RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438863.5

ST7-215, Transcript of suppression of tumorigenicity 7, human

TSL 5

Gene ST7, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ST7-215	ENST00000438863	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.9	■■■■■ 4.62
ST7-215	ENST00000438863	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		43.88	■■■■■ 4.61
ST7-215	ENST00000438863	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	43.87	■■■■■ 4.61
ST7-215	ENST00000438863	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.87	■■■■■ 4.61
ST7-215	ENST00000438863	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.87	■■■■■ 4.61
ST7-215	ENST00000438863	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	43.85	■■■■■ 4.61
ST7-215	ENST00000438863	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.8	■■■■■ 4.6
ST7-215	ENST00000438863	CLIP1	P30622	1438 aa		43.78	■■■■■ 4.6
ST7-215	ENST00000438863	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.76	■■■■■ 4.6
ST7-215	ENST00000438863	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.76	■■■■■ 4.6
ST7-215	ENST00000438863	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.74	■■■■■ 4.59
ST7-215	ENST00000438863	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.73	■■■■■ 4.59
ST7-215	ENST00000438863	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	43.7	■■■■■ 4.59
ST7-215	ENST00000438863	KDM5C	P41229	1560 aa		43.69	■■■■■ 4.58
ST7-215	ENST00000438863	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.69	■■■■■ 4.58
ST7-215	ENST00000438863	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.65	■■■■■ 4.58
ST7-215	ENST00000438863	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.65	■■■■■ 4.58
ST7-215	ENST00000438863	ATP10A	O60312	1499 aa		43.64	■■■■■ 4.58
ST7-215	ENST00000438863	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.64	■■■■■ 4.58
ST7-215	ENST00000438863	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.64	■■■■■ 4.58
ST7-215	ENST00000438863	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.61	■■■■■ 4.57
ST7-215	ENST00000438863	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.59	■■■■■ 4.57
ST7-215	ENST00000438863	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.57	■■■■■ 4.56
ST7-215	ENST00000438863	ABCC1	P33527	1531 aa		43.54	■■■■■ 4.56
ST7-215	ENST00000438863	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.53	■■■■■ 4.56
ST7-215	ENST00000438863	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.51	■■■■■ 4.56
ST7-215	ENST00000438863	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.5	■■■■■ 4.55
ST7-215	ENST00000438863	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.48	■■■■■ 4.55
ST7-215	ENST00000438863	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.47	■■■■■ 4.55
ST7-215	ENST00000438863	MLEC	Q14165	292 aa		43.46	■■■■■ 4.55
ST7-215	ENST00000438863	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.45	■■■■■ 4.55
ST7-215	ENST00000438863	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.41	■■■■■ 4.54
ST7-215	ENST00000438863	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.36	■■■■■ 4.53
ST7-215	ENST00000438863	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.34	■■■■■ 4.53
ST7-215	ENST00000438863	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		43.32	■■■■■ 4.53
ST7-215	ENST00000438863	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.32	■■■■■ 4.52
ST7-215	ENST00000438863	AGL	P35573	1532 aa		43.28	■■■■■ 4.52
ST7-215	ENST00000438863	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.28	■■■■■ 4.52
ST7-215	ENST00000438863	HSPA2	P54652	639 aa		43.25	■■■■■ 4.51
ST7-215	ENST00000438863	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.22	■■■■■ 4.51
ST7-215	ENST00000438863	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.22	■■■■■ 4.51
ST7-215	ENST00000438863	C3	P01024	1663 aa		43.16	■■■■■ 4.5
ST7-215	ENST00000438863	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.15	■■■■■ 4.5
ST7-215	ENST00000438863	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.5
ST7-215	ENST00000438863	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.11	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.1	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.1	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.08	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.08	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.08	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.07	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.07	■■■■■ 4.49
ST7-215	ENST00000438863	ATP7A	Q04656	1500 aa		43.05	■■■■■ 4.48
ST7-215	ENST00000438863	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.03	■■■■■ 4.48	4e-23	■■■■■ 46.6
ST7-215	ENST00000438863	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.02	■■■■■ 4.48
ST7-215	ENST00000438863	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.01	■■■■■ 4.47
ST7-215	ENST00000438863	PLXNC1	O60486	1568 aa		43	■■■■■ 4.47
ST7-215	ENST00000438863	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
ST7-215	ENST00000438863	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
ST7-215	ENST00000438863	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ST7-215	ENST00000438863	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ST7-215	ENST00000438863	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.95	■■■■■ 4.47
ST7-215	ENST00000438863	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.88	■■■■■ 4.46
ST7-215	ENST00000438863	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.88	■■■■■ 4.45
ST7-215	ENST00000438863	A2M	P01023	1474 aa		42.87	■■■■■ 4.45
ST7-215	ENST00000438863	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
ST7-215	ENST00000438863	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
ST7-215	ENST00000438863	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.44
ST7-215	ENST00000438863	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.78	■■■■■ 4.44
ST7-215	ENST00000438863	NPAT	Q14207	1427 aa		42.76	■■■■■ 4.44
ST7-215	ENST00000438863	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.73	■■■■■ 4.43
ST7-215	ENST00000438863	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ST7-215	ENST00000438863	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.7	■■■■■ 4.43
ST7-215	ENST00000438863	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.69	■■■■■ 4.42
ST7-215	ENST00000438863	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ST7-215	ENST00000438863	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ST7-215	ENST00000438863	PTPRT	O14522	1441 aa		42.64	■■■■■ 4.42
ST7-215	ENST00000438863	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.64	■■■■■ 4.42
ST7-215	ENST00000438863	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.63	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.62	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.62	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.59	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.59	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.58	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	GGT6	Q6P531	493 aa		42.57	■■■■■ 4.41
ST7-215	ENST00000438863	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.57	■■■■■ 4.4
ST7-215	ENST00000438863	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.55	■■■■■ 4.4
ST7-215	ENST00000438863	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.52	■■■■■ 4.4
ST7-215	ENST00000438863	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
ST7-215	ENST00000438863	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.49	■■■■■ 4.39
ST7-215	ENST00000438863	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.46	■■■■■ 4.39
ST7-215	ENST00000438863	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.45	■■■■■ 4.39
ST7-215	ENST00000438863	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.41	■■■■■ 4.38
ST7-215	ENST00000438863	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ST7-215	ENST00000438863	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ST7-215	ENST00000438863	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.37	■■■■■ 4.37

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