RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.03■■■□□ 2.24
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STRADB-201ENST00000194530 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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STRADB-201ENST00000194530 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.58■■■□□ 2.17
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STRADB-201ENST00000194530 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.5■■■□□ 2.15
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STRADB-201ENST00000194530 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.44■■■□□ 2.14
STRADB-201ENST00000194530 KDM5CP41229 1560 aa28.44■■■□□ 2.14
STRADB-201ENST00000194530 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.43■■■□□ 2.14
STRADB-201ENST00000194530 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
STRADB-201ENST00000194530 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.42■■■□□ 2.14
STRADB-201ENST00000194530 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.42■■■□□ 2.14
STRADB-201ENST00000194530 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
STRADB-201ENST00000194530 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
STRADB-201ENST00000194530 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.37■■■□□ 2.13
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STRADB-201ENST00000194530 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.36■■■□□ 2.13
STRADB-201ENST00000194530 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.34■■■□□ 2.13
STRADB-201ENST00000194530 PREX2Q70Z35 1606 aa28.34■■■□□ 2.13
STRADB-201ENST00000194530 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.33■■■□□ 2.13
STRADB-201ENST00000194530 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.32■■■□□ 2.12
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STRADB-201ENST00000194530 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.27■■■□□ 2.12
STRADB-201ENST00000194530 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.27■■■□□ 2.12
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STRADB-201ENST00000194530 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.22■■■□□ 2.11
STRADB-201ENST00000194530 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
STRADB-201ENST00000194530 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.19■■■□□ 2.1
STRADB-201ENST00000194530 CHD1O14646 1710 aa28.19■■■□□ 2.1
STRADB-201ENST00000194530 SHROOM2Q13796 1616 aa28.19■■■□□ 2.1
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