RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393888.1

CNP-201, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNP, Length 2,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNP-201ENST00000393888 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.36■■□□□ 1.17
CNP-201ENST00000393888 NCOA1Q15788 1441 aa22.36■■□□□ 1.17
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CNP-201ENST00000393888 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.35■■□□□ 1.17
CNP-201ENST00000393888 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.35■■□□□ 1.17
CNP-201ENST00000393888 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.34■■□□□ 1.17
CNP-201ENST00000393888 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.33■■□□□ 1.17
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CNP-201ENST00000393888 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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CNP-201ENST00000393888 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.11■■□□□ 1.13
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CNP-201ENST00000393888 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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CNP-201ENST00000393888 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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CNP-201ENST00000393888 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CNP-201ENST00000393888 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CNP-201ENST00000393888 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.77■■□□□ 1.08
CNP-201ENST00000393888 MS4A1P11836 297 aa21.76■■□□□ 1.07
CNP-201ENST00000393888 NUP160Q12769 1436 aa21.76■■□□□ 1.07
CNP-201ENST00000393888 IQGAP2Q13576 1575 aa21.76■■□□□ 1.07
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