RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444811.6

NELFE-206, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-206ENST00000444811 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.31■■■□□ 2.6
NELFE-206ENST00000444811 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.3■■■□□ 2.6
NELFE-206ENST00000444811 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.3■■■□□ 2.6
NELFE-206ENST00000444811 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.28■■■□□ 2.6
NELFE-206ENST00000444811 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.28■■■□□ 2.6
NELFE-206ENST00000444811 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.26■■■□□ 2.6
NELFE-206ENST00000444811 TIAM1Q13009 1591 aa31.26■■■□□ 2.59
NELFE-206ENST00000444811 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
NELFE-206ENST00000444811 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.22■■■□□ 2.59
NELFE-206ENST00000444811 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.2■■■□□ 2.59
NELFE-206ENST00000444811 ABCC1P33527 1531 aa31.15■■■□□ 2.58
NELFE-206ENST00000444811 MAP3K1Q13233 1512 aa31.15■■■□□ 2.58
NELFE-206ENST00000444811 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.15■■■□□ 2.58
NELFE-206ENST00000444811 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.14■■■□□ 2.58
NELFE-206ENST00000444811 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.14■■■□□ 2.58
NELFE-206ENST00000444811 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.14■■■□□ 2.57
NELFE-206ENST00000444811 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
NELFE-206ENST00000444811 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.12■■■□□ 2.57
NELFE-206ENST00000444811 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.11■■■□□ 2.57
NELFE-206ENST00000444811 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.1■■■□□ 2.57
NELFE-206ENST00000444811 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.1■■■□□ 2.57
NELFE-206ENST00000444811 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
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NELFE-206ENST00000444811 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.09■■■□□ 2.57
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NELFE-206ENST00000444811 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.08■■■□□ 2.57
NELFE-206ENST00000444811 NCOA2Q15596 1464 aa31.08■■■□□ 2.57
NELFE-206ENST00000444811 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
NELFE-206ENST00000444811 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.07■■■□□ 2.56
NELFE-206ENST00000444811 AFAP1Q8N556 730 aa31.06■■■□□ 2.56
NELFE-206ENST00000444811 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
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NELFE-206ENST00000444811 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.98■■■□□ 2.55
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NELFE-206ENST00000444811 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.97■■■□□ 2.55
NELFE-206ENST00000444811 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.96■■■□□ 2.55
NELFE-206ENST00000444811 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.95■■■□□ 2.55
NELFE-206ENST00000444811 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
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NELFE-206ENST00000444811 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.93■■■□□ 2.54
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NELFE-206ENST00000444811 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.92■■■□□ 2.54
NELFE-206ENST00000444811 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.91■■■□□ 2.54
NELFE-206ENST00000444811 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.9■■■□□ 2.54
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NELFE-206ENST00000444811 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.89■■■□□ 2.54
NELFE-206ENST00000444811 MBD5Q9P267 1494 aa30.89■■■□□ 2.53
NELFE-206ENST00000444811 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.86■■■□□ 2.53
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NELFE-206ENST00000444811 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.82■■■□□ 2.52
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NELFE-206ENST00000444811 PTPRMP28827 1452 aa30.79■■■□□ 2.52
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NELFE-206ENST00000444811 AGLP35573 1532 aa30.73■■■□□ 2.51
NELFE-206ENST00000444811 MLECQ14165 292 aa30.72■■■□□ 2.51
NELFE-206ENST00000444811 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
NELFE-206ENST00000444811 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.69■■■□□ 2.5
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NELFE-206ENST00000444811 PLXNC1O60486 1568 aa30.66■■■□□ 2.5
NELFE-206ENST00000444811 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.65■■■□□ 2.5
NELFE-206ENST00000444811 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.64■■■□□ 2.5
NELFE-206ENST00000444811 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.64■■■□□ 2.49
NELFE-206ENST00000444811 A2MP01023 1474 aa30.63■■■□□ 2.49
NELFE-206ENST00000444811 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.62■■■□□ 2.49
NELFE-206ENST00000444811 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
NELFE-206ENST00000444811 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.58■■■□□ 2.49
NELFE-206ENST00000444811 TSPY4P0CV99 314 aa30.55■■■□□ 2.48
NELFE-206ENST00000444811 TSPY10P0CW01 314 aa30.55■■■□□ 2.48
NELFE-206ENST00000444811 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.55■■■□□ 2.48
NELFE-206ENST00000444811 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
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NELFE-206ENST00000444811 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.49■■■□□ 2.47
NELFE-206ENST00000444811 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
NELFE-206ENST00000444811 DAPK1P53355 1430 aa30.47■■■□□ 2.47
NELFE-206ENST00000444811 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.46■■■□□ 2.47
NELFE-206ENST00000444811 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.46■■■□□ 2.47
NELFE-206ENST00000444811 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
NELFE-206ENST00000444811 FBXO41Q8TF61 875 aa30.45■■■□□ 2.47
NELFE-206ENST00000444811 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
NELFE-206ENST00000444811 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.4■■■□□ 2.46
NELFE-206ENST00000444811 C3P01024 1663 aa30.4■■■□□ 2.46
NELFE-206ENST00000444811 GGT6Q6P531 493 aa30.4■■■□□ 2.46
NELFE-206ENST00000444811 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
NELFE-206ENST00000444811 KIF3BO15066 747 aa30.37■■■□□ 2.45
NELFE-206ENST00000444811 MROH2AA6NES4 1674 aa30.36■■■□□ 2.45
NELFE-206ENST00000444811 HSPA2P54652 639 aa30.36■■■□□ 2.45
NELFE-206ENST00000444811 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
NELFE-206ENST00000444811 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
NELFE-206ENST00000444811 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.33■■■□□ 2.45
NELFE-206ENST00000444811 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.33■■■□□ 2.45
NELFE-206ENST00000444811 KIF15Q9NS87 1388 aa30.32■■■□□ 2.44
NELFE-206ENST00000444811 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
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