RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423499.3

BX005214.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BX005214.2, Length 1,077 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BX005214.2-201ENST00000423499 SOX12O15370 315 aa16.1■□□□□ 0.17
BX005214.2-201ENST00000423499 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
BX005214.2-201ENST00000423499 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
BX005214.2-201ENST00000423499 GOLGA2Q08379 1002 aa16.08■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.08■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 PRDM2Q13029 1718 aa16.07■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.06■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.06■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 POTEIP0CG38 1075 aa16.04■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 NLRP6P59044 892 aa16.03■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 WDR62O43379 1518 aa16.03■□□□□ 0.16
BX005214.2-201ENST00000423499 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
BX005214.2-201ENST00000423499 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.01■□□□□ 0.15
BX005214.2-201ENST00000423499 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.98■□□□□ 0.15
BX005214.2-201ENST00000423499 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
BX005214.2-201ENST00000423499 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 ABCC8Q09428 1581 aa15.94■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 TOPBP1Q92547 1522 aa15.94■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 PPP1R37O75864 691 aa15.92■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 IER5LQ5T953 404 aa15.92■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.92■□□□□ 0.14
BX005214.2-201ENST00000423499 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.89■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 CUX1P39880 1505 aa15.85■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.85■□□□□ 0.13
BX005214.2-201ENST00000423499 IFT140Q96RY7 1462 aa15.83■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 SLC39A7Q92504 469 aa15.81■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 OCEL1Q9H607 264 aa15.81■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.8■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.79■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 SOGA1O94964 1423 aa15.78■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.78■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 C7P10643 843 aa15.77■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 PLCG2P16885 1265 aa15.77■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
BX005214.2-201ENST00000423499 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.77■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 METRNQ9UJH8 293 aa15.76■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 POTEFA5A3E0 1075 aa15.74■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 SYNJ1O43426 1573 aa15.73■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 SEC24BO95487 1268 aa15.72■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 TOP2BQ02880 1626 aa15.72■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
BX005214.2-201ENST00000423499 LHX8Q68G74 356 aa15.7■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.69■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 MICALL2Q8IY33 904 aa15.67■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.65■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
BX005214.2-201ENST00000423499 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.63■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.61■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 WDR97A6NE52 1622 aa15.59■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.59■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.59■□□□□ 0.09
BX005214.2-201ENST00000423499 GRIN2BQ13224 1484 aa15.57■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 G3V3G9 751 aa15.56■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.53■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 POTEB2H3BUK9 544 aa15.53■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 PDE4AP27815 886 aa15.53■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.53■□□□□ 0.08
BX005214.2-201ENST00000423499 MFSD10Q14728 455 aa15.51■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 WDR70Q9NW82 654 aa15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 KIF27Q86VH2 1401 aa15.5■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 PBRM1Q86U86 1689 aa15.47■□□□□ 0.07
BX005214.2-201ENST00000423499 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.45■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 SYNJ2O15056 1496 aa15.45■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.44■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 KIF3CO14782 793 aa15.44■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 TMC2Q8TDI7 906 aa15.44■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.43■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.42■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 IGF1RP08069 1367 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 C2orf72A6NCS6 295 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 POTEJP0CG39 1038 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.41■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 ADAMTS12P58397 1594 aa15.4■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 CHD1O14646 1710 aa15.4■□□□□ 0.06
BX005214.2-201ENST00000423499 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.39■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.39■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 DSG2Q14126 1118 aa15.38■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 E2F4Q16254 413 aa15.38■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 P3H3Q8IVL6 736 aa15.38■□□□□ 0.05
BX005214.2-201ENST00000423499 OTUD5Q96G74 571 aa15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms