RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.71■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-212ENST00000433317 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.69■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.68■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AKNAQ7Z591 1439 aa19.66■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.64■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.64■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MIA2Q96PC5 1412 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NBR1Q14596 966 aa19.6■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DAPK1P53355 1430 aa19.57■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.56■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NUDCQ9Y266 331 aa19.54■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ABCC5O15440 1437 aa19.53■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.52■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IQGAP2Q13576 1575 aa19.52■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 WDR62O43379 1518 aa19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ROCK1Q13464 1354 aa19.5■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP47Q96K76 1375 aa19.49■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMC1Q8TDI8 760 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PZPP20742 1482 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.43■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PKD2Q13563 968 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PBRM1Q86U86 1689 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MBD5Q9P267 1494 aa19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADAMTS12P58397 1594 aa19.36■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.36■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.36■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KDM5CP41229 1560 aa19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIF14Q15058 1648 aa19.32■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIF15Q9NS87 1388 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DISP1Q96F81 1524 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIAA0556O60303 1618 aa19.29■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NUP155O75694 1391 aa19.26■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.26■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RALBP1Q15311 655 aa19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.21■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDE4AP27815 886 aa19.21■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.2■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADGRL2O95490 1459 aa19.2■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.2■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.19■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLIN1O60240 522 aa19.18■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SKAP1Q86WV1 359 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.16■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NLRP13Q86W25 1043 aa19.16■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NEFMP07197 916 aa19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms