RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370542.1

LMO4-201, Transcript of LIM domain only 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO4, Length 1,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4-201ENST00000370542 PLCH2O75038 1416 aa24.18■■□□□ 1.46
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LMO4-201ENST00000370542 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
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LMO4-201ENST00000370542 PREX2Q70Z35 1606 aa23.89■■□□□ 1.42
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LMO4-201ENST00000370542 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.87■■□□□ 1.41
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LMO4-201ENST00000370542 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.82■■□□□ 1.4
LMO4-201ENST00000370542 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.81■■□□□ 1.4
LMO4-201ENST00000370542 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.8■■□□□ 1.4
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LMO4-201ENST00000370542 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
LMO4-201ENST00000370542 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.78■■□□□ 1.4
LMO4-201ENST00000370542 AGLP35573 1532 aa23.74■■□□□ 1.39
LMO4-201ENST00000370542 ABCA6Q8N139 1617 aa23.74■■□□□ 1.39
LMO4-201ENST00000370542 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.72■■□□□ 1.39
LMO4-201ENST00000370542 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.72■■□□□ 1.39
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LMO4-201ENST00000370542 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.64■■□□□ 1.37
LMO4-201ENST00000370542 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.63■■□□□ 1.37
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LMO4-201ENST00000370542 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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LMO4-201ENST00000370542 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.44■■□□□ 1.34
LMO4-201ENST00000370542 MAP3K1Q13233 1512 aa23.43■■□□□ 1.34
LMO4-201ENST00000370542 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.42■■□□□ 1.34
LMO4-201ENST00000370542 HRCP23327 699 aa23.41■■□□□ 1.34
LMO4-201ENST00000370542 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
LMO4-201ENST00000370542 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.39■■□□□ 1.34
LMO4-201ENST00000370542 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.39■■□□□ 1.34
LMO4-201ENST00000370542 PKD2Q13563 968 aa23.39■■□□□ 1.33
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