RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427786.1

PPP1CB-206, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PPP1CB, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-206ENST00000427786 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.73■■■□□ 2.67
PPP1CB-206ENST00000427786 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.69■■■□□ 2.66
PPP1CB-206ENST00000427786 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.68■■■□□ 2.66
PPP1CB-206ENST00000427786 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.67■■■□□ 2.66
PPP1CB-206ENST00000427786 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.67■■■□□ 2.66
PPP1CB-206ENST00000427786 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.65■■■□□ 2.66
PPP1CB-206ENST00000427786 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.65■■■□□ 2.66
PPP1CB-206ENST00000427786 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.64■■■□□ 2.66
PPP1CB-206ENST00000427786 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.64■■■□□ 2.66
PPP1CB-206ENST00000427786 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.63■■■□□ 2.65
PPP1CB-206ENST00000427786 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.62■■■□□ 2.65
PPP1CB-206ENST00000427786 KDM5CP41229 1560 aa31.61■■■□□ 2.65
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCC1P33527 1531 aa31.59■■■□□ 2.65
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.57■■■□□ 2.64
PPP1CB-206ENST00000427786 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.56■■■□□ 2.64
PPP1CB-206ENST00000427786 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.53■■■□□ 2.64
PPP1CB-206ENST00000427786 MADDQ8WXG6 1647 aa31.53■■■□□ 2.64
PPP1CB-206ENST00000427786 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
PPP1CB-206ENST00000427786 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.51■■■□□ 2.63
PPP1CB-206ENST00000427786 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.51■■■□□ 2.63
PPP1CB-206ENST00000427786 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.5■■■□□ 2.63
PPP1CB-206ENST00000427786 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.49■■■□□ 2.63
PPP1CB-206ENST00000427786 PTPRMP28827 1452 aa31.46■■■□□ 2.63
PPP1CB-206ENST00000427786 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.45■■■□□ 2.63
PPP1CB-206ENST00000427786 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.44■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.44■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 ATP10AO60312 1499 aa31.44■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 TIAM1Q13009 1591 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.43■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCA6Q8N139 1617 aa31.42■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.42■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 AFAP1Q8N556 730 aa31.42■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 REREQ9P2R6 1566 aa31.41■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
PPP1CB-206ENST00000427786 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.39■■■□□ 2.61
PPP1CB-206ENST00000427786 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.38■■■□□ 2.61
PPP1CB-206ENST00000427786 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.35■■■□□ 2.61
PPP1CB-206ENST00000427786 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.33■■■□□ 2.61
PPP1CB-206ENST00000427786 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.32■■■□□ 2.61
PPP1CB-206ENST00000427786 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
PPP1CB-206ENST00000427786 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.31■■■□□ 2.6
PPP1CB-206ENST00000427786 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
PPP1CB-206ENST00000427786 NCOA2Q15596 1464 aa31.27■■■□□ 2.6
PPP1CB-206ENST00000427786 AGLP35573 1532 aa31.26■■■□□ 2.59
PPP1CB-206ENST00000427786 MAP3K1Q13233 1512 aa31.26■■■□□ 2.59
PPP1CB-206ENST00000427786 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
PPP1CB-206ENST00000427786 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.23■■■□□ 2.59
PPP1CB-206ENST00000427786 ATP7AQ04656 1500 aa31.21■■■□□ 2.59
PPP1CB-206ENST00000427786 MBD5Q9P267 1494 aa31.2■■■□□ 2.58
PPP1CB-206ENST00000427786 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.18■■■□□ 2.582e-6■■□□□ 12.6
PPP1CB-206ENST00000427786 MLECQ14165 292 aa31.17■■■□□ 2.58
PPP1CB-206ENST00000427786 PLXNC1O60486 1568 aa31.16■■■□□ 2.58
PPP1CB-206ENST00000427786 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.15■■■□□ 2.58
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
PPP1CB-206ENST00000427786 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.14■■■□□ 2.58
PPP1CB-206ENST00000427786 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
PPP1CB-206ENST00000427786 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.12■■■□□ 2.57
PPP1CB-206ENST00000427786 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.07■■■□□ 2.56
PPP1CB-206ENST00000427786 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
PPP1CB-206ENST00000427786 A2MP01023 1474 aa31.04■■■□□ 2.56
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.04■■■□□ 2.56
PPP1CB-206ENST00000427786 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.04■■■□□ 2.56
PPP1CB-206ENST00000427786 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.03■■■□□ 2.56
PPP1CB-206ENST00000427786 C3P01024 1663 aa31.03■■■□□ 2.56
PPP1CB-206ENST00000427786 PREX1Q8TCU6 1659 aa31■■■□□ 2.55
PPP1CB-206ENST00000427786 MROH2AA6NES4 1674 aa30.98■■■□□ 2.55
PPP1CB-206ENST00000427786 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.97■■■□□ 2.55
PPP1CB-206ENST00000427786 MIA2Q96PC5 1412 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP1CB-206ENST00000427786 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.94■■■□□ 2.54
PPP1CB-206ENST00000427786 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.93■■■□□ 2.54
PPP1CB-206ENST00000427786 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
PPP1CB-206ENST00000427786 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.91■■■□□ 2.54
PPP1CB-206ENST00000427786 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.89■■■□□ 2.54
PPP1CB-206ENST00000427786 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
PPP1CB-206ENST00000427786 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
PPP1CB-206ENST00000427786 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
PPP1CB-206ENST00000427786 HSPA2P54652 639 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.81■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 APLP2Q06481 763 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 NPATQ14207 1427 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.52
PPP1CB-206ENST00000427786 ZMYM3Q14202 1370 aa30.76■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.74■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 TSPY4P0CV99 314 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 TSPY10P0CW01 314 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 GGT6Q6P531 493 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 STRCQ7RTU9 1775 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
PPP1CB-206ENST00000427786 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.7■■■□□ 2.51
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