RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000238558.4

GSC-201, Transcript of goosecoid homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GSC, Length 1,264 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC-201ENST00000238558 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.86■■■■■ 4.29
GSC-201ENST00000238558 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.85■■■■■ 4.29
GSC-201ENST00000238558 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.84■■■■■ 4.29
GSC-201ENST00000238558 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.79■■■■■ 4.28
GSC-201ENST00000238558 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.78■■■■■ 4.28
GSC-201ENST00000238558 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
GSC-201ENST00000238558 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.76■■■■■ 4.28
GSC-201ENST00000238558 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.75■■■■■ 4.27
GSC-201ENST00000238558 PREX2Q70Z35 1606 aa41.75■■■■■ 4.27
GSC-201ENST00000238558 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.68■■■■■ 4.26
GSC-201ENST00000238558 AFAP1Q8N556 730 aa41.68■■■■■ 4.26
GSC-201ENST00000238558 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.68■■■■■ 4.26
GSC-201ENST00000238558 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.67■■■■■ 4.26
GSC-201ENST00000238558 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.67■■■■■ 4.26
GSC-201ENST00000238558 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.66■■■■■ 4.26
GSC-201ENST00000238558 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
GSC-201ENST00000238558 ABCC1P33527 1531 aa41.6■■■■■ 4.25
GSC-201ENST00000238558 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.59■■■■■ 4.25
GSC-201ENST00000238558 KDM5CP41229 1560 aa41.59■■■■■ 4.25
GSC-201ENST00000238558 ATP10AO60312 1499 aa41.57■■■■■ 4.25
GSC-201ENST00000238558 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.56■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.55■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 PTPRMP28827 1452 aa41.54■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.54■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.53■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 MADDQ8WXG6 1647 aa41.52■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.52■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.51■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.51■■■■■ 4.24
GSC-201ENST00000238558 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
GSC-201ENST00000238558 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.5■■■■■ 4.23
GSC-201ENST00000238558 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.48■■■■■ 4.23
GSC-201ENST00000238558 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.48■■■■■ 4.23
GSC-201ENST00000238558 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.47■■■■■ 4.23
GSC-201ENST00000238558 MLECQ14165 292 aa41.44■■■■■ 4.22
GSC-201ENST00000238558 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.4■■■■■ 4.22
GSC-201ENST00000238558 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.4■■■■■ 4.22
GSC-201ENST00000238558 TIAM1Q13009 1591 aa41.4■■■■■ 4.22
GSC-201ENST00000238558 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.4■■■■■ 4.22
GSC-201ENST00000238558 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
GSC-201ENST00000238558 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.37■■■■■ 4.21
GSC-201ENST00000238558 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.36■■■■■ 4.21
GSC-201ENST00000238558 ABCA6Q8N139 1617 aa41.36■■■■■ 4.21
GSC-201ENST00000238558 NCOA2Q15596 1464 aa41.31■■■■■ 4.2
GSC-201ENST00000238558 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.31■■■■■ 4.2
GSC-201ENST00000238558 REREQ9P2R6 1566 aa41.3■■■■■ 4.2
GSC-201ENST00000238558 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
GSC-201ENST00000238558 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
GSC-201ENST00000238558 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
GSC-201ENST00000238558 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.25■■■■■ 4.19
GSC-201ENST00000238558 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.25■■■■■ 4.19
GSC-201ENST00000238558 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.22■■■■■ 4.19
GSC-201ENST00000238558 MAP3K1Q13233 1512 aa41.21■■■■■ 4.19
GSC-201ENST00000238558 AGLP35573 1532 aa41.19■■■■■ 4.18
GSC-201ENST00000238558 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
GSC-201ENST00000238558 MBD5Q9P267 1494 aa41.17■■■■■ 4.18
GSC-201ENST00000238558 ATP7AQ04656 1500 aa41.15■■■■■ 4.18
GSC-201ENST00000238558 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
GSC-201ENST00000238558 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.08■■■■■ 4.17
GSC-201ENST00000238558 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.06■■■■■ 4.16
GSC-201ENST00000238558 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
GSC-201ENST00000238558 A2MP01023 1474 aa41.02■■■■■ 4.16
GSC-201ENST00000238558 APLP2Q06481 763 aa41.01■■■■■ 4.16
GSC-201ENST00000238558 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.99■■■■■ 4.15
GSC-201ENST00000238558 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.99■■■■■ 4.15
GSC-201ENST00000238558 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.98■■■■■ 4.15
GSC-201ENST00000238558 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
GSC-201ENST00000238558 PLXNC1O60486 1568 aa40.97■■■■■ 4.15
GSC-201ENST00000238558 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.91■■■■■ 4.14
GSC-201ENST00000238558 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.91■■■■■ 4.14
GSC-201ENST00000238558 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.89■■■■■ 4.14
GSC-201ENST00000238558 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.89■■■■■ 4.14
GSC-201ENST00000238558 HSPA2P54652 639 aa40.88■■■■■ 4.13
GSC-201ENST00000238558 MIA2Q96PC5 1412 aa40.87■■■■■ 4.13
GSC-201ENST00000238558 C3P01024 1663 aa40.85■■■■■ 4.13
GSC-201ENST00000238558 TSPY4P0CV99 314 aa40.84■■■■■ 4.13
GSC-201ENST00000238558 TSPY10P0CW01 314 aa40.84■■■■■ 4.13
GSC-201ENST00000238558 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
GSC-201ENST00000238558 GGT6Q6P531 493 aa40.82■■■■■ 4.13
GSC-201ENST00000238558 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
GSC-201ENST00000238558 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.79■■■■■ 4.12
GSC-201ENST00000238558 ZMYM3Q14202 1370 aa40.74■■■■■ 4.11
GSC-201ENST00000238558 MROH2AA6NES4 1674 aa40.73■■■■■ 4.11
GSC-201ENST00000238558 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.72■■■■■ 4.11
GSC-201ENST00000238558 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.72■■■■■ 4.11
GSC-201ENST00000238558 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
GSC-201ENST00000238558 KIF3BO15066 747 aa40.69■■■■■ 4.1
GSC-201ENST00000238558 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.68■■■■■ 4.1
GSC-201ENST00000238558 NPATQ14207 1427 aa40.63■■■■■ 4.09
GSC-201ENST00000238558 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.63■■■■■ 4.09
GSC-201ENST00000238558 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.61■■■■■ 4.09
GSC-201ENST00000238558 ABCC5O15440 1437 aa40.56■■■■■ 4.08
GSC-201ENST00000238558 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
GSC-201ENST00000238558 PTPRKQ15262 1439 aa40.54■■■■■ 4.08
GSC-201ENST00000238558 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
GSC-201ENST00000238558 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.49■■■■■ 4.07
GSC-201ENST00000238558 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.48■■■■■ 4.07
GSC-201ENST00000238558 DAPK1P53355 1430 aa40.48■■■■■ 4.07
GSC-201ENST00000238558 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.9 ms