RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381124.9

H2AFV-205, Transcript of H2A histone family member V, human

TSL 3 BASIC

Gene H2AFV, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
H2AFV-205	ENST00000381124	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.1	■■■■■ 4.49
H2AFV-205	ENST00000381124	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.09	■■■■■ 4.49
H2AFV-205	ENST00000381124	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		43.07	■■■■■ 4.48
H2AFV-205	ENST00000381124	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		43.07	■■■■■ 4.48
H2AFV-205	ENST00000381124	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.01	■■■■■ 4.48
H2AFV-205	ENST00000381124	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43	■■■■■ 4.47
H2AFV-205	ENST00000381124	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43	■■■■■ 4.47
H2AFV-205	ENST00000381124	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.99	■■■■■ 4.47
H2AFV-205	ENST00000381124	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.98	■■■■■ 4.47
H2AFV-205	ENST00000381124	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.98	■■■■■ 4.47
H2AFV-205	ENST00000381124	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.92	■■■■■ 4.46
H2AFV-205	ENST00000381124	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.92	■■■■■ 4.46
H2AFV-205	ENST00000381124	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.9	■■■■■ 4.46
H2AFV-205	ENST00000381124	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
H2AFV-205	ENST00000381124	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.88	■■■■■ 4.45
H2AFV-205	ENST00000381124	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
H2AFV-205	ENST00000381124	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.85	■■■■■ 4.45
H2AFV-205	ENST00000381124	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.85	■■■■■ 4.45
H2AFV-205	ENST00000381124	ABCC1	P33527	1531 aa		42.83	■■■■■ 4.45
H2AFV-205	ENST00000381124	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.83	■■■■■ 4.45
H2AFV-205	ENST00000381124	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.8	■■■■■ 4.44
H2AFV-205	ENST00000381124	KDM5C	P41229	1560 aa		42.79	■■■■■ 4.44
H2AFV-205	ENST00000381124	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.79	■■■■■ 4.44
H2AFV-205	ENST00000381124	ATP10A	O60312	1499 aa		42.79	■■■■■ 4.44
H2AFV-205	ENST00000381124	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.79	■■■■■ 4.44
H2AFV-205	ENST00000381124	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
H2AFV-205	ENST00000381124	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.78	■■■■■ 4.44
H2AFV-205	ENST00000381124	PTPRM	P28827	1452 aa		42.75	■■■■■ 4.43
H2AFV-205	ENST00000381124	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.75	■■■■■ 4.43
H2AFV-205	ENST00000381124	MLEC	Q14165	292 aa		42.75	■■■■■ 4.43
H2AFV-205	ENST00000381124	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.75	■■■■■ 4.43
H2AFV-205	ENST00000381124	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.73	■■■■■ 4.43
H2AFV-205	ENST00000381124	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.73	■■■■■ 4.43
H2AFV-205	ENST00000381124	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.71	■■■■■ 4.43
H2AFV-205	ENST00000381124	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.7	■■■■■ 4.43
H2AFV-205	ENST00000381124	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.68	■■■■■ 4.42
H2AFV-205	ENST00000381124	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.66	■■■■■ 4.42	3e-6	■□□□□ 11
H2AFV-205	ENST00000381124	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.65	■■■■■ 4.42
H2AFV-205	ENST00000381124	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.64	■■■■■ 4.42
H2AFV-205	ENST00000381124	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.62	■■■■■ 4.41
H2AFV-205	ENST00000381124	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.61	■■■■■ 4.41
H2AFV-205	ENST00000381124	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
H2AFV-205	ENST00000381124	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.58	■■■■■ 4.41
H2AFV-205	ENST00000381124	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.58	■■■■■ 4.41
H2AFV-205	ENST00000381124	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.57	■■■■■ 4.4
H2AFV-205	ENST00000381124	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.56	■■■■■ 4.4
H2AFV-205	ENST00000381124	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
H2AFV-205	ENST00000381124	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.54	■■■■■ 4.4
H2AFV-205	ENST00000381124	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
H2AFV-205	ENST00000381124	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.5	■■■■■ 4.39
H2AFV-205	ENST00000381124	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.49	■■■■■ 4.39
H2AFV-205	ENST00000381124	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.48	■■■■■ 4.39
H2AFV-205	ENST00000381124	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.45	■■■■■ 4.39
H2AFV-205	ENST00000381124	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.42	■■■■■ 4.38
H2AFV-205	ENST00000381124	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.41	■■■■■ 4.38
H2AFV-205	ENST00000381124	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.39	■■■■■ 4.38
H2AFV-205	ENST00000381124	AGL	P35573	1532 aa		42.38	■■■■■ 4.37
H2AFV-205	ENST00000381124	APLP2	Q06481	763 aa		42.38	■■■■■ 4.37
H2AFV-205	ENST00000381124	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.36	■■■■■ 4.37
H2AFV-205	ENST00000381124	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.32	■■■■■ 4.37
H2AFV-205	ENST00000381124	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.32	■■■■■ 4.37
H2AFV-205	ENST00000381124	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
H2AFV-205	ENST00000381124	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
H2AFV-205	ENST00000381124	A2M	P01023	1474 aa		42.24	■■■■■ 4.35
H2AFV-205	ENST00000381124	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.24	■■■■■ 4.35
H2AFV-205	ENST00000381124	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.23	■■■■■ 4.35
H2AFV-205	ENST00000381124	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.21	■■■■■ 4.35
H2AFV-205	ENST00000381124	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.19	■■■■■ 4.34
H2AFV-205	ENST00000381124	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.15	■■■■■ 4.34
H2AFV-205	ENST00000381124	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.14	■■■■■ 4.34
H2AFV-205	ENST00000381124	HSPA2	P54652	639 aa		42.13	■■■■■ 4.33
H2AFV-205	ENST00000381124	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.11	■■■■■ 4.33
H2AFV-205	ENST00000381124	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.11	■■■■■ 4.33
H2AFV-205	ENST00000381124	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.11	■■■■■ 4.33
H2AFV-205	ENST00000381124	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.11	■■■■■ 4.33
H2AFV-205	ENST00000381124	GGT6	Q6P531	493 aa		42.1	■■■■■ 4.33
H2AFV-205	ENST00000381124	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.1	■■■■■ 4.33
H2AFV-205	ENST00000381124	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.09	■■■■■ 4.33
H2AFV-205	ENST00000381124	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
H2AFV-205	ENST00000381124	C3	P01024	1663 aa		42.03	■■■■■ 4.32
H2AFV-205	ENST00000381124	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.98	■■■■■ 4.31
H2AFV-205	ENST00000381124	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		41.96	■■■■■ 4.31
H2AFV-205	ENST00000381124	KIF3B	O15066	747 aa		41.95	■■■■■ 4.31
H2AFV-205	ENST00000381124	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.95	■■■■■ 4.31
H2AFV-205	ENST00000381124	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.91	■■■■■ 4.3
H2AFV-205	ENST00000381124	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.9	■■■■■ 4.3
H2AFV-205	ENST00000381124	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.9	■■■■■ 4.3
H2AFV-205	ENST00000381124	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	41.88	■■■■■ 4.29
H2AFV-205	ENST00000381124	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.86	■■■■■ 4.29
H2AFV-205	ENST00000381124	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.86	■■■■■ 4.29
H2AFV-205	ENST00000381124	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.85	■■■■■ 4.29
H2AFV-205	ENST00000381124	NPAT	Q14207	1427 aa		41.81	■■■■■ 4.28
H2AFV-205	ENST00000381124	ABCC5	O15440	1437 aa		41.77	■■■■■ 4.28
H2AFV-205	ENST00000381124	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.74	■■■■■ 4.27
H2AFV-205	ENST00000381124	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.73	■■■■■ 4.27
H2AFV-205	ENST00000381124	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.72	■■■■■ 4.27
H2AFV-205	ENST00000381124	DAPK1	P53355	1430 aa		41.7	■■■■■ 4.27
H2AFV-205	ENST00000381124	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.7	■■■■■ 4.27
H2AFV-205	ENST00000381124	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.69	■■■■■ 4.26
H2AFV-205	ENST00000381124	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	41.66	■■■■■ 4.26

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