RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 ABCC5O15440 1437 aa27.39■■□□□ 1.98
USP21-201ENST00000289865 ROCK1Q13464 1354 aa27.38■■□□□ 1.97
USP21-201ENST00000289865 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.38■■□□□ 1.97
USP21-201ENST00000289865 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.34■■□□□ 1.97
USP21-201ENST00000289865 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.33■■□□□ 1.97
USP21-201ENST00000289865 KIF14Q15058 1648 aa27.33■■□□□ 1.96
USP21-201ENST00000289865 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.33■■□□□ 1.96
USP21-201ENST00000289865 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.3■■□□□ 1.96
USP21-201ENST00000289865 KCNH8Q96L42 1107 aa27.29■■□□□ 1.96
USP21-201ENST00000289865 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
USP21-201ENST00000289865 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
USP21-201ENST00000289865 ABCA8O94911 1581 aa27.26■■□□□ 1.95
USP21-201ENST00000289865 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
USP21-201ENST00000289865 FOXD1Q16676 465 aa27.24■■□□□ 1.95
USP21-201ENST00000289865 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.21■■□□□ 1.95
USP21-201ENST00000289865 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
USP21-201ENST00000289865 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.19■■□□□ 1.94
USP21-201ENST00000289865 ATP10BO94823 1461 aa27.17■■□□□ 1.94
USP21-201ENST00000289865 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.16■■□□□ 1.94
USP21-201ENST00000289865 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.16■■□□□ 1.94
USP21-201ENST00000289865 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.15■■□□□ 1.94
USP21-201ENST00000289865 NCOA1Q15788 1441 aa27.15■■□□□ 1.94
USP21-201ENST00000289865 ANP32CO43423 234 aa27.15■■□□□ 1.94
USP21-201ENST00000289865 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.14■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 ADGRL2O95490 1459 aa27.12■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.11■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 CHD1O14646 1710 aa27.09■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 PZPP20742 1482 aa27.09■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 CCER2I3L3R5 266 aa27.08■■□□□ 1.93
USP21-201ENST00000289865 PTPRGP23470 1445 aa27.07■■□□□ 1.92
USP21-201ENST00000289865 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.06■■□□□ 1.92
USP21-201ENST00000289865 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.05■■□□□ 1.92
USP21-201ENST00000289865 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
USP21-201ENST00000289865 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27■■□□□ 1.91
USP21-201ENST00000289865 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.99■■□□□ 1.91
USP21-201ENST00000289865 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.98■■□□□ 1.91
USP21-201ENST00000289865 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.98■■□□□ 1.91
USP21-201ENST00000289865 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.97■■□□□ 1.91
USP21-201ENST00000289865 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
USP21-201ENST00000289865 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.96■■□□□ 1.91
USP21-201ENST00000289865 SHROOM2Q13796 1616 aa26.94■■□□□ 1.9
USP21-201ENST00000289865 PKD2Q13563 968 aa26.91■■□□□ 1.9
USP21-201ENST00000289865 TSPY4P0CV99 314 aa26.9■■□□□ 1.9
USP21-201ENST00000289865 TSPY10P0CW01 314 aa26.9■■□□□ 1.9
USP21-201ENST00000289865 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.9■■□□□ 1.9
USP21-201ENST00000289865 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.89■■□□□ 1.9
USP21-201ENST00000289865 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
USP21-201ENST00000289865 PREX2Q70Z35 1606 aa26.89■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.86■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 MBD5Q9P267 1494 aa26.86■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 NUP155O75694 1391 aa26.85■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.84■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 KIF15Q9NS87 1388 aa26.84■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.84■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 CCDC7Q96M83 1385 aa26.84■■□□□ 1.89
USP21-201ENST00000289865 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.82■■□□□ 1.88
USP21-201ENST00000289865 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.81■■□□□ 1.88
USP21-201ENST00000289865 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.81■■□□□ 1.88
USP21-201ENST00000289865 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.8■■□□□ 1.88
USP21-201ENST00000289865 ABCC2Q92887 1545 aa26.78■■□□□ 1.88
USP21-201ENST00000289865 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
USP21-201ENST00000289865 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.872e-6■□□□□ 8.3
USP21-201ENST00000289865 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.75■■□□□ 1.87
USP21-201ENST00000289865 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.75■■□□□ 1.87
USP21-201ENST00000289865 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
USP21-201ENST00000289865 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.73■■□□□ 1.87
USP21-201ENST00000289865 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.72■■□□□ 1.87
USP21-201ENST00000289865 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.71■■□□□ 1.87
USP21-201ENST00000289865 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.67■■□□□ 1.86
USP21-201ENST00000289865 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.67■■□□□ 1.86
USP21-201ENST00000289865 USP47Q96K76 1375 aa26.66■■□□□ 1.86
USP21-201ENST00000289865 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.66■■□□□ 1.86
USP21-201ENST00000289865 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.65■■□□□ 1.86
USP21-201ENST00000289865 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.65■■□□□ 1.86
USP21-201ENST00000289865 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 KDM5CP41229 1560 aa26.64■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 FKBP8Q14318 412 aa26.63■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.62■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.62■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.61■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 CCDC184Q52MB2 194 aa26.59■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 UNC13BO14795 1591 aa26.59■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 PLXNC1O60486 1568 aa26.58■■□□□ 1.85
USP21-201ENST00000289865 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.57■■□□□ 1.84
USP21-201ENST00000289865 NEFLP07196 543 aa26.57■■□□□ 1.84
USP21-201ENST00000289865 BCANQ96GW7 911 aa26.57■■□□□ 1.84
USP21-201ENST00000289865 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.56■■□□□ 1.84
USP21-201ENST00000289865 PLCH2O75038 1416 aa26.53■■□□□ 1.84
USP21-201ENST00000289865 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.53■■□□□ 1.84
USP21-201ENST00000289865 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.53■■□□□ 1.84
USP21-201ENST00000289865 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.52■■□□□ 1.84
USP21-201ENST00000289865 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 15
USP21-201ENST00000289865 MRS2Q9HD23 443 aa26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 281.9 ms