RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227756.4

GALNT18-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT18, Length 2,504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18-201ENST00000227756 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 KIF14Q15058 1648 aa24.12■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 ROCK1Q13464 1354 aa24.11■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 ABCA8O94911 1581 aa24.11■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
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GALNT18-201ENST00000227756 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.09■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.08■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.08■■□□□ 1.45
GALNT18-201ENST00000227756 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.08■■□□□ 1.44
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GALNT18-201ENST00000227756 ATP10BO94823 1461 aa24.07■■□□□ 1.44
GALNT18-201ENST00000227756 CHD1O14646 1710 aa24.05■■□□□ 1.44
GALNT18-201ENST00000227756 PTPRGP23470 1445 aa24.04■■□□□ 1.44
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GALNT18-201ENST00000227756 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.98■■□□□ 1.43
GALNT18-201ENST00000227756 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.95■■□□□ 1.43
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GALNT18-201ENST00000227756 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.95■■□□□ 1.42
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GALNT18-201ENST00000227756 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.92■■□□□ 1.42
GALNT18-201ENST00000227756 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.9■■□□□ 1.42
GALNT18-201ENST00000227756 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.9■■□□□ 1.42
GALNT18-201ENST00000227756 ADGRL2O95490 1459 aa23.89■■□□□ 1.42
GALNT18-201ENST00000227756 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.89■■□□□ 1.41
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GALNT18-201ENST00000227756 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.88■■□□□ 1.41
GALNT18-201ENST00000227756 KCNH8Q96L42 1107 aa23.84■■□□□ 1.41
GALNT18-201ENST00000227756 PZPP20742 1482 aa23.84■■□□□ 1.41
GALNT18-201ENST00000227756 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.83■■□□□ 1.41
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GALNT18-201ENST00000227756 TSPY10P0CW01 314 aa23.81■■□□□ 1.4
GALNT18-201ENST00000227756 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.81■■□□□ 1.4
GALNT18-201ENST00000227756 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.79■■□□□ 1.4
GALNT18-201ENST00000227756 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
GALNT18-201ENST00000227756 ANP32CO43423 234 aa23.75■■□□□ 1.39
GALNT18-201ENST00000227756 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.74■■□□□ 1.39
GALNT18-201ENST00000227756 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
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GALNT18-201ENST00000227756 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.74■■□□□ 1.39
GALNT18-201ENST00000227756 ABCC2Q92887 1545 aa23.74■■□□□ 1.39
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GALNT18-201ENST00000227756 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.73■■□□□ 1.39
GALNT18-201ENST00000227756 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.72■■□□□ 1.39
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GALNT18-201ENST00000227756 NUP155O75694 1391 aa23.7■■□□□ 1.38
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GALNT18-201ENST00000227756 CCER2I3L3R5 266 aa23.66■■□□□ 1.38
GALNT18-201ENST00000227756 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.62■■□□□ 1.37
GALNT18-201ENST00000227756 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.59■■□□□ 1.37
GALNT18-201ENST00000227756 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.59■■□□□ 1.37
GALNT18-201ENST00000227756 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
GALNT18-201ENST00000227756 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.57■■□□□ 1.36
GALNT18-201ENST00000227756 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
GALNT18-201ENST00000227756 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GALNT18-201ENST00000227756 MYT1Q01538 1121 aa23.55■■□□□ 1.36
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GALNT18-201ENST00000227756 CCDC7Q96M83 1385 aa23.53■■□□□ 1.36
GALNT18-201ENST00000227756 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.52■■□□□ 1.36
GALNT18-201ENST00000227756 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.52■■□□□ 1.36
GALNT18-201ENST00000227756 PLCH2O75038 1416 aa23.51■■□□□ 1.35
GALNT18-201ENST00000227756 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.5■■□□□ 1.35
GALNT18-201ENST00000227756 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.49■■□□□ 1.35
GALNT18-201ENST00000227756 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.49■■□□□ 1.35
GALNT18-201ENST00000227756 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.48■■□□□ 1.35
GALNT18-201ENST00000227756 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
GALNT18-201ENST00000227756 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.44■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 PLXNC1O60486 1568 aa23.43■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.43■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 USP47Q96K76 1375 aa23.43■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.42■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 UNC13BO14795 1591 aa23.41■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.4■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.39■■□□□ 1.34
GALNT18-201ENST00000227756 ABCC1P33527 1531 aa23.39■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.39■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.37■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.36■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.36■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 KDM5CP41229 1560 aa23.34■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.34■■□□□ 1.33
GALNT18-201ENST00000227756 ERBINQ96RT1 1412 aa23.34■■□□□ 1.33
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