RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.69■■■□□ 2.66
PARL-201ENST00000311101 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.68■■■□□ 2.66
PARL-201ENST00000311101 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.68■■■□□ 2.66
PARL-201ENST00000311101 PREX2Q70Z35 1606 aa31.67■■■□□ 2.66
PARL-201ENST00000311101 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.63■■■□□ 2.65
PARL-201ENST00000311101 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.63■■■□□ 2.65
PARL-201ENST00000311101 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.6■■■□□ 2.65
PARL-201ENST00000311101 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.6■■■□□ 2.65
PARL-201ENST00000311101 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
PARL-201ENST00000311101 TIAM1Q13009 1591 aa31.58■■■□□ 2.65
PARL-201ENST00000311101 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.57■■■□□ 2.64
PARL-201ENST00000311101 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.56■■■□□ 2.64
PARL-201ENST00000311101 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.54■■■□□ 2.64
PARL-201ENST00000311101 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.54■■■□□ 2.64
PARL-201ENST00000311101 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.53■■■□□ 2.64
PARL-201ENST00000311101 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.53■■■□□ 2.64
PARL-201ENST00000311101 ABCC1P33527 1531 aa31.52■■■□□ 2.64
PARL-201ENST00000311101 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.51■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 AFAP1Q8N556 730 aa31.51■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.51■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.5■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.5■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.48■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.47■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 KDM5CP41229 1560 aa31.47■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.46■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.45■■■□□ 2.63
PARL-201ENST00000311101 MADDQ8WXG6 1647 aa31.45■■■□□ 2.62
PARL-201ENST00000311101 MAP3K1Q13233 1512 aa31.44■■■□□ 2.62
PARL-201ENST00000311101 NCOA2Q15596 1464 aa31.44■■■□□ 2.62
PARL-201ENST00000311101 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.44■■■□□ 2.62
PARL-201ENST00000311101 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
PARL-201ENST00000311101 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
PARL-201ENST00000311101 PTPRMP28827 1452 aa31.42■■■□□ 2.62
PARL-201ENST00000311101 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.4■■■□□ 2.62
PARL-201ENST00000311101 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.37■■■□□ 2.613e-10■■■■■ 34.9
PARL-201ENST00000311101 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
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PARL-201ENST00000311101 ATP10AO60312 1499 aa31.35■■■□□ 2.61
PARL-201ENST00000311101 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.35■■■□□ 2.61
PARL-201ENST00000311101 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.34■■■□□ 2.61
PARL-201ENST00000311101 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.34■■■□□ 2.61
PARL-201ENST00000311101 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.34■■■□□ 2.61
PARL-201ENST00000311101 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.32■■■□□ 2.6
PARL-201ENST00000311101 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.3■■■□□ 2.6
PARL-201ENST00000311101 APLP2Q06481 763 aa31.29■■■□□ 2.6
PARL-201ENST00000311101 ABCA6Q8N139 1617 aa31.28■■■□□ 2.6
PARL-201ENST00000311101 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.27■■■□□ 2.6
PARL-201ENST00000311101 MBD5Q9P267 1494 aa31.25■■■□□ 2.59
PARL-201ENST00000311101 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
PARL-201ENST00000311101 MLECQ14165 292 aa31.22■■■□□ 2.59
PARL-201ENST00000311101 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.21■■■□□ 2.59
PARL-201ENST00000311101 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.21■■■□□ 2.59
PARL-201ENST00000311101 REREQ9P2R6 1566 aa31.2■■■□□ 2.58
PARL-201ENST00000311101 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.18■■■□□ 2.58
PARL-201ENST00000311101 ATP7AQ04656 1500 aa31.18■■■□□ 2.58
PARL-201ENST00000311101 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
PARL-201ENST00000311101 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.16■■■□□ 2.58
PARL-201ENST00000311101 AGLP35573 1532 aa31.11■■■□□ 2.57
PARL-201ENST00000311101 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.11■■■□□ 2.57
PARL-201ENST00000311101 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.1■■■□□ 2.57
PARL-201ENST00000311101 MIA2Q96PC5 1412 aa31.1■■■□□ 2.57
PARL-201ENST00000311101 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.06■■■□□ 2.56
PARL-201ENST00000311101 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.06■■■□□ 2.56
PARL-201ENST00000311101 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.05■■■□□ 2.56
PARL-201ENST00000311101 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
PARL-201ENST00000311101 A2MP01023 1474 aa31.03■■■□□ 2.56
PARL-201ENST00000311101 PLXNC1O60486 1568 aa31.01■■■□□ 2.56
PARL-201ENST00000311101 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.98■■■□□ 2.55
PARL-201ENST00000311101 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.97■■■□□ 2.55
PARL-201ENST00000311101 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.97■■■□□ 2.55
PARL-201ENST00000311101 HSPA2P54652 639 aa30.96■■■□□ 2.55
PARL-201ENST00000311101 TSPY4P0CV99 314 aa30.95■■■□□ 2.55
PARL-201ENST00000311101 TSPY10P0CW01 314 aa30.95■■■□□ 2.55
PARL-201ENST00000311101 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
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PARL-201ENST00000311101 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.9■■■□□ 2.54
PARL-201ENST00000311101 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.89■■■□□ 2.54
PARL-201ENST00000311101 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
PARL-201ENST00000311101 ABCC5O15440 1437 aa30.86■■■□□ 2.53
PARL-201ENST00000311101 C3P01024 1663 aa30.85■■■□□ 2.53
PARL-201ENST00000311101 GGT6Q6P531 493 aa30.84■■■□□ 2.53
PARL-201ENST00000311101 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
PARL-201ENST00000311101 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.82■■■□□ 2.52
PARL-201ENST00000311101 DAPK1P53355 1430 aa30.81■■■□□ 2.52
PARL-201ENST00000311101 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.81■■■□□ 2.52
PARL-201ENST00000311101 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PARL-201ENST00000311101 KIF3BO15066 747 aa30.8■■■□□ 2.52
PARL-201ENST00000311101 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.79■■■□□ 2.52
PARL-201ENST00000311101 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PARL-201ENST00000311101 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PARL-201ENST00000311101 ZMYM3Q14202 1370 aa30.74■■■□□ 2.51
PARL-201ENST00000311101 MROH2AA6NES4 1674 aa30.74■■■□□ 2.51
PARL-201ENST00000311101 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.73■■■□□ 2.51
PARL-201ENST00000311101 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.73■■■□□ 2.51
PARL-201ENST00000311101 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
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