RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.41■■■□□ 2.62
ANKRD54-204ENST00000411961 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.39■■■□□ 2.61
ANKRD54-204ENST00000411961 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.39■■■□□ 2.61
ANKRD54-204ENST00000411961 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.38■■■□□ 2.61
ANKRD54-204ENST00000411961 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.36■■■□□ 2.61
ANKRD54-204ENST00000411961 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.36■■■□□ 2.61
ANKRD54-204ENST00000411961 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.36■■■□□ 2.61
ANKRD54-204ENST00000411961 PREX2Q70Z35 1606 aa31.33■■■□□ 2.61
ANKRD54-204ENST00000411961 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.32■■■□□ 2.6
ANKRD54-204ENST00000411961 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.31■■■□□ 2.6
ANKRD54-204ENST00000411961 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.3■■■□□ 2.6
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.29■■■□□ 2.6
ANKRD54-204ENST00000411961 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.28■■■□□ 2.6
ANKRD54-204ENST00000411961 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.28■■■□□ 2.6
ANKRD54-204ENST00000411961 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.28■■■□□ 2.6
ANKRD54-204ENST00000411961 AFAP1Q8N556 730 aa31.27■■■□□ 2.6
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
ANKRD54-204ENST00000411961 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.21■■■□□ 2.59
ANKRD54-204ENST00000411961 ATP10AO60312 1499 aa31.21■■■□□ 2.59
ANKRD54-204ENST00000411961 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCC1P33527 1531 aa31.19■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 PTPRMP28827 1452 aa31.18■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 KDM5CP41229 1560 aa31.17■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 MADDQ8WXG6 1647 aa31.17■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 MLECQ14165 292 aa31.17■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.16■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.16■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.15■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.15■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.14■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.14■■■□□ 2.58
ANKRD54-204ENST00000411961 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.12■■■□□ 2.57
ANKRD54-204ENST00000411961 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.11■■■□□ 2.57
ANKRD54-204ENST00000411961 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
ANKRD54-204ENST00000411961 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.1■■■□□ 2.57
ANKRD54-204ENST00000411961 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.1■■■□□ 2.57
ANKRD54-204ENST00000411961 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.57
ANKRD54-204ENST00000411961 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.07■■■□□ 2.56
ANKRD54-204ENST00000411961 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.06■■■□□ 2.56
ANKRD54-204ENST00000411961 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.05■■■□□ 2.56
ANKRD54-204ENST00000411961 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.05■■■□□ 2.56
ANKRD54-204ENST00000411961 TIAM1Q13009 1591 aa31.04■■■□□ 2.56
ANKRD54-204ENST00000411961 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
ANKRD54-204ENST00000411961 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.02■■■□□ 2.56
ANKRD54-204ENST00000411961 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.02■■■□□ 2.56
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCA6Q8N139 1617 aa31.02■■■□□ 2.56
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ANKRD54-204ENST00000411961 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.99■■■□□ 2.55
ANKRD54-204ENST00000411961 REREQ9P2R6 1566 aa30.97■■■□□ 2.55
ANKRD54-204ENST00000411961 NCOA2Q15596 1464 aa30.97■■■□□ 2.55
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
ANKRD54-204ENST00000411961 APLP2Q06481 763 aa30.92■■■□□ 2.54
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ANKRD54-204ENST00000411961 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.92■■■□□ 2.54
ANKRD54-204ENST00000411961 AGLP35573 1532 aa30.89■■■□□ 2.54
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ANKRD54-204ENST00000411961 MAP3K1Q13233 1512 aa30.88■■■□□ 2.53
ANKRD54-204ENST00000411961 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
ANKRD54-204ENST00000411961 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
ANKRD54-204ENST00000411961 MBD5Q9P267 1494 aa30.82■■■□□ 2.53
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ANKRD54-204ENST00000411961 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.81■■■□□ 2.52
ANKRD54-204ENST00000411961 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.81■■■□□ 2.52
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ANKRD54-204ENST00000411961 A2MP01023 1474 aa30.78■■■□□ 2.52
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ANKRD54-204ENST00000411961 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.75■■■□□ 2.51
ANKRD54-204ENST00000411961 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.74■■■□□ 2.51
ANKRD54-204ENST00000411961 TSPY4P0CV99 314 aa30.72■■■□□ 2.51
ANKRD54-204ENST00000411961 TSPY10P0CW01 314 aa30.72■■■□□ 2.51
ANKRD54-204ENST00000411961 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.72■■■□□ 2.51
ANKRD54-204ENST00000411961 HSPA2P54652 639 aa30.71■■■□□ 2.51
ANKRD54-204ENST00000411961 GGT6Q6P531 493 aa30.69■■■□□ 2.5
ANKRD54-204ENST00000411961 PLXNC1O60486 1568 aa30.69■■■□□ 2.5
ANKRD54-204ENST00000411961 C3P01024 1663 aa30.68■■■□□ 2.5
ANKRD54-204ENST00000411961 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.68■■■□□ 2.5
ANKRD54-204ENST00000411961 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.68■■■□□ 2.5
ANKRD54-204ENST00000411961 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.67■■■□□ 2.5
ANKRD54-204ENST00000411961 MIA2Q96PC5 1412 aa30.65■■■□□ 2.5
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ANKRD54-204ENST00000411961 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.62■■■□□ 2.49
ANKRD54-204ENST00000411961 MROH2AA6NES4 1674 aa30.6■■■□□ 2.49
ANKRD54-204ENST00000411961 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.6■■■□□ 2.49
ANKRD54-204ENST00000411961 ZMYM3Q14202 1370 aa30.59■■■□□ 2.49
ANKRD54-204ENST00000411961 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
ANKRD54-204ENST00000411961 KIF3BO15066 747 aa30.58■■■□□ 2.49
ANKRD54-204ENST00000411961 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.5■■■□□ 2.47
ANKRD54-204ENST00000411961 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.5■■■□□ 2.47
ANKRD54-204ENST00000411961 NPATQ14207 1427 aa30.49■■■□□ 2.47
ANKRD54-204ENST00000411961 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.45■■■□□ 2.46
ANKRD54-204ENST00000411961 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
ANKRD54-204ENST00000411961 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.44■■■□□ 2.46
ANKRD54-204ENST00000411961 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.42■■■□□ 2.46
ANKRD54-204ENST00000411961 PTPRKQ15262 1439 aa30.39■■■□□ 2.46
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCC5O15440 1437 aa30.39■■■□□ 2.45
ANKRD54-204ENST00000411961 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.38■■■□□ 2.45
ANKRD54-204ENST00000411961 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
ANKRD54-204ENST00000411961 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.37■■■□□ 2.45
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