RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296257.9

SENP2-201, Transcript of SUMO specific peptidase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP2, Length 5,717 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP2-201ENST00000296257 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.25■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 MS4A1P11836 297 aa23.24■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 BECN1Q14457 450 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 NEUROD2Q15784 382 aa23.23■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 MORC1Q86VD1 984 aa23.22■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 STK26Q9P289 416 aa23.21■■□□□ 1.31
SENP2-201ENST00000296257 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
SENP2-201ENST00000296257 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SENP2-201ENST00000296257 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.18■■□□□ 1.3
SENP2-201ENST00000296257 CASC1Q6TDU7 716 aa23.17■■□□□ 1.3
SENP2-201ENST00000296257 NPHP1O15259 732 aa23.15■■□□□ 1.3
SENP2-201ENST00000296257 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.14■■□□□ 1.29
SENP2-201ENST00000296257 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SENP2-201ENST00000296257 FOXD1Q16676 465 aa23.11■■□□□ 1.29
SENP2-201ENST00000296257 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SENP2-201ENST00000296257 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.09■■□□□ 1.29
SENP2-201ENST00000296257 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SENP2-201ENST00000296257 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.08■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 UACAQ9BZF9 1416 aa23.07■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 SOX12O15370 315 aa23.07■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 IGF1RP08069 1367 aa23.07■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.04■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 GRIN2BQ13224 1484 aa23.02■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SENP2-201ENST00000296257 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 CCER2I3L3R5 266 aa23.01■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 MRC2Q9UBG0 1479 aa23■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 RALBP1Q15311 655 aa23■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 CHMP4AQ9BY43 222 aa23■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.99■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.98■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SENP2-201ENST00000296257 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.273e-6■■■□□ 19
SENP2-201ENST00000296257 HMGXB3Q12766 1538 aa22.95■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 CFTRP13569 1480 aa22.95■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.94■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.94■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 IFT140Q96RY7 1462 aa22.93■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 CUX1P39880 1505 aa22.92■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 GOLGA2Q08379 1002 aa22.91■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.91■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.91■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.9■■□□□ 1.26
SENP2-201ENST00000296257 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SENP2-201ENST00000296257 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
SENP2-201ENST00000296257 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SENP2-201ENST00000296257 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SENP2-201ENST00000296257 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SENP2-201ENST00000296257 PRDM2Q13029 1718 aa22.84■■□□□ 1.25
SENP2-201ENST00000296257 CFAP44Q96MT7 982 aa22.82■■□□□ 1.24
SENP2-201ENST00000296257 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SENP2-201ENST00000296257 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
SENP2-201ENST00000296257 SYNJ2O15056 1496 aa22.79■■□□□ 1.24
SENP2-201ENST00000296257 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.79■■□□□ 1.24
SENP2-201ENST00000296257 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.78■■□□□ 1.24
SENP2-201ENST00000296257 AMPHP49418 695 aa22.77■■□□□ 1.24
SENP2-201ENST00000296257 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SENP2-201ENST00000296257 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.76■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 KCNJ4P48050 445 aa22.76■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 EVC2Q86UK5 1308 aa22.76■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.75■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 STAC3Q96MF2 364 aa22.75■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.75■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 NESP48681 1621 aa22.75■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.75■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 RGS3P49796 1198 aa22.74■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 FGD1P98174 961 aa22.74■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.73■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 STK31Q9BXU1 1019 aa22.73■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 TOPBP1Q92547 1522 aa22.73■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.72■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 KIF15Q9NS87 1388 aa22.71■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 NLRP13Q86W25 1043 aa22.71■■□□□ 1.23
SENP2-201ENST00000296257 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 KIF21BO75037 1637 aa22.7■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.69■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.68■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 MCCP23508 829 aa22.68■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.68■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SENP2-201ENST00000296257 COG3Q96JB2 828 aa22.66■■□□□ 1.22
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