RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.51■■■■■ 4.56
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GNPTAB-202ENST00000392919 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.46■■■■■ 4.55
GNPTAB-202ENST00000392919 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.46■■■■■ 4.55
GNPTAB-202ENST00000392919 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.44■■■■■ 4.54
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.42■■■■■ 4.54
GNPTAB-202ENST00000392919 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.42■■■■■ 4.54
GNPTAB-202ENST00000392919 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.39■■■■■ 4.54
GNPTAB-202ENST00000392919 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.37■■■■■ 4.53
GNPTAB-202ENST00000392919 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.35■■■■■ 4.53
GNPTAB-202ENST00000392919 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.33■■■■■ 4.53
GNPTAB-202ENST00000392919 PREX2Q70Z35 1606 aa43.32■■■■■ 4.53
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPRMP28827 1452 aa43.32■■■■■ 4.52
GNPTAB-202ENST00000392919 MADDQ8WXG6 1647 aa43.31■■■■■ 4.52
GNPTAB-202ENST00000392919 AFAP1Q8N556 730 aa43.26■■■■■ 4.52
GNPTAB-202ENST00000392919 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.25■■■■■ 4.51
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.24■■■■■ 4.51
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GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.2■■■■■ 4.51
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP10AO60312 1499 aa43.18■■■■■ 4.5
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GNPTAB-202ENST00000392919 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.14■■■■■ 4.5
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GNPTAB-202ENST00000392919 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
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GNPTAB-202ENST00000392919 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.11■■■■■ 4.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.08■■■■■ 4.49
GNPTAB-202ENST00000392919 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.08■■■■■ 4.49
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
GNPTAB-202ENST00000392919 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.05■■■■■ 4.48
GNPTAB-202ENST00000392919 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.04■■■■■ 4.48
GNPTAB-202ENST00000392919 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.03■■■■■ 4.48
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCA6Q8N139 1617 aa43■■■■■ 4.47
GNPTAB-202ENST00000392919 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.99■■■■■ 4.47
GNPTAB-202ENST00000392919 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.99■■■■■ 4.47
GNPTAB-202ENST00000392919 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.98■■■■■ 4.47
GNPTAB-202ENST00000392919 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.96■■■■■ 4.47
GNPTAB-202ENST00000392919 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
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GNPTAB-202ENST00000392919 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.93■■■■■ 4.46
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GNPTAB-202ENST00000392919 TIAM1Q13009 1591 aa42.9■■■■■ 4.46
GNPTAB-202ENST00000392919 REREQ9P2R6 1566 aa42.9■■■■■ 4.46
GNPTAB-202ENST00000392919 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.85■■■■■ 4.45
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.83■■■■■ 4.45
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.8■■■■■ 4.44
GNPTAB-202ENST00000392919 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
GNPTAB-202ENST00000392919 AGLP35573 1532 aa42.76■■■■■ 4.44
GNPTAB-202ENST00000392919 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
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GNPTAB-202ENST00000392919 MAP3K1Q13233 1512 aa42.72■■■■■ 4.43
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GNPTAB-202ENST00000392919 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.43
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GNPTAB-202ENST00000392919 MBD5Q9P267 1494 aa42.66■■■■■ 4.42
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.63■■■■■ 4.42
GNPTAB-202ENST00000392919 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
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GNPTAB-202ENST00000392919 A2MP01023 1474 aa42.55■■■■■ 4.4
GNPTAB-202ENST00000392919 C3P01024 1663 aa42.54■■■■■ 4.4
GNPTAB-202ENST00000392919 PLXNC1O60486 1568 aa42.54■■■■■ 4.4
GNPTAB-202ENST00000392919 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.54■■■■■ 4.4
GNPTAB-202ENST00000392919 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
GNPTAB-202ENST00000392919 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
GNPTAB-202ENST00000392919 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.53■■■■■ 4.4
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.46■■■■■ 4.39
GNPTAB-202ENST00000392919 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.45■■■■■ 4.39
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.43■■■■■ 4.38
GNPTAB-202ENST00000392919 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.43■■■■■ 4.38
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GNPTAB-202ENST00000392919 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.37■■■■■ 4.37
GNPTAB-202ENST00000392919 GGT6Q6P531 493 aa42.37■■■■■ 4.37
GNPTAB-202ENST00000392919 MROH2AA6NES4 1674 aa42.35■■■■■ 4.37
GNPTAB-202ENST00000392919 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.34■■■■■ 4.37
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.34■■■■■ 4.37
GNPTAB-202ENST00000392919 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
GNPTAB-202ENST00000392919 ZMYM3Q14202 1370 aa42.33■■■■■ 4.37
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GNPTAB-202ENST00000392919 TSPY4P0CV99 314 aa42.22■■■■■ 4.35
GNPTAB-202ENST00000392919 TSPY10P0CW01 314 aa42.22■■■■■ 4.35
GNPTAB-202ENST00000392919 STRCQ7RTU9 1775 aa42.21■■■■■ 4.35
GNPTAB-202ENST00000392919 NPATQ14207 1427 aa42.2■■■■■ 4.35
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF3BO15066 747 aa42.19■■■■■ 4.34
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.17■■■■■ 4.34
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPRKQ15262 1439 aa42.13■■■■■ 4.34
GNPTAB-202ENST00000392919 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.13■■■■■ 4.33
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXO41Q8TF61 875 aa42.06■■■■■ 4.32
GNPTAB-202ENST00000392919 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.03■■■■■ 4.32
GNPTAB-202ENST00000392919 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.02■■■■■ 4.32
GNPTAB-202ENST00000392919 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.01■■■■■ 4.32
GNPTAB-202ENST00000392919 KDM5DQ9BY66 1539 aa42■■■■■ 4.31
GNPTAB-202ENST00000392919 NCOA1Q15788 1441 aa41.98■■■■■ 4.31
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