RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF14Q15058 1648 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CCER2I3L3R5 266 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP8Q14318 412 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM52Q96A61 297 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP10BO94823 1461 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA8O94911 1581 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP1-202ENST00000417536 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1-202ENST00000417536 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP1-202ENST00000417536 SHROOM2Q13796 1616 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM6BO15054 1643 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1-202ENST00000417536 NEFLP07196 543 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1-202ENST00000417536 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP1-202ENST00000417536 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 MIA2Q96PC5 1412 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXD1Q16676 465 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 DAPK1P53355 1430 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC5O15440 1437 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP1-202ENST00000417536 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1-202ENST00000417536 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 AKNAQ7Z591 1439 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC2Q92887 1545 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.759e-9■■■■□ 19.6
SH3BP1-202ENST00000417536 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1-202ENST00000417536 OSCARQ8IYS5 282 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC184Q52MB2 194 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 NCOA1Q15788 1441 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 ROCK1Q13464 1354 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC7Q96M83 1385 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPY4P0CV99 314 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPY10P0CW01 314 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PREX2Q70Z35 1606 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MBD5Q9P267 1494 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MRS2Q9HD23 443 aa25.7■■□□□ 1.71
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF15Q9NS87 1388 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.73e-7■■■■□ 23.3
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 PKD2Q13563 968 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRL2O95490 1459 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 PZPP20742 1482 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1-202ENST00000417536 AFAP1Q8N556 730 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP155O75694 1391 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ASXL2Q76L83 1435 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 PLCH2O75038 1416 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1-202ENST00000417536 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1-202ENST00000417536 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.56■■□□□ 1.68
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