RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.74■■■■■ 4.59
LMO2-202ENST00000395833 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.59
LMO2-202ENST00000395833 HFM1A2PYH4 1435 aa43.71■■■■■ 4.59
LMO2-202ENST00000395833 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.71■■■■■ 4.59
LMO2-202ENST00000395833 ABCC5O15440 1437 aa43.7■■■■■ 4.59
LMO2-202ENST00000395833 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.69■■■■■ 4.59
LMO2-202ENST00000395833 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.69■■■■■ 4.59
LMO2-202ENST00000395833 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.69■■■■■ 4.59
LMO2-202ENST00000395833 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.68■■■■■ 4.58
LMO2-202ENST00000395833 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.68■■■■■ 4.58
LMO2-202ENST00000395833 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
LMO2-202ENST00000395833 ASXL2Q76L83 1435 aa43.65■■■■■ 4.58
LMO2-202ENST00000395833 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.63■■■■■ 4.58
LMO2-202ENST00000395833 NAIPQ13075 1403 aa43.62■■■■■ 4.57
LMO2-202ENST00000395833 AKNAQ7Z591 1439 aa43.61■■■■■ 4.57
LMO2-202ENST00000395833 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.6■■■■■ 4.57
LMO2-202ENST00000395833 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.57■■■■■ 4.56
LMO2-202ENST00000395833 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.55■■■■■ 4.56
LMO2-202ENST00000395833 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.55■■■■■ 4.56
LMO2-202ENST00000395833 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.54■■■■■ 4.56
LMO2-202ENST00000395833 ROCK1Q13464 1354 aa43.54■■■■■ 4.56
LMO2-202ENST00000395833 PLCH2O75038 1416 aa43.53■■■■■ 4.56
LMO2-202ENST00000395833 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.47■■■■■ 4.55
LMO2-202ENST00000395833 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.46■■■■■ 4.55
LMO2-202ENST00000395833 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.45■■■■■ 4.55
LMO2-202ENST00000395833 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.45■■■■■ 4.55
LMO2-202ENST00000395833 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.45■■■■■ 4.55
LMO2-202ENST00000395833 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.43■■■■■ 4.54
LMO2-202ENST00000395833 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.42■■■■■ 4.54
LMO2-202ENST00000395833 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.42■■■■■ 4.54
LMO2-202ENST00000395833 MBD5Q9P267 1494 aa43.41■■■■■ 4.54
LMO2-202ENST00000395833 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.4■■■■■ 4.54
LMO2-202ENST00000395833 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.39■■■■■ 4.54
LMO2-202ENST00000395833 ADGRL2O95490 1459 aa43.39■■■■■ 4.54
LMO2-202ENST00000395833 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.38■■■■■ 4.54
LMO2-202ENST00000395833 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.36■■■■■ 4.53
LMO2-202ENST00000395833 TSPY4P0CV99 314 aa43.35■■■■■ 4.53
LMO2-202ENST00000395833 TSPY10P0CW01 314 aa43.35■■■■■ 4.53
LMO2-202ENST00000395833 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.34■■■■■ 4.53
LMO2-202ENST00000395833 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.34■■■■■ 4.53
LMO2-202ENST00000395833 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.34■■■■■ 4.53
LMO2-202ENST00000395833 NCOA1Q15788 1441 aa43.33■■■■■ 4.53
LMO2-202ENST00000395833 KDM6BO15054 1643 aa43.32■■■■■ 4.53
LMO2-202ENST00000395833 MAPKBP1O60336 1514 aa43.27■■■■■ 4.52
LMO2-202ENST00000395833 ABCC1P33527 1531 aa43.26■■■■■ 4.52
LMO2-202ENST00000395833 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.22■■■■■ 4.51
LMO2-202ENST00000395833 FANCAO15360 1455 aa43.22■■■■■ 4.51
LMO2-202ENST00000395833 TRIM52Q96A61 297 aa43.19■■■■■ 4.5
LMO2-202ENST00000395833 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.17■■■■■ 4.5
LMO2-202ENST00000395833 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
LMO2-202ENST00000395833 CD109Q6YHK3 1445 aa43.15■■■■■ 4.5
LMO2-202ENST00000395833 KIF15Q9NS87 1388 aa43.11■■■■■ 4.49
LMO2-202ENST00000395833 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.09■■■■■ 4.49
LMO2-202ENST00000395833 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.09■■■■■ 4.49
LMO2-202ENST00000395833 ADGRL1O94910 1474 aa43.05■■■■■ 4.48
LMO2-202ENST00000395833 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.02■■■■■ 4.48
LMO2-202ENST00000395833 PLXNC1O60486 1568 aa43■■■■■ 4.47
LMO2-202ENST00000395833 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.99■■■■■ 4.47
LMO2-202ENST00000395833 GLI2P10070 1586 aa42.96■■■■■ 4.47
LMO2-202ENST00000395833 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.95■■■■■ 4.47
LMO2-202ENST00000395833 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
LMO2-202ENST00000395833 AFAP1Q8N556 730 aa42.93■■■■■ 4.46
LMO2-202ENST00000395833 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.91■■■■■ 4.46
LMO2-202ENST00000395833 SIN3AQ96ST3 1273 aa42.9■■■■■ 4.46
LMO2-202ENST00000395833 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.46
LMO2-202ENST00000395833 DIP2BQ9P265 1576 aa42.88■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.87■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 NEUROD1Q13562 356 aa42.87■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.86■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.85■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.84■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 NEO1Q92859 1461 aa42.83■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 PZPP20742 1482 aa42.83■■■■■ 4.45
LMO2-202ENST00000395833 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
LMO2-202ENST00000395833 ATP7AQ04656 1500 aa42.79■■■■■ 4.44
LMO2-202ENST00000395833 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.78■■■■■ 4.44
LMO2-202ENST00000395833 NUP155O75694 1391 aa42.77■■■■■ 4.44
LMO2-202ENST00000395833 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.76■■■■■ 4.44
LMO2-202ENST00000395833 ERBINQ96RT1 1412 aa42.75■■■■■ 4.43
LMO2-202ENST00000395833 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.74■■■■■ 4.43
LMO2-202ENST00000395833 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.74■■■■■ 4.43
LMO2-202ENST00000395833 FOXD1Q16676 465 aa42.7■■■■■ 4.43
LMO2-202ENST00000395833 UNC13BO14795 1591 aa42.67■■■■■ 4.42
LMO2-202ENST00000395833 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa42.66■■■■■ 4.42
LMO2-202ENST00000395833 KDM5CP41229 1560 aa42.64■■■■■ 4.42
LMO2-202ENST00000395833 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.6■■■■■ 4.41
LMO2-202ENST00000395833 TONSLQ96HA7 1378 aa42.6■■■■■ 4.41
LMO2-202ENST00000395833 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.6■■■■■ 4.41
LMO2-202ENST00000395833 PKD2Q13563 968 aa42.6■■■■■ 4.41
LMO2-202ENST00000395833 TSPOAP1O95153 1857 aa42.59■■■■■ 4.41
LMO2-202ENST00000395833 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.57■■■■■ 4.41
LMO2-202ENST00000395833 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.56■■■■■ 4.4
LMO2-202ENST00000395833 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.56■■■■■ 4.4
LMO2-202ENST00000395833 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.55■■■■■ 4.4
LMO2-202ENST00000395833 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.55■■■■■ 4.4
LMO2-202ENST00000395833 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
LMO2-202ENST00000395833 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.53■■■■■ 4.4
LMO2-202ENST00000395833 RAPGEF3O95398 923 aa42.52■■■■■ 4.4
LMO2-202ENST00000395833 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.51■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms