RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 CEP162Q5TB80 1403 aa32.61■■■□□ 2.81
PITX3-201ENST00000370002 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.6■■■□□ 2.81
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.58■■■□□ 2.81
PITX3-201ENST00000370002 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
PITX3-201ENST00000370002 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.55■■■□□ 2.8
PITX3-201ENST00000370002 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.55■■■□□ 2.8
PITX3-201ENST00000370002 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.51■■■□□ 2.8
PITX3-201ENST00000370002 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.48■■■□□ 2.79
PITX3-201ENST00000370002 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.47■■■□□ 2.79
PITX3-201ENST00000370002 AFAP1Q8N556 730 aa32.46■■■□□ 2.79
PITX3-201ENST00000370002 PREX2Q70Z35 1606 aa32.46■■■□□ 2.79
PITX3-201ENST00000370002 ATP10AO60312 1499 aa32.46■■■□□ 2.79
PITX3-201ENST00000370002 KDM5CP41229 1560 aa32.44■■■□□ 2.78
PITX3-201ENST00000370002 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.43■■■□□ 2.78
PITX3-201ENST00000370002 PTPRMP28827 1452 aa32.43■■■□□ 2.78
PITX3-201ENST00000370002 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
PITX3-201ENST00000370002 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.43■■■□□ 2.78
PITX3-201ENST00000370002 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.43■■■□□ 2.78
PITX3-201ENST00000370002 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.41■■■□□ 2.78
PITX3-201ENST00000370002 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.4■■■□□ 2.78
PITX3-201ENST00000370002 ABCC1P33527 1531 aa32.38■■■□□ 2.77
PITX3-201ENST00000370002 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.38■■■□□ 2.77
PITX3-201ENST00000370002 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
PITX3-201ENST00000370002 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.35■■■□□ 2.77
PITX3-201ENST00000370002 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.35■■■□□ 2.77
PITX3-201ENST00000370002 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.34■■■□□ 2.77
PITX3-201ENST00000370002 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.33■■■□□ 2.77
PITX3-201ENST00000370002 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.33■■■□□ 2.77
PITX3-201ENST00000370002 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.32■■■□□ 2.76
PITX3-201ENST00000370002 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.31■■■□□ 2.76
PITX3-201ENST00000370002 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.31■■■□□ 2.76
PITX3-201ENST00000370002 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.31■■■□□ 2.76
PITX3-201ENST00000370002 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
PITX3-201ENST00000370002 MADDQ8WXG6 1647 aa32.29■■■□□ 2.76
PITX3-201ENST00000370002 REREQ9P2R6 1566 aa32.28■■■□□ 2.76
PITX3-201ENST00000370002 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.24■■■□□ 2.75
PITX3-201ENST00000370002 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.23■■■□□ 2.75
PITX3-201ENST00000370002 MLECQ14165 292 aa32.22■■■□□ 2.75
PITX3-201ENST00000370002 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.75
PITX3-201ENST00000370002 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.21■■■□□ 2.75
PITX3-201ENST00000370002 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.21■■■□□ 2.75
PITX3-201ENST00000370002 AGLP35573 1532 aa32.2■■■□□ 2.74
PITX3-201ENST00000370002 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
PITX3-201ENST00000370002 MAP3K1Q13233 1512 aa32.17■■■□□ 2.74
PITX3-201ENST00000370002 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.17■■■□□ 2.74
PITX3-201ENST00000370002 TIAM1Q13009 1591 aa32.16■■■□□ 2.74
PITX3-201ENST00000370002 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.14■■■□□ 2.74
PITX3-201ENST00000370002 NCOA2Q15596 1464 aa32.13■■■□□ 2.73
PITX3-201ENST00000370002 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
PITX3-201ENST00000370002 ABCA6Q8N139 1617 aa32.13■■■□□ 2.73
PITX3-201ENST00000370002 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.11■■■□□ 2.73
PITX3-201ENST00000370002 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.1■■■□□ 2.73
PITX3-201ENST00000370002 MBD5Q9P267 1494 aa32.09■■■□□ 2.73
PITX3-201ENST00000370002 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
PITX3-201ENST00000370002 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
PITX3-201ENST00000370002 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.06■■■□□ 2.72
PITX3-201ENST00000370002 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.05■■■□□ 2.72
PITX3-201ENST00000370002 ATP7AQ04656 1500 aa32.04■■■□□ 2.72
PITX3-201ENST00000370002 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.04■■■□□ 2.72
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PITX3-201ENST00000370002 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.01■■■□□ 2.71
PITX3-201ENST00000370002 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
PITX3-201ENST00000370002 A2MP01023 1474 aa31.97■■■□□ 2.71
PITX3-201ENST00000370002 APLP2Q06481 763 aa31.97■■■□□ 2.71
PITX3-201ENST00000370002 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
PITX3-201ENST00000370002 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.97■■■□□ 2.71
PITX3-201ENST00000370002 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.94■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.94■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.94■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 MIA2Q96PC5 1412 aa31.93■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 PLXNC1O60486 1568 aa31.93■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 TSPY4P0CV99 314 aa31.9■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 TSPY10P0CW01 314 aa31.9■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PITX3-201ENST00000370002 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.87■■■□□ 2.69
PITX3-201ENST00000370002 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.86■■■□□ 2.69
PITX3-201ENST00000370002 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.83■■■□□ 2.69
PITX3-201ENST00000370002 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.83■■■□□ 2.69
PITX3-201ENST00000370002 HSPA2P54652 639 aa31.82■■■□□ 2.69
PITX3-201ENST00000370002 ZMYM3Q14202 1370 aa31.81■■■□□ 2.68
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PITX3-201ENST00000370002 GGT6Q6P531 493 aa31.8■■■□□ 2.68
PITX3-201ENST00000370002 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
PITX3-201ENST00000370002 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.77■■■□□ 2.68
PITX3-201ENST00000370002 MROH2AA6NES4 1674 aa31.75■■■□□ 2.67
PITX3-201ENST00000370002 C3P01024 1663 aa31.74■■■□□ 2.67
PITX3-201ENST00000370002 KIF3BO15066 747 aa31.71■■■□□ 2.67
PITX3-201ENST00000370002 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.7■■■□□ 2.67
PITX3-201ENST00000370002 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.7■■■□□ 2.67
PITX3-201ENST00000370002 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.69■■■□□ 2.66
PITX3-201ENST00000370002 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
PITX3-201ENST00000370002 PTPRKQ15262 1439 aa31.63■■■□□ 2.65
PITX3-201ENST00000370002 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.61■■■□□ 2.65
PITX3-201ENST00000370002 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.6■■■□□ 2.65
PITX3-201ENST00000370002 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
PITX3-201ENST00000370002 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.59■■■□□ 2.65
PITX3-201ENST00000370002 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
PITX3-201ENST00000370002 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.56■■■□□ 2.64
PITX3-201ENST00000370002 ABCC5O15440 1437 aa31.56■■■□□ 2.64
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