RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
HOXD13-201ENST00000392539 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
HOXD13-201ENST00000392539 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.94■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 CEP170Q5SW79 1584 aa36.93■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 SYNJ2O15056 1496 aa36.93■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.92■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.92■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.91■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 ERCC6Q03468 1493 aa36.91■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.9■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXD13-201ENST00000392539 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
HOXD13-201ENST00000392539 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.86■■■■□ 3.49
HOXD13-201ENST00000392539 FOXD1Q16676 465 aa36.86■■■■□ 3.49
HOXD13-201ENST00000392539 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
HOXD13-201ENST00000392539 FKBP8Q14318 412 aa36.85■■■■□ 3.49
HOXD13-201ENST00000392539 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.82■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.81■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.81■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 NEFLP07196 543 aa36.81■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.81■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 KIF14Q15058 1648 aa36.78■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.78■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 NUP160Q12769 1436 aa36.76■■■■□ 3.48
HOXD13-201ENST00000392539 ADGRL2O95490 1459 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXD13-201ENST00000392539 NCOA1Q15788 1441 aa36.75■■■■□ 3.47
HOXD13-201ENST00000392539 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXD13-201ENST00000392539 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
HOXD13-201ENST00000392539 PZPP20742 1482 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXD13-201ENST00000392539 BCANQ96GW7 911 aa36.7■■■■□ 3.47
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC7Q96M83 1385 aa36.69■■■■□ 3.46
HOXD13-201ENST00000392539 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.68■■■■□ 3.46
HOXD13-201ENST00000392539 JPH4Q96JJ6 628 aa36.68■■■■□ 3.46
HOXD13-201ENST00000392539 FBLN2P98095 1184 aa36.65■■■■□ 3.46
HOXD13-201ENST00000392539 ABCA8O94911 1581 aa36.63■■■■□ 3.45
HOXD13-201ENST00000392539 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.62■■■■□ 3.45
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.62■■■■□ 3.45
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.61■■■■□ 3.45
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
HOXD13-201ENST00000392539 MBD5Q9P267 1494 aa36.54■■■■□ 3.44
HOXD13-201ENST00000392539 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.54■■■■□ 3.44
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.53■■■■□ 3.44
HOXD13-201ENST00000392539 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.53■■■■□ 3.44
HOXD13-201ENST00000392539 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
HOXD13-201ENST00000392539 ATP10BO94823 1461 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXD13-201ENST00000392539 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXD13-201ENST00000392539 PKD2Q13563 968 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXD13-201ENST00000392539 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.42■■■■□ 3.42
HOXD13-201ENST00000392539 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.39■■■■□ 3.42
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC184Q52MB2 194 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXD13-201ENST00000392539 MRS2Q9HD23 443 aa36.32■■■■□ 3.41
HOXD13-201ENST00000392539 KDM5CP41229 1560 aa36.32■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 TSPY4P0CV99 314 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 TSPY10P0CW01 314 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 NUP155O75694 1391 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 USP47Q96K76 1375 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
HOXD13-201ENST00000392539 PTPRGP23470 1445 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 FAM9BQ8IZU0 186 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 PREX2Q70Z35 1606 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 KIF15Q9NS87 1388 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 ERICH6BQ5W0A0 696 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXD13-201ENST00000392539 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXD13-201ENST00000392539 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
HOXD13-201ENST00000392539 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXD13-201ENST00000392539 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
HOXD13-201ENST00000392539 CHD1O14646 1710 aa36.11■■■■□ 3.37
HOXD13-201ENST00000392539 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
HOXD13-201ENST00000392539 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
HOXD13-201ENST00000392539 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXD13-201ENST00000392539 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXD13-201ENST00000392539 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXD13-201ENST00000392539 SHROOM2Q13796 1616 aa36.05■■■■□ 3.36
HOXD13-201ENST00000392539 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXD13-201ENST00000392539 PPP4R2Q9NY27 417 aa36■■■■□ 3.35
HOXD13-201ENST00000392539 UNC13BO14795 1591 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXD13-201ENST00000392539 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXD13-201ENST00000392539 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXD13-201ENST00000392539 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXD13-201ENST00000392539 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms