RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320631.7

EHD1-201, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD1, Length 4,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-201ENST00000320631 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.83■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 NRDCO43847 1150 aa15.81■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.8■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.79■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.78■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.77■□□□□ 0.12
EHD1-201ENST00000320631 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 MS4A1P11836 297 aa15.76■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.76■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.76■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.75■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 KIF27Q86VH2 1401 aa15.75■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.75■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.75■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 PTMSP20962 102 aa15.74■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 C14orf37Q86TY3 774 aa15.72■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.72■□□□□ 0.11
EHD1-201ENST00000320631 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 NFKBIBQ15653 356 aa15.7■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 A0A0G2JS52 829 aa15.7■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.69■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 KCNJ4P48050 445 aa15.68■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 FGD1P98174 961 aa15.68■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 FAM161AQ3B820 660 aa15.68■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 PLEKHG5O94827 1062 aa15.68■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 PLIN1O60240 522 aa15.67■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.67■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 APBB1O00213 710 aa15.67■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.67■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.67■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 FOXD1Q16676 465 aa15.65■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.65■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.65■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.65■□□□□ 0.1
EHD1-201ENST00000320631 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.64■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 NCAPD3P42695 1498 aa15.63■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 MCCP23508 829 aa15.63■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.63■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 TMF1P82094 1093 aa15.62■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 CUX2O14529 1486 aa15.62■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.6■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.6■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 RALBP1Q15311 655 aa15.6■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.6■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 PDE3BQ13370 1112 aa15.59■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 GOLGA2Q08379 1002 aa15.59■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.59■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 POGKQ9P215 609 aa15.58■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.58■□□□□ 0.09
EHD1-201ENST00000320631 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.58■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 CRBNQ96SW2 442 aa15.58■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.56■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 CFAP44Q96MT7 982 aa15.56■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 MSH5O43196 834 aa15.55■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 NLRP13Q86W25 1043 aa15.55■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.54■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
EHD1-201ENST00000320631 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 MORC1Q86VD1 984 aa15.52■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.51■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.51■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.5■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 RBM10P98175 930 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.49■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 HMGXB3Q12766 1538 aa15.48■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 MRE11P49959 708 aa15.48■□□□□ 0.07
EHD1-201ENST00000320631 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms