RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393766.6

MSMO1-202, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSMO1, Length 1,789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-202ENST00000393766 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.6■■□□□ 1.53
MSMO1-202ENST00000393766 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.6■■□□□ 1.53
MSMO1-202ENST00000393766 PTPRKQ15262 1439 aa24.59■■□□□ 1.53
MSMO1-202ENST00000393766 ASXL2Q76L83 1435 aa24.58■■□□□ 1.53
MSMO1-202ENST00000393766 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.57■■□□□ 1.52
MSMO1-202ENST00000393766 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
MSMO1-202ENST00000393766 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.55■■□□□ 1.52
MSMO1-202ENST00000393766 DAPK1P53355 1430 aa24.54■■□□□ 1.52
MSMO1-202ENST00000393766 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.54■■□□□ 1.52
MSMO1-202ENST00000393766 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.54■■□□□ 1.52
MSMO1-202ENST00000393766 ABCC5O15440 1437 aa24.5■■□□□ 1.51
MSMO1-202ENST00000393766 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
MSMO1-202ENST00000393766 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.49■■□□□ 1.51
MSMO1-202ENST00000393766 HFM1A2PYH4 1435 aa24.47■■□□□ 1.51
MSMO1-202ENST00000393766 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.47■■□□□ 1.51
MSMO1-202ENST00000393766 PLCH2O75038 1416 aa24.47■■□□□ 1.51
MSMO1-202ENST00000393766 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.47■■□□□ 1.51
MSMO1-202ENST00000393766 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.46■■□□□ 1.51
MSMO1-202ENST00000393766 NAIPQ13075 1403 aa24.44■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.44■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.42■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.42■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 AKNAQ7Z591 1439 aa24.41■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.41■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.4■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 ROCK1Q13464 1354 aa24.39■■□□□ 1.5
MSMO1-202ENST00000393766 MAPKBP1O60336 1514 aa24.39■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.38■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.38■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 MBD5Q9P267 1494 aa24.37■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.36■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 TSPY4P0CV99 314 aa24.36■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 TSPY10P0CW01 314 aa24.36■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.35■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.35■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.33■■□□□ 1.49
MSMO1-202ENST00000393766 FANCAO15360 1455 aa24.33■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.33■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 ABCC1P33527 1531 aa24.32■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 ADGRL2O95490 1459 aa24.32■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.32■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 KDM6BO15054 1643 aa24.31■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 NCOA1Q15788 1441 aa24.31■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 CD109Q6YHK3 1445 aa24.3■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.29■■□□□ 1.48
MSMO1-202ENST00000393766 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.25■■□□□ 1.47
MSMO1-202ENST00000393766 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.24■■□□□ 1.47
MSMO1-202ENST00000393766 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.24■■□□□ 1.47
MSMO1-202ENST00000393766 TRIM52Q96A61 297 aa24.24■■□□□ 1.47
MSMO1-202ENST00000393766 ADGRL1O94910 1474 aa24.23■■□□□ 1.47
MSMO1-202ENST00000393766 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.22■■□□□ 1.47
MSMO1-202ENST00000393766 GLI2P10070 1586 aa24.2■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 KIF15Q9NS87 1388 aa24.2■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 DIP2BQ9P265 1576 aa24.2■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.2■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.18■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.17■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.17■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 AFAP1Q8N556 730 aa24.16■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 PLXNC1O60486 1568 aa24.16■■□□□ 1.46
MSMO1-202ENST00000393766 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
MSMO1-202ENST00000393766 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.11■■□□□ 1.45
MSMO1-202ENST00000393766 NEO1Q92859 1461 aa24.11■■□□□ 1.45
MSMO1-202ENST00000393766 TSPOAP1O95153 1857 aa24.11■■□□□ 1.45
MSMO1-202ENST00000393766 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.09■■□□□ 1.45
MSMO1-202ENST00000393766 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.08■■□□□ 1.45
MSMO1-202ENST00000393766 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.07■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 ATP7AQ04656 1500 aa24.07■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.07■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.06■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.06■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.04■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 NEUROD1Q13562 356 aa24.02■■□□□ 1.44
MSMO1-202ENST00000393766 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.01■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 NUP155O75694 1391 aa24■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 ERBINQ96RT1 1412 aa24■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 PZPP20742 1482 aa24■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.99■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 KDM5CP41229 1560 aa23.99■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.99■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.97■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 RAPGEF3O95398 923 aa23.96■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 FOXD1Q16676 465 aa23.96■■□□□ 1.43
MSMO1-202ENST00000393766 UNC13BO14795 1591 aa23.95■■□□□ 1.42
MSMO1-202ENST00000393766 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.95■■□□□ 1.42
MSMO1-202ENST00000393766 RICTORQ6R327 1708 aa23.94■■□□□ 1.42
MSMO1-202ENST00000393766 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.421e-6■■□□□ 13.8
MSMO1-202ENST00000393766 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.93■■□□□ 1.42
MSMO1-202ENST00000393766 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.92■■□□□ 1.42
MSMO1-202ENST00000393766 PKD2Q13563 968 aa23.9■■□□□ 1.42
MSMO1-202ENST00000393766 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.89■■□□□ 1.41
MSMO1-202ENST00000393766 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
MSMO1-202ENST00000393766 ABCA6Q8N139 1617 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 246.3 ms