RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 MLECQ14165 292 aa23.62■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.62■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 MCCP23508 829 aa23.62■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 CFAP44Q96MT7 982 aa23.62■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.372e-6■■■□□ 17
USP25-204ENST00000400183 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 PKD2Q13563 968 aa23.59■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
USP25-204ENST00000400183 GGT6Q6P531 493 aa23.57■■□□□ 1.36
USP25-204ENST00000400183 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
USP25-204ENST00000400183 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.56■■□□□ 1.36
USP25-204ENST00000400183 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.56■■□□□ 1.36
USP25-204ENST00000400183 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
USP25-204ENST00000400183 SOGA1O94964 1423 aa23.55■■□□□ 1.36
USP25-204ENST00000400183 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.52■■□□□ 1.36
USP25-204ENST00000400183 STK26Q9P289 416 aa23.52■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 RALBP1Q15311 655 aa23.46■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.46■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 FOXD1Q16676 465 aa23.46■■□□□ 1.35
USP25-204ENST00000400183 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.44■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.44■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.43■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.43■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 APBB1O00213 710 aa23.42■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.42■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 NUP155O75694 1391 aa23.42■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.4■■□□□ 1.34
USP25-204ENST00000400183 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.39■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.38■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 FMN1Q68DA7 1419 aa23.37■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 DRC7Q8IY82 874 aa23.37■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.36■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 GBP4Q96PP9 640 aa23.35■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.34■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 PTMSP20962 102 aa23.33■■□□□ 1.33
USP25-204ENST00000400183 STK31Q9BXU1 1019 aa23.32■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.3■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.29■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.28■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.28■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 KIF3BO15066 747 aa23.27■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 CLSTN1O94985 981 aa23.27■■□□□ 1.32
USP25-204ENST00000400183 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.26■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 HMMRO75330 724 aa23.25■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.24■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 NLRP13Q86W25 1043 aa23.23■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.23■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.22■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 GORABQ5T7V8 394 aa23.21■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 GPATCH3Q96I76 525 aa23.21■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.2■■□□□ 1.31
USP25-204ENST00000400183 PDE3BQ13370 1112 aa23.2■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.19■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 ABCC8Q09428 1581 aa23.18■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.32e-6■■■■□ 25
USP25-204ENST00000400183 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 EID1Q9Y6B2 187 aa23.16■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.16■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.15■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.15■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.15■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
USP25-204ENST00000400183 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.14■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 SMARCA2P51531 1590 aa23.14■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.13■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.13■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.13■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.13■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.13■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 AMPHP49418 695 aa23.11■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 TPM4P67936 248 aa23.1■■□□□ 1.29
USP25-204ENST00000400183 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.09■■□□□ 1.29
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