RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 GPR153Q6NV75 609 aa10.58□□□□□ -0.72
C6orf48-208ENST00000395788 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.55□□□□□ -0.72
C6orf48-208ENST00000395788 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.55□□□□□ -0.72
C6orf48-208ENST00000395788 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.54□□□□□ -0.72
C6orf48-208ENST00000395788 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.51□□□□□ -0.73
C6orf48-208ENST00000395788 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.49□□□□□ -0.73
C6orf48-208ENST00000395788 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO3Q9UK99 471 aa10.46□□□□□ -0.73
C6orf48-208ENST00000395788 MICALL2Q8IY33 904 aa10.45□□□□□ -0.74
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL34Q8N239 644 aa10.45□□□□□ -0.74
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
C6orf48-208ENST00000395788 ARSIQ5FYB1 569 aa10.43□□□□□ -0.74
C6orf48-208ENST00000395788 HCSTQ9UBK5 93 aa10.43□□□□□ -0.74
C6orf48-208ENST00000395788 SMARCA4P51532 1647 aa10.43□□□□□ -0.74
C6orf48-208ENST00000395788 FKBP8Q14318 412 aa10.42□□□□□ -0.74
C6orf48-208ENST00000395788 PBX2P40425 430 aa10.39□□□□□ -0.75
C6orf48-208ENST00000395788 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.39□□□□□ -0.75
C6orf48-208ENST00000395788 WIZO95785 1651 aa10.37□□□□□ -0.75
C6orf48-208ENST00000395788 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.36□□□□□ -0.75
C6orf48-208ENST00000395788 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
C6orf48-208ENST00000395788 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.757e-13■■□□□ 12.8
C6orf48-208ENST00000395788 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.32□□□□□ -0.76
C6orf48-208ENST00000395788 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
C6orf48-208ENST00000395788 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.28□□□□□ -0.76
C6orf48-208ENST00000395788 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.27□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.27□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 SOX12O15370 315 aa10.26□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.25□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 SMARCA2P51531 1590 aa10.25□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 RGS20O76081 388 aa10.22□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 NUDT7P0C024 238 aa10.22□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 SPOCK2Q92563 424 aa10.21□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 LHX6Q9UPM6 363 aa10.21□□□□□ -0.77
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.21□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 NCAPD3P42695 1498 aa10.2□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.18□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 HMGXB3Q12766 1538 aa10.17□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP33O14559 1287 aa10.17□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 HRO43593 1189 aa10.16□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 TK2O00142 265 aa10.15□□□□□ -0.78
C6orf48-208ENST00000395788 KIF3CO14782 793 aa10.14□□□□□ -0.79
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM41Q8WV44 630 aa10.14□□□□□ -0.79
C6orf48-208ENST00000395788 SLC34A2O95436 690 aa10.13□□□□□ -0.79
C6orf48-208ENST00000395788 IFFO2Q5TF58 517 aa10.13□□□□□ -0.79
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.13□□□□□ -0.79
C6orf48-208ENST00000395788 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
C6orf48-208ENST00000395788 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
C6orf48-208ENST00000395788 C2orf72A6NCS6 295 aa10.08□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.07□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP6P59044 892 aa10.05□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.04□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.04□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0G2JS52 829 aa10.03□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 PSEN2P49810 448 aa10.03□□□□□ -0.8
C6orf48-208ENST00000395788 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.01□□□□□ -0.81
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.01□□□□□ -0.81
C6orf48-208ENST00000395788 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
C6orf48-208ENST00000395788 STAC3Q96MF2 364 aa10□□□□□ -0.81
C6orf48-208ENST00000395788 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN5P54829 565 aa9.97□□□□□ -0.81
C6orf48-208ENST00000395788 CFTRP13569 1480 aa9.97□□□□□ -0.81
C6orf48-208ENST00000395788 ABCC8Q09428 1581 aa9.95□□□□□ -0.82
C6orf48-208ENST00000395788 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.829e-10■□□□□ 10.9
C6orf48-208ENST00000395788 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.92□□□□□ -0.82
C6orf48-208ENST00000395788 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.91□□□□□ -0.82
C6orf48-208ENST00000395788 Q6ZNB5 142 aa9.91□□□□□ -0.82
C6orf48-208ENST00000395788 TMC2Q8TDI7 906 aa9.91□□□□□ -0.82
C6orf48-208ENST00000395788 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
C6orf48-208ENST00000395788 MFRPQ9BY79 579 aa9.91□□□□□ -0.82
C6orf48-208ENST00000395788 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.91□□□□□ -0.82
C6orf48-208ENST00000395788 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.89□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 KCNK17Q96T54 332 aa9.87□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 SYNJ1O43426 1573 aa9.87□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 KCNH8Q96L42 1107 aa9.86□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 TOP2BQ02880 1626 aa9.85□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 PRDM2Q13029 1718 aa9.85□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 EEA1Q15075 1411 aa9.85□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.84□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.84□□□□□ -0.83
C6orf48-208ENST00000395788 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.83□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 CUX1P39880 1505 aa9.82□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 SOGA1O94964 1423 aa9.81□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.8□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 WNT2BQ93097 391 aa9.79□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 STK24Q9Y6E0 443 aa9.79□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 LCE2BO14633 110 aa9.78□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
C6orf48-208ENST00000395788 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms