RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000180046.7

Usp34-208, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Usp34, Length 12,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Skida1	Q80YR3	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Themis2	Q91YX0	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Rb1cc1	Q9ESK9	1588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ccer2	J3QPU5	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Adnp	Q9Z103	1108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Slc24a3	Q99PD7	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Bank1	Q80VH0	783 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Zbtb12	Q9Z150	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Acin1	Q9JIX8	1338 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ppp1r18	Q8BQ30	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Map7d2	A2AG50	781 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Kdm4a	Q8BW72	1064 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Wdhd1	P59328	1117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ssr1	Q9CY50	286 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Wwc1	Q5SXA9	1104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Npm1	Q61937	292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Dmrt2	Q8BG36	561 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Fam193a	Q8CGI1	1231 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ctage5	Q8R311	779 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	4930519G04Rik	Q9CPT7	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Set	Q9EQU5	289 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Hdgfl1	Q2VPR5	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	L1td1	Q587J6	782 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Zcwpw1	Q6IR42	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ggt6	Q6PDE7	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Lmod2	Q3UHZ5	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Phf23	Q8BSN5	401 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Trerf1	Q8BXJ2	1205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Fkbp15	Q6P9Q6	1216 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Nap1l1	P28656	391 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Zbtb38	Q3LR78	1197 aa		4.84	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Pde4c	Q3UEI1	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Rbm26	Q6NZN0	1012 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Fbxo2	Q80UW2	297 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	1700122O11Rik	J3QPW6	241 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Rbm27	Q5SFM8	1060 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Tmed8	Q3UHI4	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Stk3	Q9JI10	497 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Tmco4	Q91WU4	631 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Brd4	Q9ESU6	1400 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Mrs2	Q5NCE8	434 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ercc6	F8VPZ5	1481 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	AU015836	B2RUM3	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Mtmr7	Q9Z2C9	660 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Mfap1a	C0HKD8	439 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Mfap1b	C0HKD9	439 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Armcx1	Q9CX83	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Rrp9	Q91WM3	475 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Fam43b	A2AM80	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Srpk2	O54781	681 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ftsj3	Q9DBE9	838 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Nbr1	P97432	988 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Dmtn	Q9WV69	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Klhl34	A2AI76	644 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	R3hcc1	Q8BSI6	488 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Frmd4b	Q920B0	1035 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Abcc8	B2RUS7	1588 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Znhit6	Q3UFB2	460 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Rsph6a	Q8CDR2	708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ccdc146	E9Q9F7	977 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Hs6st3	Q9QYK4	470 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ccdc27	Q3V036	639 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ipo4	Q8VI75	1082 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Mrvi1	Q9WUX5	899 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Wdr78	E9PYY5	807 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ccdc173	A0JLY1	547 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Pabpn1	Q8CCS6	302 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Chga	P26339	463 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ccar1	Q8CH18	1146 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Tnnt1	O88346	262 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Erich2	E9Q1A6	463 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Crebrf	Q8CDG5	640 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Zrsr2	Q62377	462 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Dzip1	Q8BMD2	852 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Sox12	Q04890	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Cc2d1a	Q8K1A6	943 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Adam1b	Q8R534	806 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Smarca5	Q91ZW3	1051 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Cluap1	Q8R3P7	413 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Chmp3	Q9CQ10	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Il27	Q8K3I6	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Aamp	J3QN89	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Slc7a3	P70423	618 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Tomm22	Q9CPQ3	142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ca8	P28651	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Dnai2	A2AC93	623 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Riok3	Q9DBU3	519 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Senp3	Q9EP97	568 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Polr3g	Q6NXY9	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Nap1l4	Q78ZA7	375 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Kiaa0754	Q69ZZ9	979 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Kif11	Q6P9P6	1052 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Nacad	Q5SWP3	1504 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Anapc15-ps	A0A140T8L6	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Vgf	Q0VGU4	617 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ccer1	Q9CQL2	403 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Ak7	Q9D2H2	614 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Tonsl	Q6NZL6	1363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Suds3	Q8BR65	328 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Usp34-208	ENSMUST00000180046	Stag3	O70576	1240 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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