RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTMSP20962 102 aa19.01■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MORC1Q86VD1 984 aa19■□□□□ 0.63
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.99■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.98■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.96■□□□□ 0.63
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPHP1O15259 732 aa18.95■□□□□ 0.62
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 SOGA1O94964 1423 aa18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.93■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RALBP1Q15311 655 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLGA2Q08379 1002 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GBP4Q96PP9 640 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DRC7Q8IY82 874 aa18.92■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.91■□□□□ 0.62
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PKD2Q13563 968 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FMN1Q68DA7 1419 aa18.85■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.84■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.84■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.84■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMARCA2P51531 1590 aa18.84■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.83■□□□□ 0.6
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.82■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.81■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.8■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.8■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.79■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SOX12O15370 315 aa18.78■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-207ENST00000428584 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 APBB1O00213 710 aa18.77■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.76■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MLECQ14165 292 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCC8Q09428 1581 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.74■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GGT6Q6P531 493 aa18.74■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUP155O75694 1391 aa18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STK26Q9P289 416 aa18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDE3BQ13370 1112 aa18.72■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TPM4P67936 248 aa18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.7■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPATCH3Q96I76 525 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMMRO75330 724 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLSTN1O94985 981 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STK31Q9BXU1 1019 aa18.67■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 NLRP13Q86W25 1043 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF15Q9NS87 1388 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LMOD3Q0VAK6 560 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHF14O94880 888 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC34Q96HJ3 373 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ST18O60284 1047 aa18.58■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 USP35Q9P2H5 1018 aa18.57■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GORABQ5T7V8 394 aa18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EID1Q9Y6B2 187 aa18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
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