RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.86■■□□□ 1.57
KRCC1-201ENST00000347055 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
KRCC1-201ENST00000347055 WDR62O43379 1518 aa24.84■■□□□ 1.57
KRCC1-201ENST00000347055 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.83■■□□□ 1.57
KRCC1-201ENST00000347055 MRS2Q9HD23 443 aa24.83■■□□□ 1.57
KRCC1-201ENST00000347055 IQGAP2Q13576 1575 aa24.83■■□□□ 1.57
KRCC1-201ENST00000347055 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
KRCC1-201ENST00000347055 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.82■■□□□ 1.56
KRCC1-201ENST00000347055 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
KRCC1-201ENST00000347055 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.79■■□□□ 1.56
KRCC1-201ENST00000347055 DAPK1P53355 1430 aa24.79■■□□□ 1.56
KRCC1-201ENST00000347055 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC184Q52MB2 194 aa24.76■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 MBD5Q9P267 1494 aa24.76■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.75■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 PBRM1Q86U86 1689 aa24.75■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.72■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 KIF14Q15058 1648 aa24.72■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.72■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 ADAMTS12P58397 1594 aa24.71■■□□□ 1.55
KRCC1-201ENST00000347055 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.7■■□□□ 1.54
KRCC1-201ENST00000347055 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
KRCC1-201ENST00000347055 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.69■■□□□ 1.54
KRCC1-201ENST00000347055 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.69■■□□□ 1.54
KRCC1-201ENST00000347055 NUDCQ9Y266 331 aa24.69■■□□□ 1.54
KRCC1-201ENST00000347055 ABCC5O15440 1437 aa24.69■■□□□ 1.54
KRCC1-201ENST00000347055 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
KRCC1-201ENST00000347055 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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KRCC1-201ENST00000347055 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
KRCC1-201ENST00000347055 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.63■■□□□ 1.53
KRCC1-201ENST00000347055 KDM5CP41229 1560 aa24.63■■□□□ 1.53
KRCC1-201ENST00000347055 ADGRL2O95490 1459 aa24.62■■□□□ 1.53
KRCC1-201ENST00000347055 PZPP20742 1482 aa24.62■■□□□ 1.53
KRCC1-201ENST00000347055 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.6■■□□□ 1.53
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KRCC1-201ENST00000347055 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.58■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.57■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.57■■□□□ 1.52
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KRCC1-201ENST00000347055 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.56■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 KIAA0556O60303 1618 aa24.56■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 USP47Q96K76 1375 aa24.55■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.54■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.54■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.53■■□□□ 1.52
KRCC1-201ENST00000347055 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
KRCC1-201ENST00000347055 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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KRCC1-201ENST00000347055 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
KRCC1-201ENST00000347055 KIF15Q9NS87 1388 aa24.48■■□□□ 1.51
KRCC1-201ENST00000347055 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.48■■□□□ 1.51
KRCC1-201ENST00000347055 E9PCH4 1651 aa24.48■■□□□ 1.51
KRCC1-201ENST00000347055 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.48■■□□□ 1.51
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KRCC1-201ENST00000347055 DISP1Q96F81 1524 aa24.45■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.44■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 INSRP06213 1382 aa24.44■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.43■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 RALBP1Q15311 655 aa24.42■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.39■■□□□ 1.5
KRCC1-201ENST00000347055 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
KRCC1-201ENST00000347055 PDE3BQ13370 1112 aa24.38■■□□□ 1.49
KRCC1-201ENST00000347055 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
KRCC1-201ENST00000347055 TMC1Q8TDI8 760 aa24.37■■□□□ 1.49
KRCC1-201ENST00000347055 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
KRCC1-201ENST00000347055 MS4A1P11836 297 aa24.36■■□□□ 1.49
KRCC1-201ENST00000347055 CEP170Q5SW79 1584 aa24.35■■□□□ 1.49
KRCC1-201ENST00000347055 USP35Q9P2H5 1018 aa24.34■■□□□ 1.49
KRCC1-201ENST00000347055 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
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KRCC1-201ENST00000347055 IFT140Q96RY7 1462 aa24.31■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.31■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 PTPRGP23470 1445 aa24.28■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 LAMC1P11047 1609 aa24.28■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 NBR1Q14596 966 aa24.28■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 PKD2Q13563 968 aa24.27■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.27■■□□□ 1.48
KRCC1-201ENST00000347055 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.25■■□□□ 1.47
KRCC1-201ENST00000347055 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.24■■□□□ 1.47
KRCC1-201ENST00000347055 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.24■■□□□ 1.47
KRCC1-201ENST00000347055 GRIN2AQ12879 1464 aa24.24■■□□□ 1.47
KRCC1-201ENST00000347055 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
KRCC1-201ENST00000347055 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.23■■□□□ 1.47
KRCC1-201ENST00000347055 NLRP13Q86W25 1043 aa24.22■■□□□ 1.47
KRCC1-201ENST00000347055 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.22■■□□□ 1.47
KRCC1-201ENST00000347055 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.22■■□□□ 1.47
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