RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.26■■□□□ 1.31
GLIS1-201ENST00000312233 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.25■■□□□ 1.31
GLIS1-201ENST00000312233 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GLIS1-201ENST00000312233 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.23■■□□□ 1.31
GLIS1-201ENST00000312233 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GLIS1-201ENST00000312233 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.21■■□□□ 1.31
GLIS1-201ENST00000312233 PBRM1Q86U86 1689 aa23.2■■□□□ 1.3
GLIS1-201ENST00000312233 CUL7Q14999 1698 aa23.2■■□□□ 1.3
GLIS1-201ENST00000312233 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GLIS1-201ENST00000312233 MS4A1P11836 297 aa23.15■■□□□ 1.3
GLIS1-201ENST00000312233 PDE4CQ08493 712 aa23.14■■□□□ 1.29
GLIS1-201ENST00000312233 GRIN2BQ13224 1484 aa23.13■■□□□ 1.29
GLIS1-201ENST00000312233 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
GLIS1-201ENST00000312233 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
GLIS1-201ENST00000312233 MRS2Q9HD23 443 aa23.13■■□□□ 1.29
GLIS1-201ENST00000312233 NUDCQ9Y266 331 aa23.12■■□□□ 1.29
GLIS1-201ENST00000312233 SLC4A3P48751 1232 aa23.11■■□□□ 1.29
GLIS1-201ENST00000312233 ARAP1Q96P48 1450 aa23.1■■□□□ 1.29
GLIS1-201ENST00000312233 ADAMTS12P58397 1594 aa23.07■■□□□ 1.28
GLIS1-201ENST00000312233 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GLIS1-201ENST00000312233 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.06■■□□□ 1.28
GLIS1-201ENST00000312233 CLCN1P35523 988 aa23.05■■□□□ 1.28
GLIS1-201ENST00000312233 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.04■■□□□ 1.28
GLIS1-201ENST00000312233 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.03■■□□□ 1.28
GLIS1-201ENST00000312233 TONSLQ96HA7 1378 aa23.03■■□□□ 1.28
GLIS1-201ENST00000312233 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.01■■□□□ 1.27
GLIS1-201ENST00000312233 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GLIS1-201ENST00000312233 NCOA2Q15596 1464 aa22.99■■□□□ 1.27
GLIS1-201ENST00000312233 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GLIS1-201ENST00000312233 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
GLIS1-201ENST00000312233 POGKQ9P215 609 aa22.95■■□□□ 1.27
GLIS1-201ENST00000312233 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GLIS1-201ENST00000312233 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.94■■□□□ 1.26
GLIS1-201ENST00000312233 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.94■■□□□ 1.26
GLIS1-201ENST00000312233 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.94■■□□□ 1.26
GLIS1-201ENST00000312233 RGS3P49796 1198 aa22.93■■□□□ 1.26
GLIS1-201ENST00000312233 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GLIS1-201ENST00000312233 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-201ENST00000312233 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-201ENST00000312233 SYNJ2O15056 1496 aa22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-201ENST00000312233 GRIN2AQ12879 1464 aa22.88■■□□□ 1.25
GLIS1-201ENST00000312233 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GLIS1-201ENST00000312233 SKAP1Q86WV1 359 aa22.82■■□□□ 1.24
GLIS1-201ENST00000312233 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
GLIS1-201ENST00000312233 FBLN2P98095 1184 aa22.81■■□□□ 1.24
GLIS1-201ENST00000312233 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.81■■□□□ 1.24
GLIS1-201ENST00000312233 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
GLIS1-201ENST00000312233 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
GLIS1-201ENST00000312233 TPM2P07951 284 aa22.78■■□□□ 1.24
GLIS1-201ENST00000312233 IQGAP2Q13576 1575 aa22.77■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 CEP170Q5SW79 1584 aa22.76■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC7Q96M83 1385 aa22.75■■□□□ 1.23
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GLIS1-201ENST00000312233 P3H3Q8IVL6 736 aa22.73■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.73■■□□□ 1.23
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GLIS1-201ENST00000312233 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 ARXQ96QS3 562 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 NUP160Q12769 1436 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 SAMD9Q5K651 1589 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 CHD1O14646 1710 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 FSD2A1L4K1 749 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.7■■□□□ 1.23
GLIS1-201ENST00000312233 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS1-201ENST00000312233 ESPNB1AK53 854 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS1-201ENST00000312233 MAP3K1Q13233 1512 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS1-201ENST00000312233 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS1-201ENST00000312233 ERBB4Q15303 1308 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS1-201ENST00000312233 C8orf34Q49A92 452 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS1-201ENST00000312233 FAM161AQ3B820 660 aa22.64■■□□□ 1.22
GLIS1-201ENST00000312233 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
GLIS1-201ENST00000312233 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GLIS1-201ENST00000312233 TIAM1Q13009 1591 aa22.62■■□□□ 1.21
GLIS1-201ENST00000312233 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
GLIS1-201ENST00000312233 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 UACAQ9BZF9 1416 aa22.57■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 DISP1Q96F81 1524 aa22.57■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.56■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.56■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.54■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 KIAA0556O60303 1618 aa22.54■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.53■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 MRE11P49959 708 aa22.53■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.53■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.52■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 FMN1Q68DA7 1419 aa22.52■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 RIPK4P57078 832 aa22.52■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 JPH4Q96JJ6 628 aa22.52■■□□□ 1.2
GLIS1-201ENST00000312233 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.51■■□□□ 1.19
GLIS1-201ENST00000312233 STAC3Q96MF2 364 aa22.51■■□□□ 1.19
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