RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380305.4

PSMG4-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PSMG4, Length 489 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4-202ENST00000380305 PREX2Q70Z35 1606 aa41.95■■■■■ 4.31
PSMG4-202ENST00000380305 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.94■■■■■ 4.3
PSMG4-202ENST00000380305 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.92■■■■■ 4.3
PSMG4-202ENST00000380305 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.9■■■■■ 4.3
PSMG4-202ENST00000380305 RICTORQ6R327 1708 aa41.89■■■■■ 4.3
PSMG4-202ENST00000380305 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
PSMG4-202ENST00000380305 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.85■■■■■ 4.29
PSMG4-202ENST00000380305 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.82■■■■■ 4.29
PSMG4-202ENST00000380305 MAP3K1Q13233 1512 aa41.81■■■■■ 4.28
PSMG4-202ENST00000380305 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.78■■■■■ 4.28
PSMG4-202ENST00000380305 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.75■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 APLP2Q06481 763 aa41.73■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 NCOA2Q15596 1464 aa41.72■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 ABCC1P33527 1531 aa41.72■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.7■■■■■ 4.27
PSMG4-202ENST00000380305 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.69■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.67■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 AFAP1Q8N556 730 aa41.67■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.67■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.67■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.66■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.66■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.64■■■■■ 4.26
PSMG4-202ENST00000380305 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.62■■■■■ 4.25
PSMG4-202ENST00000380305 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.61■■■■■ 4.25
PSMG4-202ENST00000380305 KDM5CP41229 1560 aa41.6■■■■■ 4.25
PSMG4-202ENST00000380305 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.58■■■■■ 4.25
PSMG4-202ENST00000380305 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.58■■■■■ 4.25
PSMG4-202ENST00000380305 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.249e-8■■■□□ 14.6
PSMG4-202ENST00000380305 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.54■■■■■ 4.24
PSMG4-202ENST00000380305 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.54■■■■■ 4.24
PSMG4-202ENST00000380305 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
PSMG4-202ENST00000380305 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.51■■■■■ 4.24
PSMG4-202ENST00000380305 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
PSMG4-202ENST00000380305 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.47■■■■■ 4.23
PSMG4-202ENST00000380305 ATP10AO60312 1499 aa41.45■■■■■ 4.23
PSMG4-202ENST00000380305 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.4■■■■■ 4.22
PSMG4-202ENST00000380305 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.4■■■■■ 4.22
PSMG4-202ENST00000380305 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
PSMG4-202ENST00000380305 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.38■■■■■ 4.22
PSMG4-202ENST00000380305 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.37■■■■■ 4.21
PSMG4-202ENST00000380305 MBD5Q9P267 1494 aa41.37■■■■■ 4.21
PSMG4-202ENST00000380305 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.36■■■■■ 4.21
PSMG4-202ENST00000380305 ABCA6Q8N139 1617 aa41.36■■■■■ 4.21
PSMG4-202ENST00000380305 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.35■■■■■ 4.21
PSMG4-202ENST00000380305 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.34■■■■■ 4.21
PSMG4-202ENST00000380305 MIA2Q96PC5 1412 aa41.31■■■■■ 4.2
PSMG4-202ENST00000380305 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.3■■■■■ 4.2
PSMG4-202ENST00000380305 ATP7AQ04656 1500 aa41.28■■■■■ 4.2
PSMG4-202ENST00000380305 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
PSMG4-202ENST00000380305 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.25■■■■■ 4.19
PSMG4-202ENST00000380305 REREQ9P2R6 1566 aa41.25■■■■■ 4.19
PSMG4-202ENST00000380305 MLECQ14165 292 aa41.23■■■■■ 4.19
PSMG4-202ENST00000380305 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.23■■■■■ 4.19
PSMG4-202ENST00000380305 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.2■■■■■ 4.19
PSMG4-202ENST00000380305 MADDQ8WXG6 1647 aa41.19■■■■■ 4.18
PSMG4-202ENST00000380305 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.15■■■■■ 4.18
PSMG4-202ENST00000380305 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.14■■■■■ 4.18
PSMG4-202ENST00000380305 AGLP35573 1532 aa41.13■■■■■ 4.17
PSMG4-202ENST00000380305 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.11■■■■■ 4.17
PSMG4-202ENST00000380305 PTPRMP28827 1452 aa41.1■■■■■ 4.17
PSMG4-202ENST00000380305 TSPY4P0CV99 314 aa41.1■■■■■ 4.17
PSMG4-202ENST00000380305 TSPY10P0CW01 314 aa41.1■■■■■ 4.17
PSMG4-202ENST00000380305 A2MP01023 1474 aa41.08■■■■■ 4.17
PSMG4-202ENST00000380305 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
PSMG4-202ENST00000380305 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.04■■■■■ 4.16
PSMG4-202ENST00000380305 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
PSMG4-202ENST00000380305 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.03■■■■■ 4.16
PSMG4-202ENST00000380305 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
PSMG4-202ENST00000380305 PLXNC1O60486 1568 aa41.02■■■■■ 4.16
PSMG4-202ENST00000380305 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.97■■■■■ 4.15
PSMG4-202ENST00000380305 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
PSMG4-202ENST00000380305 ABCC5O15440 1437 aa40.93■■■■■ 4.14
PSMG4-202ENST00000380305 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.91■■■■■ 4.14
PSMG4-202ENST00000380305 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
PSMG4-202ENST00000380305 DAPK1P53355 1430 aa40.89■■■■■ 4.14
PSMG4-202ENST00000380305 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
PSMG4-202ENST00000380305 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
PSMG4-202ENST00000380305 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.87■■■■■ 4.13
PSMG4-202ENST00000380305 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.86■■■■■ 4.13
PSMG4-202ENST00000380305 GGT6Q6P531 493 aa40.83■■■■■ 4.13
PSMG4-202ENST00000380305 KIF3BO15066 747 aa40.79■■■■■ 4.12
PSMG4-202ENST00000380305 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.77■■■■■ 4.12
PSMG4-202ENST00000380305 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
PSMG4-202ENST00000380305 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.74■■■■■ 4.11
PSMG4-202ENST00000380305 KIF15Q9NS87 1388 aa40.72■■■■■ 4.11
PSMG4-202ENST00000380305 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.71■■■■■ 4.11
PSMG4-202ENST00000380305 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.7■■■■■ 4.11
PSMG4-202ENST00000380305 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.7■■■■■ 4.11
PSMG4-202ENST00000380305 C3P01024 1663 aa40.67■■■■■ 4.1
PSMG4-202ENST00000380305 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.67■■■■■ 4.1
PSMG4-202ENST00000380305 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
PSMG4-202ENST00000380305 MROH2AA6NES4 1674 aa40.64■■■■■ 4.1
PSMG4-202ENST00000380305 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
PSMG4-202ENST00000380305 ZMYM3Q14202 1370 aa40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms