RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 CUX2O14529 1486 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTPRO-201ENST00000281171 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
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PTPRO-201ENST00000281171 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.84■□□□□ 0.45
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PTPRO-201ENST00000281171 MORC1Q86VD1 984 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRO-201ENST00000281171 CHMP5Q9NZZ3 219 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRO-201ENST00000281171 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRO-201ENST00000281171 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRO-201ENST00000281171 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRO-201ENST00000281171 TPM4P67936 248 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRO-201ENST00000281171 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRO-201ENST00000281171 NUP155O75694 1391 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRO-201ENST00000281171 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRO-201ENST00000281171 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
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