RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324987.4

PSMG4-201, Transcript of proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

TSL 3

Gene PSMG4, Length 778 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4-201ENST00000324987 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.51■■■■■ 4.56
PSMG4-201ENST00000324987 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.48■■■■■ 4.55
PSMG4-201ENST00000324987 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.44■■■■■ 4.54
PSMG4-201ENST00000324987 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.42■■■■■ 4.54
PSMG4-201ENST00000324987 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
PSMG4-201ENST00000324987 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.38■■■■■ 4.53
PSMG4-201ENST00000324987 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.37■■■■■ 4.53
PSMG4-201ENST00000324987 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.34■■■■■ 4.53
PSMG4-201ENST00000324987 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.33■■■■■ 4.53
PSMG4-201ENST00000324987 PREX2Q70Z35 1606 aa43.32■■■■■ 4.53
PSMG4-201ENST00000324987 AFAP1Q8N556 730 aa43.3■■■■■ 4.52
PSMG4-201ENST00000324987 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.29■■■■■ 4.52
PSMG4-201ENST00000324987 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.26■■■■■ 4.52
PSMG4-201ENST00000324987 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
PSMG4-201ENST00000324987 ATP10AO60312 1499 aa43.23■■■■■ 4.51
PSMG4-201ENST00000324987 KDM5CP41229 1560 aa43.23■■■■■ 4.51
PSMG4-201ENST00000324987 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.22■■■■■ 4.51
PSMG4-201ENST00000324987 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.2■■■■■ 4.51
PSMG4-201ENST00000324987 ABCC1P33527 1531 aa43.19■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.17■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 PTPRMP28827 1452 aa43.17■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.16■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.16■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.16■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.14■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.14■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.14■■■■■ 4.5
PSMG4-201ENST00000324987 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.12■■■■■ 4.49
PSMG4-201ENST00000324987 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.09■■■■■ 4.49
PSMG4-201ENST00000324987 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.08■■■■■ 4.49
PSMG4-201ENST00000324987 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.07■■■■■ 4.49
PSMG4-201ENST00000324987 MADDQ8WXG6 1647 aa43.04■■■■■ 4.48
PSMG4-201ENST00000324987 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.03■■■■■ 4.48
PSMG4-201ENST00000324987 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.02■■■■■ 4.48
PSMG4-201ENST00000324987 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.99■■■■■ 4.479e-8■■■□□ 14.6
PSMG4-201ENST00000324987 MLECQ14165 292 aa42.99■■■■■ 4.47
PSMG4-201ENST00000324987 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.99■■■■■ 4.47
PSMG4-201ENST00000324987 REREQ9P2R6 1566 aa42.98■■■■■ 4.47
PSMG4-201ENST00000324987 TIAM1Q13009 1591 aa42.96■■■■■ 4.47
PSMG4-201ENST00000324987 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.95■■■■■ 4.47
PSMG4-201ENST00000324987 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.95■■■■■ 4.47
PSMG4-201ENST00000324987 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
PSMG4-201ENST00000324987 MAP3K1Q13233 1512 aa42.92■■■■■ 4.46
PSMG4-201ENST00000324987 NCOA2Q15596 1464 aa42.9■■■■■ 4.46
PSMG4-201ENST00000324987 ABCA6Q8N139 1617 aa42.87■■■■■ 4.45
PSMG4-201ENST00000324987 AGLP35573 1532 aa42.87■■■■■ 4.45
PSMG4-201ENST00000324987 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.86■■■■■ 4.45
PSMG4-201ENST00000324987 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
PSMG4-201ENST00000324987 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
PSMG4-201ENST00000324987 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
PSMG4-201ENST00000324987 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.84■■■■■ 4.45
PSMG4-201ENST00000324987 MBD5Q9P267 1494 aa42.79■■■■■ 4.44
PSMG4-201ENST00000324987 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.78■■■■■ 4.44
PSMG4-201ENST00000324987 ATP7AQ04656 1500 aa42.74■■■■■ 4.43
PSMG4-201ENST00000324987 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.74■■■■■ 4.43
PSMG4-201ENST00000324987 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
PSMG4-201ENST00000324987 APLP2Q06481 763 aa42.71■■■■■ 4.43
PSMG4-201ENST00000324987 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.7■■■■■ 4.43
PSMG4-201ENST00000324987 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
PSMG4-201ENST00000324987 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
PSMG4-201ENST00000324987 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.67■■■■■ 4.42
PSMG4-201ENST00000324987 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.65■■■■■ 4.42
PSMG4-201ENST00000324987 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.64■■■■■ 4.42
PSMG4-201ENST00000324987 A2MP01023 1474 aa42.63■■■■■ 4.42
PSMG4-201ENST00000324987 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.61■■■■■ 4.41
PSMG4-201ENST00000324987 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.6■■■■■ 4.41
PSMG4-201ENST00000324987 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
PSMG4-201ENST00000324987 MIA2Q96PC5 1412 aa42.57■■■■■ 4.41
PSMG4-201ENST00000324987 PLXNC1O60486 1568 aa42.56■■■■■ 4.4
PSMG4-201ENST00000324987 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.54■■■■■ 4.4
PSMG4-201ENST00000324987 TSPY4P0CV99 314 aa42.53■■■■■ 4.4
PSMG4-201ENST00000324987 TSPY10P0CW01 314 aa42.53■■■■■ 4.4
PSMG4-201ENST00000324987 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.52■■■■■ 4.4
PSMG4-201ENST00000324987 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.5■■■■■ 4.39
PSMG4-201ENST00000324987 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
PSMG4-201ENST00000324987 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.47■■■■■ 4.39
PSMG4-201ENST00000324987 HSPA2P54652 639 aa42.42■■■■■ 4.38
PSMG4-201ENST00000324987 GGT6Q6P531 493 aa42.41■■■■■ 4.38
PSMG4-201ENST00000324987 ZMYM3Q14202 1370 aa42.39■■■■■ 4.38
PSMG4-201ENST00000324987 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.37■■■■■ 4.37
PSMG4-201ENST00000324987 C3P01024 1663 aa42.34■■■■■ 4.37
PSMG4-201ENST00000324987 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.34■■■■■ 4.37
PSMG4-201ENST00000324987 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
PSMG4-201ENST00000324987 NPATQ14207 1427 aa42.32■■■■■ 4.37
PSMG4-201ENST00000324987 MROH2AA6NES4 1674 aa42.31■■■■■ 4.36
PSMG4-201ENST00000324987 KIF3BO15066 747 aa42.3■■■■■ 4.36
PSMG4-201ENST00000324987 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.27■■■■■ 4.36
PSMG4-201ENST00000324987 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.2■■■■■ 4.35
PSMG4-201ENST00000324987 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.19■■■■■ 4.34
PSMG4-201ENST00000324987 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
PSMG4-201ENST00000324987 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.15■■■■■ 4.34
PSMG4-201ENST00000324987 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
PSMG4-201ENST00000324987 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.14■■■■■ 4.34
PSMG4-201ENST00000324987 ABCC5O15440 1437 aa42.13■■■■■ 4.34
PSMG4-201ENST00000324987 PTPRKQ15262 1439 aa42.13■■■■■ 4.34
PSMG4-201ENST00000324987 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.13■■■■■ 4.34
PSMG4-201ENST00000324987 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.12■■■■■ 4.33
PSMG4-201ENST00000324987 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.07■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms