RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272421.10

ANKRD53-201, Transcript of ankyrin repeat domain 53, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD53, Length 2,185 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53-201ENST00000272421 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
ANKRD53-201ENST00000272421 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
ANKRD53-201ENST00000272421 TRIM52Q96A61 297 aa34.23■■■■□ 3.07
ANKRD53-201ENST00000272421 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.22■■■■□ 3.07
ANKRD53-201ENST00000272421 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.21■■■■□ 3.07
ANKRD53-201ENST00000272421 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.21■■■■□ 3.07
ANKRD53-201ENST00000272421 NUP160Q12769 1436 aa34.2■■■■□ 3.07
ANKRD53-201ENST00000272421 ANP32CO43423 234 aa34.16■■■■□ 3.06
ANKRD53-201ENST00000272421 FBLN2P98095 1184 aa34.16■■■■□ 3.06
ANKRD53-201ENST00000272421 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.15■■■■□ 3.06
ANKRD53-201ENST00000272421 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
ANKRD53-201ENST00000272421 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.12■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 FKBP8Q14318 412 aa34.12■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.11■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.11■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 BCANQ96GW7 911 aa34.09■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 KIF14Q15058 1648 aa34.09■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.08■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.07■■■■□ 3.05
ANKRD53-201ENST00000272421 JPH4Q96JJ6 628 aa34.04■■■■□ 3.04
ANKRD53-201ENST00000272421 ADGRL2O95490 1459 aa34.03■■■■□ 3.04
ANKRD53-201ENST00000272421 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.02■■■■□ 3.04
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCA8O94911 1581 aa34.02■■■■□ 3.04
ANKRD53-201ENST00000272421 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
ANKRD53-201ENST00000272421 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.99■■■■□ 3.03
ANKRD53-201ENST00000272421 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
ANKRD53-201ENST00000272421 NCOA1Q15788 1441 aa33.97■■■■□ 3.03
ANKRD53-201ENST00000272421 ANP32EQ9BTT0 268 aa33.97■■■■□ 3.03
ANKRD53-201ENST00000272421 FOXD1Q16676 465 aa33.96■■■■□ 3.03
ANKRD53-201ENST00000272421 PZPP20742 1482 aa33.96■■■■□ 3.03
ANKRD53-201ENST00000272421 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.94■■■■□ 3.02
ANKRD53-201ENST00000272421 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.94■■■■□ 3.02
ANKRD53-201ENST00000272421 NEFLP07196 543 aa33.93■■■■□ 3.02
ANKRD53-201ENST00000272421 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.91■■■■□ 3.02
ANKRD53-201ENST00000272421 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.88■■■■□ 3.01
ANKRD53-201ENST00000272421 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.85■■■■□ 3.01
ANKRD53-201ENST00000272421 ATP10BO94823 1461 aa33.84■■■■□ 3.01
ANKRD53-201ENST00000272421 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.83■■■■□ 3.01
ANKRD53-201ENST00000272421 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.82■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.79■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.79■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 MBD5Q9P267 1494 aa33.78■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 CHD1O14646 1710 aa33.77■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.77■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.77■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 CCDC7Q96M83 1385 aa33.76■■■■□ 3
ANKRD53-201ENST00000272421 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
ANKRD53-201ENST00000272421 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.74■■■□□ 2.99
ANKRD53-201ENST00000272421 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.7■■■□□ 2.99
ANKRD53-201ENST00000272421 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.98
ANKRD53-201ENST00000272421 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.69■■■□□ 2.98
ANKRD53-201ENST00000272421 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.69■■■□□ 2.98
ANKRD53-201ENST00000272421 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
ANKRD53-201ENST00000272421 PTPRGP23470 1445 aa33.62■■■□□ 2.97
ANKRD53-201ENST00000272421 PKD2Q13563 968 aa33.6■■■□□ 2.97
ANKRD53-201ENST00000272421 SHROOM2Q13796 1616 aa33.59■■■□□ 2.97
ANKRD53-201ENST00000272421 PREX2Q70Z35 1606 aa33.59■■■□□ 2.97
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ANKRD53-201ENST00000272421 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.56■■■□□ 2.96
ANKRD53-201ENST00000272421 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.55■■■□□ 2.96
ANKRD53-201ENST00000272421 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP33.54■■■□□ 2.96
ANKRD53-201ENST00000272421 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
ANKRD53-201ENST00000272421 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.53■■■□□ 2.96
ANKRD53-201ENST00000272421 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.52■■■□□ 2.96
ANKRD53-201ENST00000272421 NUP155O75694 1391 aa33.52■■■□□ 2.96
ANKRD53-201ENST00000272421 TSPY4P0CV99 314 aa33.51■■■□□ 2.95
ANKRD53-201ENST00000272421 TSPY10P0CW01 314 aa33.51■■■□□ 2.95
ANKRD53-201ENST00000272421 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.5■■■□□ 2.95
ANKRD53-201ENST00000272421 KDM5CP41229 1560 aa33.5■■■□□ 2.95
ANKRD53-201ENST00000272421 KIF15Q9NS87 1388 aa33.5■■■□□ 2.95
ANKRD53-201ENST00000272421 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.46■■■□□ 2.95
ANKRD53-201ENST00000272421 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.46■■■□□ 2.95
ANKRD53-201ENST00000272421 USP47Q96K76 1375 aa33.46■■■□□ 2.95
ANKRD53-201ENST00000272421 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.43■■■□□ 2.94
ANKRD53-201ENST00000272421 CCDC184Q52MB2 194 aa33.42■■■□□ 2.94
ANKRD53-201ENST00000272421 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.42■■■□□ 2.94
ANKRD53-201ENST00000272421 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.39■■■□□ 2.94
ANKRD53-201ENST00000272421 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.39■■■□□ 2.94
ANKRD53-201ENST00000272421 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.38■■■□□ 2.93
ANKRD53-201ENST00000272421 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
ANKRD53-201ENST00000272421 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.36■■■□□ 2.93
ANKRD53-201ENST00000272421 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.35■■■□□ 2.93
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCC2Q92887 1545 aa33.35■■■□□ 2.93
ANKRD53-201ENST00000272421 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
ANKRD53-201ENST00000272421 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.34■■■□□ 2.93
ANKRD53-201ENST00000272421 UNC13BO14795 1591 aa33.33■■■□□ 2.93
ANKRD53-201ENST00000272421 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
ANKRD53-201ENST00000272421 MRS2Q9HD23 443 aa33.31■■■□□ 2.92
ANKRD53-201ENST00000272421 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.3■■■□□ 2.92
ANKRD53-201ENST00000272421 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
ANKRD53-201ENST00000272421 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.3■■■□□ 2.92
ANKRD53-201ENST00000272421 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.3■■■□□ 2.92
ANKRD53-201ENST00000272421 ERICH6BQ5W0A0 696 aa33.29■■■□□ 2.92
ANKRD53-201ENST00000272421 PLXNC1O60486 1568 aa33.29■■■□□ 2.92
ANKRD53-201ENST00000272421 MSH5O43196 834 aa33.27■■■□□ 2.92
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