RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324941.4

VPS37D-201, Transcript of VPS37D, ESCRT-I subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPS37D, Length 1,624 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37D-201ENST00000324941 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
VPS37D-201ENST00000324941 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
VPS37D-201ENST00000324941 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
VPS37D-201ENST00000324941 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
VPS37D-201ENST00000324941 PREX2Q70Z35 1606 aa41.43■■■■■ 4.22
VPS37D-201ENST00000324941 HFM1A2PYH4 1435 aa41.4■■■■■ 4.22
VPS37D-201ENST00000324941 ABCC5O15440 1437 aa41.4■■■■■ 4.22
VPS37D-201ENST00000324941 ASXL2Q76L83 1435 aa41.4■■■■■ 4.22
VPS37D-201ENST00000324941 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.38■■■■■ 4.21
VPS37D-201ENST00000324941 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.36■■■■■ 4.21
VPS37D-201ENST00000324941 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.36■■■■■ 4.21
VPS37D-201ENST00000324941 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.35■■■■■ 4.21
VPS37D-201ENST00000324941 AKNAQ7Z591 1439 aa41.33■■■■■ 4.21
VPS37D-201ENST00000324941 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.33■■■■■ 4.21
VPS37D-201ENST00000324941 PLCH2O75038 1416 aa41.31■■■■■ 4.2
VPS37D-201ENST00000324941 NAIPQ13075 1403 aa41.31■■■■■ 4.2
VPS37D-201ENST00000324941 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
VPS37D-201ENST00000324941 ROCK1Q13464 1354 aa41.29■■■■■ 4.2
VPS37D-201ENST00000324941 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.28■■■■■ 4.2
VPS37D-201ENST00000324941 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.24■■■■■ 4.19
VPS37D-201ENST00000324941 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.23■■■■■ 4.19
VPS37D-201ENST00000324941 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.22■■■■■ 4.19
VPS37D-201ENST00000324941 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.22■■■■■ 4.19
VPS37D-201ENST00000324941 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.2■■■■■ 4.19
VPS37D-201ENST00000324941 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.2■■■■■ 4.19
VPS37D-201ENST00000324941 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.19■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.19■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.18■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.18■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.17■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 TSPY4P0CV99 314 aa41.16■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 TSPY10P0CW01 314 aa41.16■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 MBD5Q9P267 1494 aa41.15■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.14■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.14■■■■■ 4.18
VPS37D-201ENST00000324941 ADGRL2O95490 1459 aa41.11■■■■■ 4.17
VPS37D-201ENST00000324941 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.1■■■■■ 4.17
VPS37D-201ENST00000324941 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.1■■■■■ 4.17
VPS37D-201ENST00000324941 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.1■■■■■ 4.17
VPS37D-201ENST00000324941 NCOA1Q15788 1441 aa41.08■■■■■ 4.17
VPS37D-201ENST00000324941 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
VPS37D-201ENST00000324941 MAPKBP1O60336 1514 aa41.07■■■■■ 4.17
VPS37D-201ENST00000324941 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.07■■■■■ 4.17
VPS37D-201ENST00000324941 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.07■■■■■ 4.16
VPS37D-201ENST00000324941 FANCAO15360 1455 aa40.98■■■■■ 4.15
VPS37D-201ENST00000324941 ABCC1P33527 1531 aa40.97■■■■■ 4.15
VPS37D-201ENST00000324941 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.95■■■■■ 4.15
VPS37D-201ENST00000324941 CD109Q6YHK3 1445 aa40.94■■■■■ 4.14
VPS37D-201ENST00000324941 KDM6BO15054 1643 aa40.94■■■■■ 4.14
VPS37D-201ENST00000324941 TRIM52Q96A61 297 aa40.91■■■■■ 4.14
VPS37D-201ENST00000324941 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.9■■■■■ 4.14
VPS37D-201ENST00000324941 KIF15Q9NS87 1388 aa40.84■■■■■ 4.13
VPS37D-201ENST00000324941 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.84■■■■■ 4.13
VPS37D-201ENST00000324941 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.82■■■■■ 4.13
VPS37D-201ENST00000324941 ADGRL1O94910 1474 aa40.81■■■■■ 4.12
VPS37D-201ENST00000324941 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.79■■■■■ 4.12
VPS37D-201ENST00000324941 GLI2P10070 1586 aa40.78■■■■■ 4.12
VPS37D-201ENST00000324941 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.77■■■■■ 4.12
VPS37D-201ENST00000324941 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
VPS37D-201ENST00000324941 AFAP1Q8N556 730 aa40.73■■■■■ 4.11
VPS37D-201ENST00000324941 PLXNC1O60486 1568 aa40.73■■■■■ 4.11
VPS37D-201ENST00000324941 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.71■■■■■ 4.11
VPS37D-201ENST00000324941 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.7■■■■■ 4.11
VPS37D-201ENST00000324941 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.69■■■■■ 4.1
VPS37D-201ENST00000324941 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.68■■■■■ 4.1
VPS37D-201ENST00000324941 NEO1Q92859 1461 aa40.66■■■■■ 4.1
VPS37D-201ENST00000324941 DIP2BQ9P265 1576 aa40.64■■■■■ 4.1
VPS37D-201ENST00000324941 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.62■■■■■ 4.09
VPS37D-201ENST00000324941 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.6■■■■■ 4.09
VPS37D-201ENST00000324941 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
VPS37D-201ENST00000324941 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.58■■■■■ 4.09
VPS37D-201ENST00000324941 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.57■■■■■ 4.09
VPS37D-201ENST00000324941 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 NEUROD1Q13562 356 aa40.56■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.55■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 ATP7AQ04656 1500 aa40.53■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 PZPP20742 1482 aa40.53■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 ERBINQ96RT1 1412 aa40.53■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 NUP155O75694 1391 aa40.52■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.52■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.51■■■■■ 4.08
VPS37D-201ENST00000324941 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.47■■■■■ 4.07
VPS37D-201ENST00000324941 KDM5CP41229 1560 aa40.42■■■■■ 4.06
VPS37D-201ENST00000324941 FOXD1Q16676 465 aa40.41■■■■■ 4.06
VPS37D-201ENST00000324941 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.4■■■■■ 4.06
VPS37D-201ENST00000324941 UNC13BO14795 1591 aa40.39■■■■■ 4.06
VPS37D-201ENST00000324941 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.38■■■■■ 4.05
VPS37D-201ENST00000324941 PKD2Q13563 968 aa40.38■■■■■ 4.05
VPS37D-201ENST00000324941 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.36■■■■■ 4.05
VPS37D-201ENST00000324941 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.36■■■■■ 4.05
VPS37D-201ENST00000324941 RAPGEF3O95398 923 aa40.34■■■■■ 4.05
VPS37D-201ENST00000324941 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
VPS37D-201ENST00000324941 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.05
VPS37D-201ENST00000324941 TONSLQ96HA7 1378 aa40.33■■■■■ 4.05
VPS37D-201ENST00000324941 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.31■■■■■ 4.04
VPS37D-201ENST00000324941 TSPOAP1O95153 1857 aa40.31■■■■■ 4.04
VPS37D-201ENST00000324941 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.3■■■■■ 4.04
VPS37D-201ENST00000324941 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.3■■■■■ 4.04
VPS37D-201ENST00000324941 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms