RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285046.9

FGD5-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD5, Length 5,720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD5-201ENST00000285046 CFAP44Q96MT7 982 aa22.21■■□□□ 1.15
FGD5-201ENST00000285046 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.19■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 RALBP1Q15311 655 aa22.19■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 HSCBQ8IWL3 235 aa22.16■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 NUP155O75694 1391 aa22.16■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.16■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 KCNJ4P48050 445 aa22.15■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 FGD1P98174 961 aa22.15■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 GGT6Q6P531 493 aa22.14■■□□□ 1.14
FGD5-201ENST00000285046 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 MCCP23508 829 aa22.12■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 MLECQ14165 292 aa22.12■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 FOXD1Q16676 465 aa22.12■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.12■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.1■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.1■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
FGD5-201ENST00000285046 NPHP1O15259 732 aa22.08■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 STK26Q9P289 416 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.06■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 SOX12O15370 315 aa22.04■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 WIZO95785 1651 aa22.04■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 GOLGA2Q08379 1002 aa22.03■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.03■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 NRDCO43847 1150 aa22.03■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 PLCB2Q00722 1185 aa22.02■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.02■■□□□ 1.12
FGD5-201ENST00000285046 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.01■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.98■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.97■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FGD5-201ENST00000285046 KIF3BO15066 747 aa21.94■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.94■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 PTMSP20962 102 aa21.94■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 NLRP13Q86W25 1043 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 PDE3BQ13370 1112 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.92■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.91■■□□□ 1.1
FGD5-201ENST00000285046 GBP4Q96PP9 640 aa21.87■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.87■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 KIF15Q9NS87 1388 aa21.86■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 STK31Q9BXU1 1019 aa21.86■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.85■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.85■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 APBB1O00213 710 aa21.84■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.84■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.84■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 SMARCA4P51532 1647 aa21.84■■□□□ 1.09
FGD5-201ENST00000285046 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.82■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.81■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 JPH4Q96JJ6 628 aa21.81■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 HMMRO75330 724 aa21.81■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.81■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 UACAQ9BZF9 1416 aa21.81■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 EID1Q9Y6B2 187 aa21.79■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 GPATCH3Q96I76 525 aa21.77■■□□□ 1.08
FGD5-201ENST00000285046 DRC7Q8IY82 874 aa21.76■■□□□ 1.07
FGD5-201ENST00000285046 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.74■■□□□ 1.07
FGD5-201ENST00000285046 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.74■■□□□ 1.07
FGD5-201ENST00000285046 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
FGD5-201ENST00000285046 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
FGD5-201ENST00000285046 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
FGD5-201ENST00000285046 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.7■■□□□ 1.06
FGD5-201ENST00000285046 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
FGD5-201ENST00000285046 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
FGD5-201ENST00000285046 AMPHP49418 695 aa21.68■■□□□ 1.06
FGD5-201ENST00000285046 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.68■■□□□ 1.06
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