RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 PTPRMP28827 1452 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-201ENST00000375425 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-201ENST00000375425 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-201ENST00000375425 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-201ENST00000375425 AFAP1Q8N556 730 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-201ENST00000375425 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-201ENST00000375425 ARHGAP5Q13017 1502 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-201ENST00000375425 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-201ENST00000375425 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.99■■□□□ 1.27
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NELFE-201ENST00000375425 MLECQ14165 292 aa22.96■■□□□ 1.27
NELFE-201ENST00000375425 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.94■■□□□ 1.26
NELFE-201ENST00000375425 MADDQ8WXG6 1647 aa22.94■■□□□ 1.26
NELFE-201ENST00000375425 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.93■■□□□ 1.26
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NELFE-201ENST00000375425 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-201ENST00000375425 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
NELFE-201ENST00000375425 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.86■■□□□ 1.25
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NELFE-201ENST00000375425 PREX2Q70Z35 1606 aa22.84■■□□□ 1.25
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NELFE-201ENST00000375425 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-201ENST00000375425 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NELFE-201ENST00000375425 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-201ENST00000375425 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.82■■□□□ 1.24
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NELFE-201ENST00000375425 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.76■■□□□ 1.23
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NELFE-201ENST00000375425 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.75■■□□□ 1.23
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NELFE-201ENST00000375425 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.73■■□□□ 1.23
NELFE-201ENST00000375425 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
NELFE-201ENST00000375425 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NELFE-201ENST00000375425 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-201ENST00000375425 ABCA6Q8N139 1617 aa22.71■■□□□ 1.23
NELFE-201ENST00000375425 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.7■■□□□ 1.23
NELFE-201ENST00000375425 REREQ9P2R6 1566 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-201ENST00000375425 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.7■■□□□ 1.22
NELFE-201ENST00000375425 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NELFE-201ENST00000375425 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.68■■□□□ 1.22
NELFE-201ENST00000375425 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.67■■□□□ 1.22
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NELFE-201ENST00000375425 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.66■■□□□ 1.22
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NELFE-201ENST00000375425 NCOA2Q15596 1464 aa22.58■■□□□ 1.2
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NELFE-201ENST00000375425 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.54■■□□□ 1.2
NELFE-201ENST00000375425 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.52■■□□□ 1.2
NELFE-201ENST00000375425 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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NELFE-201ENST00000375425 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 FBXO41Q8TF61 875 aa22.51■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.51■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 ZMYM3Q14202 1370 aa22.51■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.51■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.5■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 C3P01024 1663 aa22.5■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 PLXNC1O60486 1568 aa22.48■■□□□ 1.19
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NELFE-201ENST00000375425 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.46■■□□□ 1.19
NELFE-201ENST00000375425 TSPY4P0CV99 314 aa22.45■■□□□ 1.18
NELFE-201ENST00000375425 TSPY10P0CW01 314 aa22.45■■□□□ 1.18
NELFE-201ENST00000375425 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.44■■□□□ 1.18
NELFE-201ENST00000375425 MAP3K1Q13233 1512 aa22.43■■□□□ 1.18
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NELFE-201ENST00000375425 NPATQ14207 1427 aa22.41■■□□□ 1.18
NELFE-201ENST00000375425 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.41■■□□□ 1.18
NELFE-201ENST00000375425 APLP2Q06481 763 aa22.4■■□□□ 1.18
NELFE-201ENST00000375425 CERKQ8TCT0 537 aa22.4■■□□□ 1.18
NELFE-201ENST00000375425 MROH2AA6NES4 1674 aa22.39■■□□□ 1.17
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NELFE-201ENST00000375425 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-201ENST00000375425 PTPRKQ15262 1439 aa22.35■■□□□ 1.17
NELFE-201ENST00000375425 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-201ENST00000375425 MIA2Q96PC5 1412 aa22.34■■□□□ 1.17
NELFE-201ENST00000375425 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.33■■□□□ 1.16
NELFE-201ENST00000375425 PTPRTO14522 1441 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-201ENST00000375425 NCOA1Q15788 1441 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-201ENST00000375425 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NELFE-201ENST00000375425 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.28■■□□□ 1.16
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