RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438777.5

CCDC18-AS1-211, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 752 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 UACAQ9BZF9 1416 aa8.8□□□□□ -1
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.8□□□□□ -1
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATP10BO94823 1461 aa8.78□□□□□ -1
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.78□□□□□ -1
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CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PREX2Q70Z35 1606 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.69□□□□□ -1.02
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CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.66□□□□□ -1.02
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CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.57□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.57□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.56□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DIP2BQ9P265 1576 aa8.55□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NCOA1Q15788 1441 aa8.54□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.53□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FANCAO15360 1455 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NEO1Q92859 1461 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.52□□□□□ -1.05
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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