
BBC3-204ENST00000449228 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.12■■■■□ 3.37
BBC3-204ENST00000449228 PZPP20742 1482 aa36.11■■■■□ 3.37
BBC3-204ENST00000449228 GLI2P10070 1586 aa36.09■■■■□ 3.37
BBC3-204ENST00000449228 NUP155O75694 1391 aa36.08■■■■□ 3.37
BBC3-204ENST00000449228 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.06■■■■□ 3.36
BBC3-204ENST00000449228 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.06■■■■□ 3.36
BBC3-204ENST00000449228 ERBINQ96RT1 1412 aa36.06■■■■□ 3.36
BBC3-204ENST00000449228 TONSLQ96HA7 1378 aa36.04■■■■□ 3.36
BBC3-204ENST00000449228 NEO1Q92859 1461 aa36.04■■■■□ 3.36
BBC3-204ENST00000449228 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.02■■■■□ 3.36
BBC3-204ENST00000449228 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.02■■■■□ 3.36
BBC3-204ENST00000449228 ATP7AQ04656 1500 aa36■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 FOXD1Q16676 465 aa35.99■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.99■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.98■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.96■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 DIP2BQ9P265 1576 aa35.95■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 PKD2Q13563 968 aa35.95■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 UNC13BO14795 1591 aa35.95■■■■□ 3.35
BBC3-204ENST00000449228 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.94■■■■□ 3.34
BBC3-204ENST00000449228 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
BBC3-204ENST00000449228 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.89■■■■□ 3.34
BBC3-204ENST00000449228 KDM5CP41229 1560 aa35.87■■■■□ 3.33
BBC3-204ENST00000449228 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
BBC3-204ENST00000449228 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
BBC3-204ENST00000449228 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.84■■■■□ 3.33
BBC3-204ENST00000449228 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.82■■■■□ 3.33
BBC3-204ENST00000449228 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.82■■■■□ 3.32
BBC3-204ENST00000449228 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
BBC3-204ENST00000449228 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.81■■■■□ 3.32
BBC3-204ENST00000449228 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.78■■■■□ 3.32
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