RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000159616.1

Lrrtm1-202, Transcript of Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lrrtm1, Length 2,541 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Bcl11aQ9QYE3 773 aa22.96■■□□□ 1.27
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa22.95■■□□□ 1.26
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ift140E9PY46 1464 aa22.93■■□□□ 1.26
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Pkd2O35245 966 aa22.92■■□□□ 1.26
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cabp1Q9JLK7 227 aa22.9■■□□□ 1.26
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa22.89■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.88■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Abcc5Q9R1X5 1436 aa22.87■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Exoc6Q8R313 802 aa22.87■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.87■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Plekhh2Q8C115 1491 aa22.84■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Pik3c2gO70167 1506 aa22.84■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Zfp644E9QA22 1323 aa22.84■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Disp1Q3TDN0 1521 aa22.84■■□□□ 1.25
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Adamts12Q811B3 1600 aa22.82■■□□□ 1.24
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Soga1E1U8D0 1418 aa22.81■■□□□ 1.24
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 WizO88286 1684 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Grin2aP35436 1464 aa22.79■■□□□ 1.24
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 P3h3Q8CG70 732 aa22.76■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kif21bQ9QXL1 1668 aa22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Plekhg5Q66T02 1073 aa22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ncoa3O09000 1398 aa22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Liat1Q810M6 228 aa22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 SphkapQ6NSW3 1687 aa22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Mtus2Q3UHD3 1353 aa22.72■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Il16O54824 1322 aa22.72■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa22.71■■□□□ 1.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa22.7■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.7■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Mbd5B1AYB6 1498 aa22.69■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 AlkP97793 1621 aa22.67■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Pak3Q61036 559 aa22.67■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Dapk1Q80YE7 1442 aa22.67■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 PxdnQ3UQ28 1475 aa22.67■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 WrnO09053 1401 aa22.66■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa22.66■■□□□ 1.22
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ofd1Q80Z25 1017 aa22.64■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Adcy10Q8C0T9 1614 aa22.63■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa22.63■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Myom3A2ABU4 1439 aa22.62■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Naip6Q9JIB6 1403 aa22.62■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Map3k4O08648 1597 aa22.61■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa22.6■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Mug2P28666 1451 aa22.6■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rundc1Q0VDN7 615 aa22.6■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rgl3Q3UYI5 709 aa22.6■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Egfem1Q8C088 590 aa22.59■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Abca16E9PWJ7 1678 aa22.59■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.58■■□□□ 1.21
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Arhgef11Q68FM7 1552 aa22.58■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa22.56■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Setd1bQ8CFT2 1985 aa22.55■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 L3mbtl2P59178 703 aa22.55■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Card11Q8CIS0 1159 aa22.54■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ttll5Q8CHB8 1328 aa22.54■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Mrc2Q64449 1479 aa22.53■■□□□ 1.2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Wdr7Q920I9 1489 aa22.5■■□□□ 1.19
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Trak1Q6PD31 939 aa22.5■■□□□ 1.19
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.49■■□□□ 1.19
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Slc4a3P16283 1227 aa22.49■■□□□ 1.19
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Trpm2Q91YD4 1506 aa22.47■■□□□ 1.19
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rock2P70336 1388 aa22.47■■□□□ 1.19
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa22.47■■□□□ 1.19
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.44■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ipo9Q91YE6 1041 aa22.43■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Arhgap27A2AB59 869 aa22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ccdc27Q3V036 639 aa22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kcnh8P59111 1102 aa22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kank1E9Q238 1360 aa22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa22.41■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Mink1Q9JM52 1308 aa22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Fam163aQ8CAA5 168 aa22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Magi1Q6RHR9 1471 aa22.39■■□□□ 1.17
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Abcc2Q8VI47 1543 aa22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa22.36■■□□□ 1.17
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Polr3aB2RXC6 1390 aa22.36■■□□□ 1.17
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Erbb3Q61526 1339 aa22.36■■□□□ 1.17
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Asxl1P59598 1514 aa22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Tdrd9Q14BI7 1383 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms