RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414057.6

SCAMP4-204, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SCAMP4, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-204ENST00000414057 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.99■■□□□ 1.91
SCAMP4-204ENST00000414057 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.98■■□□□ 1.91
SCAMP4-204ENST00000414057 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.98■■□□□ 1.91
SCAMP4-204ENST00000414057 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.97■■□□□ 1.91
SCAMP4-204ENST00000414057 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.95■■□□□ 1.91
SCAMP4-204ENST00000414057 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.95■■□□□ 1.9
SCAMP4-204ENST00000414057 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.92■■□□□ 1.9
SCAMP4-204ENST00000414057 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.92■■□□□ 1.9
SCAMP4-204ENST00000414057 PTPRMP28827 1452 aa26.91■■□□□ 1.9
SCAMP4-204ENST00000414057 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.91■■□□□ 1.9
SCAMP4-204ENST00000414057 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.89■■□□□ 1.9
SCAMP4-204ENST00000414057 ATP10AO60312 1499 aa26.86■■□□□ 1.89
SCAMP4-204ENST00000414057 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.86■■□□□ 1.89
SCAMP4-204ENST00000414057 AFAP1Q8N556 730 aa26.85■■□□□ 1.89
SCAMP4-204ENST00000414057 PREX2Q70Z35 1606 aa26.84■■□□□ 1.89
SCAMP4-204ENST00000414057 MADDQ8WXG6 1647 aa26.84■■□□□ 1.89
SCAMP4-204ENST00000414057 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.83■■□□□ 1.89
SCAMP4-204ENST00000414057 CEP162Q5TB80 1403 aa26.82■■□□□ 1.88
SCAMP4-204ENST00000414057 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.82■■□□□ 1.88
SCAMP4-204ENST00000414057 KDM5CP41229 1560 aa26.8■■□□□ 1.88
SCAMP4-204ENST00000414057 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.8■■□□□ 1.88
SCAMP4-204ENST00000414057 MLECQ14165 292 aa26.79■■□□□ 1.88
SCAMP4-204ENST00000414057 ABCC1P33527 1531 aa26.77■■□□□ 1.88
SCAMP4-204ENST00000414057 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.76■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.74■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.73■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.73■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.71■■□□□ 1.87
SCAMP4-204ENST00000414057 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.7■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.69■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.68■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 REREQ9P2R6 1566 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.67■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.66■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.64■■□□□ 1.86
SCAMP4-204ENST00000414057 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.64■■□□□ 1.85
SCAMP4-204ENST00000414057 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.852e-12■■□□□ 14.5
SCAMP4-204ENST00000414057 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SCAMP4-204ENST00000414057 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.62■■□□□ 1.85
SCAMP4-204ENST00000414057 ABCA6Q8N139 1617 aa26.61■■□□□ 1.85
SCAMP4-204ENST00000414057 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.6■■□□□ 1.85
SCAMP4-204ENST00000414057 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SCAMP4-204ENST00000414057 AGLP35573 1532 aa26.6■■□□□ 1.85
SCAMP4-204ENST00000414057 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.56■■□□□ 1.84
SCAMP4-204ENST00000414057 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.56■■□□□ 1.84
SCAMP4-204ENST00000414057 TIAM1Q13009 1591 aa26.54■■□□□ 1.84
SCAMP4-204ENST00000414057 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 ATP7AQ04656 1500 aa26.5■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 NCOA2Q15596 1464 aa26.5■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 HSPA2P54652 639 aa26.48■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.47■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.47■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SCAMP4-204ENST00000414057 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SCAMP4-204ENST00000414057 A2MP01023 1474 aa26.44■■□□□ 1.82
SCAMP4-204ENST00000414057 MBD5Q9P267 1494 aa26.44■■□□□ 1.82
SCAMP4-204ENST00000414057 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.43■■□□□ 1.82
SCAMP4-204ENST00000414057 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.43■■□□□ 1.82
SCAMP4-204ENST00000414057 MAP3K1Q13233 1512 aa26.41■■□□□ 1.82
SCAMP4-204ENST00000414057 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.41■■□□□ 1.82
SCAMP4-204ENST00000414057 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.4■■□□□ 1.82
SCAMP4-204ENST00000414057 PLXNC1O60486 1568 aa26.37■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 APLP2Q06481 763 aa26.37■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.37■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.37■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.37■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 GGT6Q6P531 493 aa26.35■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 C3P01024 1663 aa26.35■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.34■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 TSPY4P0CV99 314 aa26.34■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 TSPY10P0CW01 314 aa26.34■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 ZMYM3Q14202 1370 aa26.33■■□□□ 1.81
SCAMP4-204ENST00000414057 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SCAMP4-204ENST00000414057 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SCAMP4-204ENST00000414057 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.31■■□□□ 1.8
SCAMP4-204ENST00000414057 NPATQ14207 1427 aa26.3■■□□□ 1.8
SCAMP4-204ENST00000414057 MROH2AA6NES4 1674 aa26.29■■□□□ 1.8
SCAMP4-204ENST00000414057 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.28■■□□□ 1.8
SCAMP4-204ENST00000414057 MIA2Q96PC5 1412 aa26.27■■□□□ 1.8
SCAMP4-204ENST00000414057 FBXO41Q8TF61 875 aa26.27■■□□□ 1.8
SCAMP4-204ENST00000414057 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.25■■□□□ 1.79
SCAMP4-204ENST00000414057 KIF3BO15066 747 aa26.23■■□□□ 1.79
SCAMP4-204ENST00000414057 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SCAMP4-204ENST00000414057 PTPRKQ15262 1439 aa26.16■■□□□ 1.78
SCAMP4-204ENST00000414057 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.15■■□□□ 1.78
SCAMP4-204ENST00000414057 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.14■■□□□ 1.78
SCAMP4-204ENST00000414057 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.14■■□□□ 1.77
SCAMP4-204ENST00000414057 PTPRTO14522 1441 aa26.13■■□□□ 1.77
SCAMP4-204ENST00000414057 CERKQ8TCT0 537 aa26.12■■□□□ 1.77
SCAMP4-204ENST00000414057 STRCQ7RTU9 1775 aa26.12■■□□□ 1.77
SCAMP4-204ENST00000414057 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms