RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376471.8

C6orf136-202, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C6orf136, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-202ENST00000376471 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.27■■□□□ 1.32
C6orf136-202ENST00000376471 AFAP1Q8N556 730 aa23.27■■□□□ 1.32
C6orf136-202ENST00000376471 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.27■■□□□ 1.32
C6orf136-202ENST00000376471 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.27■■□□□ 1.32
C6orf136-202ENST00000376471 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.27■■□□□ 1.32
C6orf136-202ENST00000376471 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
C6orf136-202ENST00000376471 MADDQ8WXG6 1647 aa23.24■■□□□ 1.31
C6orf136-202ENST00000376471 MLECQ14165 292 aa23.24■■□□□ 1.31
C6orf136-202ENST00000376471 CLIP1P30622 1438 aa23.24■■□□□ 1.31
C6orf136-202ENST00000376471 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.23■■□□□ 1.31
C6orf136-202ENST00000376471 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.22■■□□□ 1.31
C6orf136-202ENST00000376471 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.2■■□□□ 1.3
C6orf136-202ENST00000376471 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.2■■□□□ 1.3
C6orf136-202ENST00000376471 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.19■■□□□ 1.3
C6orf136-202ENST00000376471 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.16■■□□□ 1.3
C6orf136-202ENST00000376471 ATP10AO60312 1499 aa23.16■■□□□ 1.3
C6orf136-202ENST00000376471 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.16■■□□□ 1.3
C6orf136-202ENST00000376471 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.14■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.14■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.13■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.11■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.1■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.1■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.1■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 HSPA2P54652 639 aa23.09■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 KDM5CP41229 1560 aa23.08■■□□□ 1.29
C6orf136-202ENST00000376471 PREX2Q70Z35 1606 aa23.06■■□□□ 1.28
C6orf136-202ENST00000376471 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
C6orf136-202ENST00000376471 ABCC1P33527 1531 aa23.04■■□□□ 1.28
C6orf136-202ENST00000376471 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.04■■□□□ 1.28
C6orf136-202ENST00000376471 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
C6orf136-202ENST00000376471 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.03■■□□□ 1.28
C6orf136-202ENST00000376471 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.02■■□□□ 1.28
C6orf136-202ENST00000376471 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.02■■□□□ 1.28
C6orf136-202ENST00000376471 CEP162Q5TB80 1403 aa23■■□□□ 1.27
C6orf136-202ENST00000376471 ABCA6Q8N139 1617 aa22.98■■□□□ 1.27
C6orf136-202ENST00000376471 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
C6orf136-202ENST00000376471 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
C6orf136-202ENST00000376471 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.97■■□□□ 1.27
C6orf136-202ENST00000376471 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.97■■□□□ 1.27
C6orf136-202ENST00000376471 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.96■■□□□ 1.27
C6orf136-202ENST00000376471 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.96■■□□□ 1.27
C6orf136-202ENST00000376471 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.95■■□□□ 1.26
C6orf136-202ENST00000376471 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.93■■□□□ 1.26
C6orf136-202ENST00000376471 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.93■■□□□ 1.26
C6orf136-202ENST00000376471 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
C6orf136-202ENST00000376471 REREQ9P2R6 1566 aa22.9■■□□□ 1.26
C6orf136-202ENST00000376471 CERKQ8TCT0 537 aa22.89■■□□□ 1.25
C6orf136-202ENST00000376471 AGLP35573 1532 aa22.88■■□□□ 1.25
C6orf136-202ENST00000376471 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.88■■□□□ 1.25
C6orf136-202ENST00000376471 TIAM1Q13009 1591 aa22.84■■□□□ 1.25
C6orf136-202ENST00000376471 MBD5Q9P267 1494 aa22.82■■□□□ 1.24
C6orf136-202ENST00000376471 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.81■■□□□ 1.24
C6orf136-202ENST00000376471 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.8■■□□□ 1.24
C6orf136-202ENST00000376471 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
C6orf136-202ENST00000376471 ATP7AQ04656 1500 aa22.79■■□□□ 1.24
C6orf136-202ENST00000376471 NCOA2Q15596 1464 aa22.77■■□□□ 1.24
C6orf136-202ENST00000376471 C3P01024 1663 aa22.77■■□□□ 1.24
C6orf136-202ENST00000376471 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 A2MP01023 1474 aa22.76■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.76■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.75■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 GGT6Q6P531 493 aa22.75■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 ZMYM3Q14202 1370 aa22.75■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.73■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 PLXNC1O60486 1568 aa22.72■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.71■■□□□ 1.23
C6orf136-202ENST00000376471 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.7■■□□□ 1.22
C6orf136-202ENST00000376471 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.7■■□□□ 1.22
C6orf136-202ENST00000376471 STRCQ7RTU9 1775 aa22.69■■□□□ 1.22
C6orf136-202ENST00000376471 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.68■■□□□ 1.22
C6orf136-202ENST00000376471 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.67■■□□□ 1.22
C6orf136-202ENST00000376471 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.66■■□□□ 1.22
C6orf136-202ENST00000376471 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
C6orf136-202ENST00000376471 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.63■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 KIF3BO15066 747 aa22.62■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 NPATQ14207 1427 aa22.62■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 PTPRKQ15262 1439 aa22.62■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 ILDR2Q71H61 639 aa22.6■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.59■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 MROH2AA6NES4 1674 aa22.58■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.58■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.58■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 NCOA1Q15788 1441 aa22.58■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.58■■□□□ 1.21
C6orf136-202ENST00000376471 TSPY4P0CV99 314 aa22.56■■□□□ 1.2
C6orf136-202ENST00000376471 TSPY10P0CW01 314 aa22.56■■□□□ 1.2
C6orf136-202ENST00000376471 PTPRTO14522 1441 aa22.56■■□□□ 1.2
C6orf136-202ENST00000376471 MAP3K1Q13233 1512 aa22.54■■□□□ 1.2
C6orf136-202ENST00000376471 SOCS7O14512 581 aa22.54■■□□□ 1.2
C6orf136-202ENST00000376471 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.53■■□□□ 1.2
C6orf136-202ENST00000376471 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms