RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 METRNQ9UJH8 293 aa8.7□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.7□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBR1Q14596 966 aa8.69□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 IER5LQ5T953 404 aa8.69□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEJP0CG39 1038 aa8.68□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.68□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE4AP27815 886 aa8.67□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.67□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 OCEL1Q9H607 264 aa8.67□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 P3H3Q8IVL6 736 aa8.66□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD10Q14728 455 aa8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 MICALL2Q8IY33 904 aa8.64□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLCG2P16885 1265 aa8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 E2F4Q16254 413 aa8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC39A7Q92504 469 aa8.62□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEFA5A3E0 1075 aa8.61□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.61□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 C7P10643 843 aa8.6□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMARCA4P51532 1647 aa8.59□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC24BO95487 1268 aa8.59□□□□□ -1.03
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.58□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMK2BQ13554 666 aa8.57□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEMA6NI47 508 aa8.55□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 G3V3G9 751 aa8.55□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF3CO14782 793 aa8.54□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 DSG2Q14126 1118 aa8.54□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMC2Q8TDI7 906 aa8.54□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf72A6NCS6 295 aa8.53□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEGQ6S5H5 508 aa8.53□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.53□□□□□ -1.04
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXK1P85037 733 aa8.52□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEMA3EO15041 775 aa8.5□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.5□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLPP6Q8IY26 295 aa8.49□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMARCA2P51531 1590 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMGXB3Q12766 1538 aa8.48□□□□□ -1.05
RPS3AP54-201ENST00000435535 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.46□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.45□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.45□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPYSL4O14531 572 aa8.45□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.45□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 WIZO95785 1651 aa8.45□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.44□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.43□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.42□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCAPD3P42695 1498 aa8.41□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDIA6Q15084 440 aa8.4□□□□□ -1.06
RPS3AP54-201ENST00000435535 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 OXER1Q8TDS5 423 aa8.38□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 NESP48681 1621 aa8.38□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERCC6Q03468 1493 aa8.38□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K9P80192 1104 aa8.37□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.37□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM2Q13029 1718 aa8.34□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.34□□□□□ -1.07
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.32□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC34A2O95436 690 aa8.31□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBC1D12O60347 775 aa8.3□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 EVI5O60447 810 aa8.3□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.29□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGER2P43116 358 aa8.29□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST18O60284 1047 aa8.28□□□□□ -1.08
RPS3AP54-201ENST00000435535 CUX2O14529 1486 aa8.27□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX12PQ92771 950 aa8.27□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMYND10O75800 440 aa8.26□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSBPP22059 807 aa8.26□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.26□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.25□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.24□□□□□ -1.09
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