RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422080.5

HDLBP-208, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 3

Gene HDLBP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-208	ENST00000422080	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.64	■■■□□ 2.18
HDLBP-208	ENST00000422080	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.61	■■■□□ 2.17
HDLBP-208	ENST00000422080	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.6	■■■□□ 2.17
HDLBP-208	ENST00000422080	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.6	■■■□□ 2.17
HDLBP-208	ENST00000422080	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.59	■■■□□ 2.17
HDLBP-208	ENST00000422080	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.58	■■■□□ 2.17
HDLBP-208	ENST00000422080	PTPRM	P28827	1452 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HDLBP-208	ENST00000422080	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HDLBP-208	ENST00000422080	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDLBP-208	ENST00000422080	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDLBP-208	ENST00000422080	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HDLBP-208	ENST00000422080	ATP10A	O60312	1499 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDLBP-208	ENST00000422080	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDLBP-208	ENST00000422080	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.46	■■■□□ 2.15
HDLBP-208	ENST00000422080	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.45	■■■□□ 2.15
HDLBP-208	ENST00000422080	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.45	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.44	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.44	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.44	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	KDM5C	P41229	1560 aa		28.44	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.43	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	MLEC	Q14165	292 aa		28.42	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.42	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.42	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.41	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	ABCC1	P33527	1531 aa		28.41	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
HDLBP-208	ENST00000422080	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.38	■■■□□ 2.13
HDLBP-208	ENST00000422080	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
HDLBP-208	ENST00000422080	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.36	■■■□□ 2.13
HDLBP-208	ENST00000422080	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.35	■■■□□ 2.13
HDLBP-208	ENST00000422080	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.33	■■■□□ 2.13
HDLBP-208	ENST00000422080	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.32	■■■□□ 2.12	1e-10	■□□□□ 10.4
HDLBP-208	ENST00000422080	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.3	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.29	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.29	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.28	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.28	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.28	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.27	■■■□□ 2.12
HDLBP-208	ENST00000422080	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.24	■■■□□ 2.11
HDLBP-208	ENST00000422080	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.23	■■■□□ 2.11
HDLBP-208	ENST00000422080	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.23	■■■□□ 2.11
HDLBP-208	ENST00000422080	AGL	P35573	1532 aa		28.23	■■■□□ 2.11
HDLBP-208	ENST00000422080	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.21	■■■□□ 2.11
HDLBP-208	ENST00000422080	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
HDLBP-208	ENST00000422080	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.19	■■■□□ 2.1
HDLBP-208	ENST00000422080	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.19	■■■□□ 2.1
HDLBP-208	ENST00000422080	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.18	■■■□□ 2.1
HDLBP-208	ENST00000422080	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
HDLBP-208	ENST00000422080	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.15	■■■□□ 2.1
HDLBP-208	ENST00000422080	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
HDLBP-208	ENST00000422080	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.14	■■■□□ 2.09
HDLBP-208	ENST00000422080	HSPA2	P54652	639 aa		28.11	■■■□□ 2.09
HDLBP-208	ENST00000422080	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.1	■■■□□ 2.09
HDLBP-208	ENST00000422080	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.1	■■■□□ 2.09
HDLBP-208	ENST00000422080	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.09	■■■□□ 2.09
HDLBP-208	ENST00000422080	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.08	■■■□□ 2.08
HDLBP-208	ENST00000422080	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
HDLBP-208	ENST00000422080	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.07	■■■□□ 2.08
HDLBP-208	ENST00000422080	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
HDLBP-208	ENST00000422080	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.06	■■■□□ 2.08
HDLBP-208	ENST00000422080	A2M	P01023	1474 aa		28.06	■■■□□ 2.08
HDLBP-208	ENST00000422080	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
HDLBP-208	ENST00000422080	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
HDLBP-208	ENST00000422080	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.99	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.99	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.98	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.98	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	APLP2	Q06481	763 aa		27.96	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	GGT6	Q6P531	493 aa		27.96	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.96	■■■□□ 2.07
HDLBP-208	ENST00000422080	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.95	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.95	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.93	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	C3	P01024	1663 aa		27.92	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.91	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	NPAT	Q14207	1427 aa		27.9	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.9	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.89	■■■□□ 2.06
HDLBP-208	ENST00000422080	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.89	■■■□□ 2.05
HDLBP-208	ENST00000422080	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		27.87	■■■□□ 2.05
HDLBP-208	ENST00000422080	KIF3B	O15066	747 aa		27.86	■■■□□ 2.05
HDLBP-208	ENST00000422080	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.84	■■■□□ 2.05
HDLBP-208	ENST00000422080	FBXO41	Q8TF61	875 aa		27.83	■■■□□ 2.05
HDLBP-208	ENST00000422080	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.8	■■■□□ 2.04
HDLBP-208	ENST00000422080	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
HDLBP-208	ENST00000422080	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.74	■■■□□ 2.03
HDLBP-208	ENST00000422080	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		27.74	■■■□□ 2.03
HDLBP-208	ENST00000422080	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.72	■■■□□ 2.03
HDLBP-208	ENST00000422080	PTPRT	O14522	1441 aa		27.71	■■■□□ 2.03
HDLBP-208	ENST00000422080	NCOA1	Q15788	1441 aa		27.7	■■■□□ 2.03
HDLBP-208	ENST00000422080	CERK	Q8TCT0	537 aa		27.7	■■■□□ 2.02
HDLBP-208	ENST00000422080	STRC	Q7RTU9	1775 aa		27.7	■■■□□ 2.02

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