RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445200.1

AC006335.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC006335.1, Length 547 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC006335.1-201ENST00000445200 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.11■■□□□ 1.29
AC006335.1-201ENST00000445200 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.08■■□□□ 1.29
AC006335.1-201ENST00000445200 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.07■■□□□ 1.28
AC006335.1-201ENST00000445200 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.07■■□□□ 1.28
AC006335.1-201ENST00000445200 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.06■■□□□ 1.28
AC006335.1-201ENST00000445200 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.03■■□□□ 1.28
AC006335.1-201ENST00000445200 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.01■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 CEP162Q5TB80 1403 aa23■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 PTPRMP28827 1452 aa23■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 ATP10AO60312 1499 aa22.99■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 PREX2Q70Z35 1606 aa22.97■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 AFAP1Q8N556 730 aa22.97■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.97■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.96■■□□□ 1.27
AC006335.1-201ENST00000445200 KDM5CP41229 1560 aa22.95■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.95■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.94■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.93■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.93■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.91■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 ABCC1P33527 1531 aa22.91■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 MADDQ8WXG6 1647 aa22.9■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.9■■□□□ 1.26
AC006335.1-201ENST00000445200 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.88■■□□□ 1.25
AC006335.1-201ENST00000445200 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.88■■□□□ 1.25
AC006335.1-201ENST00000445200 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
AC006335.1-201ENST00000445200 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.87■■□□□ 1.25
AC006335.1-201ENST00000445200 REREQ9P2R6 1566 aa22.86■■□□□ 1.25
AC006335.1-201ENST00000445200 MLECQ14165 292 aa22.85■■□□□ 1.25
AC006335.1-201ENST00000445200 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.85■■□□□ 1.25
AC006335.1-201ENST00000445200 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.85■■□□□ 1.25
AC006335.1-201ENST00000445200 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.83■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.82■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.8■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.8■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 AGLP35573 1532 aa22.79■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.79■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.79■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
AC006335.1-201ENST00000445200 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
AC006335.1-201ENST00000445200 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.76■■□□□ 1.23
AC006335.1-201ENST00000445200 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.75■■□□□ 1.23
AC006335.1-201ENST00000445200 ABCA6Q8N139 1617 aa22.74■■□□□ 1.23
AC006335.1-201ENST00000445200 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.73■■□□□ 1.23
AC006335.1-201ENST00000445200 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.73■■□□□ 1.23
AC006335.1-201ENST00000445200 TIAM1Q13009 1591 aa22.72■■□□□ 1.23
AC006335.1-201ENST00000445200 MAP3K1Q13233 1512 aa22.71■■□□□ 1.23
AC006335.1-201ENST00000445200 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.7■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 NCOA2Q15596 1464 aa22.69■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.69■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 ATP7AQ04656 1500 aa22.68■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.67■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.66■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 MBD5Q9P267 1494 aa22.66■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.65■■□□□ 1.22
AC006335.1-201ENST00000445200 A2MP01023 1474 aa22.64■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 APLP2Q06481 763 aa22.63■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.6■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 TSPY4P0CV99 314 aa22.59■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 TSPY10P0CW01 314 aa22.59■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 PLXNC1O60486 1568 aa22.59■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.58■■□□□ 1.21
AC006335.1-201ENST00000445200 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.58■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 HSPA2P54652 639 aa22.57■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.57■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.56■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 MIA2Q96PC5 1412 aa22.56■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.55■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 NPATQ14207 1427 aa22.54■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 ZMYM3Q14202 1370 aa22.53■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 GGT6Q6P531 493 aa22.53■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.53■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 MROH2AA6NES4 1674 aa22.52■■□□□ 1.2
AC006335.1-201ENST00000445200 C3P01024 1663 aa22.51■■□□□ 1.19
AC006335.1-201ENST00000445200 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.5■■□□□ 1.19
AC006335.1-201ENST00000445200 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.46■■□□□ 1.19
AC006335.1-201ENST00000445200 KIF3BO15066 747 aa22.45■■□□□ 1.18
AC006335.1-201ENST00000445200 FBXO41Q8TF61 875 aa22.43■■□□□ 1.18
AC006335.1-201ENST00000445200 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.4■■□□□ 1.18
AC006335.1-201ENST00000445200 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
AC006335.1-201ENST00000445200 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.39■■□□□ 1.18
AC006335.1-201ENST00000445200 PTPRKQ15262 1439 aa22.39■■□□□ 1.17
AC006335.1-201ENST00000445200 PTPRTO14522 1441 aa22.36■■□□□ 1.17
AC006335.1-201ENST00000445200 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.36■■□□□ 1.17
AC006335.1-201ENST00000445200 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.33■■□□□ 1.16
AC006335.1-201ENST00000445200 NCOA1Q15788 1441 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms